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秦萌: 作品数：41 被引量：255H指数：9; 供职机构：北京市丰台区疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：国家科技重大专项北京市科技计划项目艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

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2014年北京市丰台区麻疹病毒野毒株基因特征被引量：2: 2016年; 目的了解2014年北京市丰台区流行的麻疹野毒株的优势基因型别及特征,为进一步的麻疹防治策略提供科学依据。方法采集2014年北京市丰台辖区内疑似麻疹暴发和散发患者咽拭子标本,使用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒。通过逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）从分离到的麻疹病毒中扩增出核蛋白（nucleoprotein,N）基因C末端676个核苷酸片段,再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以C末端450个核苷酸片段构建基因亲缘关系树,进行核苷酸、氨基酸同源性分析。结果共分离到38株麻疹病毒,均为H1a基因型。38株麻疹病毒野毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~100%、96.6%~100%;同源性最高的为H1a参考株Chin9322,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~99.1%、96.6%~99.3%;与2013年Beijing株（KJ556889/KJ556890/KJ556891）核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%~99.7%、97.3%~100%。结论 2014年北京市丰台区内流行的麻疹病毒野毒株优势基因型别为H1a型。; 余红秦萌尉秀霞邢洪光董晓根李洁; 关键词：麻疹病毒 N基因基因型

沙门菌玻片凝集血清分型与多重荧光PCR血清分型检测试剂盒方法比较被引量：7: 2020年; 目的探讨在肠道多病原监测中,沙门菌多重荧光PCR血清分型检测试剂盒的适用性,扩展沙门菌的分子分型和鉴定方法,提高分型效率,以更快更好地应对由沙门菌引起的腹泻事件。方法利用沙门菌多重荧光PCR血清分型检测试剂盒和传统玻片凝集血清分型方法,对2013—2018年北京市丰台区肠道多病原监测中分离获得的95株沙门菌进行分型分析,比较2种结果的符合程度。结果采用传统玻片凝集法,95株沙门菌被分为21种血清型。采用多重荧光PCR血清分型检测试剂盒,85株沙门菌被分为17种型别,10株菌无法分型,包含Salmonella Goldcoast、S.London、S.Senftenberg、S.Thompson、S.Panama、S.Othmarsche 6种血清型。在试剂盒成功分型的85株菌中,83株菌的分型结果与玻片凝集法一致,符合率为97.65%。结论在沙门菌分型中,玻片凝集法应用良好,多重荧光PCR血清分型检测试剂盒与前者分型结果一致性高,检测效率显著提升,对不常见血清型的鉴定有待扩充,2种方法联合使用可全面提高实验室对沙门菌的分型检测效率和准确率。; 董晓根颜涛石婧秦萌封会茹余红王兆娥张志敏信振江; 关键词：沙门菌血清分型

北京市丰台区诺如病毒暴发疫情的实验室鉴定及基因特征分析被引量：9: 2015年; 目的对北京市丰台区2014年5 6月发生的3起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情进行病原体鉴定及基因分型。方法采用实时荧光定量-聚合酶链反应法对62份病例标本进行诺如病毒核酸检测,阳性标本经反转录-聚合酶链反应扩增RNA多聚酶区部分序列,使用Bio Edit及Mega 6.0软件对扩增序列进行同源性及进化分析。结果 36份标本中检出GⅡ型诺如病毒,阳性率为58.06%;序列分析表明幼儿园为GⅡ.7型,学校1为GⅡ.8型,学校2为GⅡ.6型。结论诺如病毒是引起丰台区急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体,丰台区流行的诺如病毒基因型存在多样性。; 秦萌陆翌禹封会茹杨军勇武庆瑞余红王兆娥董晓根李洁; 关键词：诺如病毒荧光定量-聚合酶链反应进化分析基因分型

