罗洁
- 作品数：5 被引量：94H指数：2
- 供职机构：浙江省农业科学院更多>>
- 发文基金：浙江省博士后科研项目择优资助项目中国博士后科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 长豇豆重要性状遗传基础和育种技术研究及品种选育
- 李国景徐沛吴晓花汪宝根黄芸萍黄文斌鲁忠富饶立兵王雪武李小龙刘永华秦德辉王玲平罗洁吴新义
- 中国是长豇豆的主要生产和消费国之一。生产上存在的土壤连作障碍严重、嫩荚食用安全性低和耐贮藏性不理想等问题已严重影响中国长豇豆产业的发展，这与长豇豆遗传学基础研究薄弱，育种理论、育种技术和产业化配套栽培技术研究落后等密切相...
- 关键词：
- 关键词：豇豆品种选育栽培技术
- 荧光定量PCR检测豇豆I型和II型耐旱性的方法以及诊断性基因和引物
- 本发明涉及荧光定量PCR检测豇豆I型和II型耐旱性的方法以及诊断性基因和引物。荧光定量PCR检测豇豆I型和II型耐旱性的方法，该方法被检测的诊断基因的序列如SEQIDNO:1所示；所述的荧光定量PCR引物具有以下的序列：...
- 徐沛李国景吴晓花汪宝根鲁忠富罗洁王莎刘永华
- 文献传递
- 转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用被引量：89
- 2013年
- 新一代测序技术已经广泛应用于转录组的研究(即RNA-seq),其数据几乎涵盖了特定组织和特定时期的所有转录本。由于其高通量和低成本的优势,RNA-seq越来越受到研究者的青睐,特别是在那些缺乏基因组信息的物种上。在此综述中,讨论了RNA-seq的测序策略,包括物种遗传背景的考量,测序平台和数据拼接软件的选择。RNA-seq数据对于SSR和SNP等分子标记的开发是非常有用的,由于这些标记在相关物种中有很高的通用性,因此在比较作图中有其不可替代的优势。
- 李小白向林罗洁胡标林田胜平谢鸣孙崇波
- 关键词：转录组分子标记
- 荧光定量PCR检测豇豆I型和II型耐旱性的方法以及诊断性基因和引物
- 本发明涉及荧光定量PCR检测豇豆I型和II型耐旱性的方法以及诊断性基因和引物。荧光定量PCR检测豇豆I型和II型耐旱性的方法，该方法被检测的诊断基因的序列如SEQIDNO:1所示；所述的荧光定量PCR引物具有以下的序列：...
- 徐沛李国景吴晓花汪宝根鲁忠富罗洁王莎刘永华
- 建兰转录本的微卫星序列和单核苷酸多态性信息分析被引量：8
- 2014年
- 利用建兰转录组数据对其微卫星序列又称简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行搜索,并对其所在序列进行注释,从而为建兰分子标记的开发提供有效信息.利用High-Seq技术对建兰转录组进行深度测序,采取从头拼接策略进行拼接,最后得到了101 423个转录产物,其中含139 385 689bp,平均长度为1 374bp.在这个转录组数据库中一共检测到17 793个SSR和16 676个SNP位点,它们的平均密度分别是1.28个SSRs/10kb和1.20个SNPs/10kb.在这些SSR中,除了单核苷酸重复外,二核苷酸和三核苷酸重复是最主流的类型,分别占了所有SSR的20.46%和21.98%.在SNP中,C和T之间以及A和G之间的替换是最主要的形式,分别占了所有SNP的30.80%和28.81%.另外,对含有SSR和SNP序列注释发现:分别有1 748个SSR和1 932个SNP序列具有直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups,COG)注释;4 994个SSR和4 819个SNP序列具有基因本体论(Gene Ontology,GO)注释;2 107个SSR和2 188个SNP序列具有京都基因与基因组百科(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)注释.这些序列涉及了许多重要的生物功能和代谢途径,预示着这些潜在的标记可能与重要的生物功能有关.这些信息为建兰分子标记的开发和应用奠定了基础.
- 李小白向林罗洁秦德辉孙崇波
- 关键词：建兰功能注释
