范宁
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 供职机构：武汉理工大学理学院统计学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学天文地球更多>>
- 蛋白质Cα原子接触数的数字特征分析被引量：2
- 2010年
- Cα是蛋白质分子中的重要原子,是蛋白质折叠和设计中的重要研究对象。本文根据α-氨基酸和Cα原子的理化特性,引入接触数的概念,从数字特征方面研究蛋白质中Cα原子空间拓扑结构。主要利用结构规律统计与计算机模拟手段,对1653个蛋白质PDB进行了处理分析,对Cα原子数目所占比例、Cα原子平均接触数、接触数变化率进行了讨论。最后以1EXS为例加以说明,其中多于65%的Cα原子间距大于3个原子单位,平均接触数变化率在4-10之间波动较大,且Cα原子分布不均匀。本文是关于生物、统计学科结合的研究,在数字表征、数据挖掘层面上,分析了Cα原子,为人工组合蛋白质提供了数字支持;同时也对氨基酸理化特性指出了以Cα原子为基准的新方向。
- 范宁
- 关键词：蛋白质
- 蛋白质空间结构数字特性统计分析及应用被引量：3
- 2010年
- 研究了蛋白质分子的结构,从RCSB公共数据库中收集蛋白质PDB数据文件,利用统计分析和数据挖掘知识,建立了以蛋白质形心为原点的蛋白质原子空间坐标系,从蛋白质的数字特征入手,讨论了五类蛋白质(肌蛋白、血蛋白、激素、抗体、生物膜)的结构特性及数字特征的分布,其中激素分子相对其他几类蛋白质较小,原子的分布也相对集中;并讨论了20种残基的结构特性,构造出蛋白质数字特征能量函数,其结论有助于蛋白质生物功能开发和蛋白质设计研究.
- 章社生何康范宁晏臻王星
- 关键词：蛋白质氨基酸生物统计