新型多重PCR方法及其在呼吸道病毒诊断上的应用被引量：13: 2013年; 急性呼吸道感染广泛分布于人群中,主要由呼吸道病毒引起,在老年人和婴幼儿中具有较高的发病率和死亡率,给社会带来严重的经济负担。快速、准确检测出病原体对临床早期诊断和指导治疗有重要意义。多重聚合酶链式反应(PCR)技术具有PCR的高灵敏度和快速检测的特点,还能实现多病原的高通量检测。基于多重PCR技术开发的商业化试剂盒能同时检测12种以上的呼吸道病毒,能达到与实时荧光定量PCR(real-time PCR)相当的灵敏度和特异性,为呼吸道病毒的检测与分型提供了新的选择。本文综合了近年来的发展成果,对新型多重PCR方法的原理及其在呼吸道病毒诊断上的应用进行了综述。; 李瑾申红卫秦萌马学军; 关键词：多重PCR 呼吸道病毒

GⅠ.P11-GⅠ.6型诺如病毒分子特征分析: 2023年; 目的分析引起北京市丰台区某小学1起胃肠炎疫情的诺如病毒分型特征,为诺如病毒防控提供参考依据。方法2021年10月在北京市丰台区某小学发生1起胃肠炎疫情,留取粪便标本做便常规检测和便隐血检测,并在便标本中提取核酸,使用荧光定量PCR技术进行诺如病毒核酸检测,采用一步法逆转录PCR扩增特异性核酸片段分析诺如病毒亚型。结果共14例胃肠炎病例,14份粪便标本便常规结果正常,7份便隐血结果阳性,阳性率为50.0%。13份标本检测出诺如病毒阳性,基因型别为GⅠ.P11-GⅠ.6。结论本次疫情检测出的诺如病毒型别引起的胃肠炎便隐血阳性率较高,超过其他文献报道的比率,并发现其在氨基酸水平上聚合酶区和VP1区都发生了关键位点的变异。需持续进行疫情监测和防控工作,以减少该类疫情的发生。; 尹松月信振江秦萌高志勇张建军张玲; 关键词：诺如病毒便隐血型别

北京市丰台区2010-2011年感染性腹泻致病菌监测分析被引量：14: 2012年; 目的了解丰台区感染性腹泻细菌性病原谱和流行特征,为本地区细菌性腹泻防治提供依据。方法收集2010-2011年4-12月丰台区4家哨点医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本675份,按照WS287-2008、WS/T9-1996、GB17012-1997和WS289-2008进行沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、非O1、O139群霍乱弧菌4种常见肠道致病菌的检测,并分析其流行特征。结果从收集到的675份标本中共分离到196株致病菌,阳性率为29.04%。阳性菌中居首位的是副溶血性弧菌,占40.31%(39/196),其次为志贺菌,占18.37%(36/196)。检出的志贺菌以宋内志贺菌为优势血清型。病原菌的检出具有明显的季节性,6-9月份检出率较高。不同年龄组之间检出率差异有统计学意义(P<0.05),性别间检出率差异无统计学意义(P>0.05)。结论丰台区细菌性腹泻病原主要以副溶血性弧菌为主,应有针对性的主动加强监测,尤其是高发季节。; 董晓根耿荣赵伟余红秦萌邢洪光封会茹; 关键词：腹泻致病菌副溶血性弧菌

急性呼吸道感染患者220例非细菌性病原体流行特征分析被引量：3: 2012年; 目的了解2011年3月—2012年2月北京市丰台区急性呼吸道感染非细菌性病原谱构成及其流行特征,为该区呼吸道传染病的预防控制以及临床诊断、治疗提供实验室依据。方法随机采集哨点医院发热门诊就诊的急性呼吸道感染病例咽拭子标本220例,利用多重实时-聚合酶链反应、聚合酶链反应(RT-PCR、PCR)方法进行流行性感冒(流感)病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、肠道病毒、博卡病毒、偏肺病毒、冠状病毒、鼻病毒和腺病毒9种病毒性病原体的检测和支原体检测,并进行统计分析。结果从220份咽拭子标本中共检出125份阳性标本,阳性率为56.82%。其中有6份标本为双重感染,阳性率较高的为流感病毒(65/131,49.62%)、支原体和副流感病毒(均为26/131,19.85%)。其他病原体的检出率均小于5%。不同病原体检出在季节分布上存在差异:流感病毒冬季检出率最高,支原体秋季检出较多,而副流感病毒感染的高峰期发生在夏季,病原体检出率在季节分布上总体呈现冬季(12—2月)较高,夏季较低的特点。不同性别间病原体检出率无统计学差异。发病3 d内采集的标本流感病毒检出率高于3 d后采集的标本,而支原体相反。结论北京市丰台区急性呼吸道感染非细菌性病原体主要为流感病毒、支原体和副流感病毒。在对急性呼吸道感染病例的诊断治疗中应考虑到不同病原体的高发季节。; 董晓根罗明王世斌秦萌封会茹张玲; 关键词：急性呼吸道感染呼吸道病毒支原体

一起因厨师携带副溶血性弧菌引起的食物中毒事件检测与溯源被引量：2: 2019年; 目的查明一起食物中毒事件发生原因。方法采用传统细菌分离鉴定和实时荧光PCR检测相结合的方法对样本进行鉴定,对分离出的副溶血性弧菌进行常规鉴定、血清分型和脉冲场凝胶电泳分型(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分析,图谱用BioNumerics软件分析并绘制聚类分析图,对分离菌株进行分子分型和同源性分析。结果共分离出3株副溶血性弧菌,两株来自病例,一株来自制作凉菜的厨师,血清型均为O3:K6型,经PFGE聚类分析得到2种带型,两名病例菌株带型完全一致,与厨师的菌株带型存在一个条带的差异,为高度相关株。结论推断此次食物中毒是由厨师携带副溶血性弧菌污染凉菜所引起的。; 石婧余红曲梅张晓嫒杨霄星董晓根王兆娥尉秀霞封会茹秦萌李洁; 关键词：食物中毒副溶血性弧菌同源性分析

一起聚集性发热疫情中柯萨奇病毒A组2型的鉴定及基因特征分析被引量：2: 2019年; 肠道病毒(Enterovirus,EV)可以引起包括手足口病的全身各系统的病症,柯萨奇病毒A组2型(Coxsackievirus A2,CV-A2)在世界范围广泛流行。我们对2018年北京市丰台区一起聚集性发热疫情进行病原学鉴定和基因特征分析,为该类疫情的防控提供实验室支持。采集6例病例的咽拭子标本,进行EV实时荧光RTPCR检测,结果显示5份为EV阳性。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,分离到4株EV,通过EV分支分型方法,确定这4株EV为CV-A2。4株CV-A2分离株的VP1区核苷酸序列和VP4区核苷酸序列相似性高达99.5%~100%,基因进化树图分析显示,4株CV-A2与D基因型代表株处于同一分支,与2017年中国天津分离株MG926808核苷酸同源性最高,为99.1%~99.3%。根据以上结果,确定此次聚集性发热疫情是由CV-A2感染引起,且属于在我国流行的D基因型,提示我们在以后的工作应结合流行病学资料,加强对CV-A2的监测。; 尉秀霞杨霄星王兆娥颜涛余红封会茹秦萌石婧董晓根张勇; 关键词：D基因型

一起诺如病毒GⅡ.17引起的成人腹泻病原学基因诊断研究被引量：4: 2016年; 目的针对一起北京市丰台区2014年10月暴发的急性胃肠炎进行病原基因研究,鉴定其病原体,并对其基因分型做进一步分析。方法应用实时荧光定量PCR对疫情中采集的50份样品进行诺如病毒检测,检测后的阳性样本经逆转录RT-PCR扩增,对其产物测序,进行基因数据库比对,应用Mega 5.0软件构建序列进化树分析。结果 50份疫情样品中,诺如病毒阳性18份。阳性样本基因扩增后测序所得序列与基因数据库比对发现,18份阳性样本均为GⅡ.17型,阳性率为36%。结论本次北京市丰台区暴发的急性胃肠炎疫情是由罕见的诺如病毒GⅡ.17引起。; 陆翌禹秦萌董晓根尉秀霞封慧茹汤旭武清锐李洁; 关键词：诺如病毒基因分型

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