邓楠
- 作品数:13 被引量:49H指数:6
- 供职机构:中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学经济管理医药卫生更多>>
- 基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘被引量:8
- 2014年
- 应用新一代高通量测序技术(Illumina Solexa),对中麻黄(Ephedra intermedin)同萌期的种子进行转录组测序,数据重头(denovo)组装后,共获得52 007条Unigene序列,总长为25 043 596 bp。COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了64 751个GO功能注释,17 701个COG功能注释以及16 942个KEGG注释,并从KEGG通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段283个,其中包含了查尔酮合酶基因、细胞色素相关基因和花青素还原酶等基因。中麻黄转录组测序工作的完成,极大地扩充了麻黄的基因资源,为麻黄属植物分子系统进化分析、抗性和药用功能基因的发掘与利用、遗传改良等研究奠定基础。
- 邓楠史胜青常二梅刘建锋兰倩江泽平
- 关键词:中麻黄转录组黄酮类化合物高通量测序
- 外源ABA对短期H_2O_2胁迫下侧柏幼苗活性氧代谢及相关基因的影响被引量:4
- 2017年
- [目的]研究外源ABA处理对H_2O_2胁迫下侧柏幼苗活性氧代谢系统的影响,探讨ABA调控侧柏氧化胁迫的可能作用机制。[方法]以侧柏幼苗为试验材料,采用水培方式,研究外施低浓度(0.5μmol·L^(-1))和高浓度(200μmol·L^(-1))ABA对100 mmol·L^(-1)H_2O_2胁迫下侧柏幼苗活性氧代谢的影响。[结果](1)100 mmol·L^(-1)H_2O_2胁迫48 h显著增加了侧柏幼苗叶片过氧化氢(H_2O_2)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)和脯氨酸含量、抗氧化物酶(SOD和CAT)活性,而可溶性蛋白含量降低。(2)相较于高浓度200μmol·L^(-1)ABA,施加0.5μmol·L^(-1)ABA显著减少了H_2O_2胁迫下侧柏幼苗H_2O_2和MDA的积累,进一步提高了侧柏幼苗叶片SOD、POD和CAT活性,同时促进GSH、脯氨酸和可溶性蛋白的合成。(3)100 mmol·L^(-1)H_2O_2胁迫处理48 h,侧柏幼苗叶片活性氧代谢相关基因Cu/Zn-SOD、CAT、GR、APX、MDAR和GST表达水平较对照CK均有显著性提高;正常和H_2O_2胁迫下侧柏幼苗外施0.5μmol·L^(-1)ABA相较于200μmol·L^(-1)更有利于提高侧柏叶片活性氧代谢相关基因Cu/Zn-SOD、CAT、GR、APX、MDAR和GST的表达量。[结论]低浓度0.5μmol·L^(-1)ABA有效地增强抗氧化系统的防御能力,减弱幼苗的氧化胁迫和膜脂过氧化水平,从而降低活性氧对侧柏的伤害。
- 姚侠妹常二梅纪敬岳剑云谢田田邓楠史胜青江泽平
- 关键词:侧柏活性氧代谢基因表达
- 泡泡刺高通量转录组鉴定及其黄酮类代谢途径初步分析被引量:7
- 2016年
- [目的]为了更好的了解泡泡刺黄酮类生物合成途径及其潜在的抗逆作用,[方法]应用高通量RNA-seq测序技术对泡泡刺当年生新叶进行了转录组测序及相关生物信息学分析。[结果]表明:泡泡刺当年生叶中获得了13 013 444 total reads,总核苷酸数为1 171 209 960 bp(1.09 Gb),组装拼接后得到48 921条unigene序列;Nr、SwissProt、COG、GO、KEGG等数据库分析显示,有30 407个Nr注释,19 671个Swissprot注释,9 273个COG功能注释,46 153个GO功能注释,13 654个KEGG注释,并从KEGG通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段186个。[结论]本研究获得了较好的泡泡刺转录组序列信息,并且其中富含黄酮类化合物代谢途径的相关基因,这为其抗逆机制、药用价值的研究及开发利用提供宝贵资源。
- 马婧邓楠褚建民纪敬史胜青江泽平成铁龙
- 关键词:泡泡刺转录组RNA-SEQ黄酮类化合物
- 草麻黄高通量转录组分析及黄酮类代谢途径相关基因的鉴定被引量:6
- 2016年
- 草麻黄(Ephedra sinica Stapf)植物富含黄酮类和生物碱类化合物,具有重要药用价值,并且适应性强,在防风固沙、改善沙漠环境等方面具有重要作用。通过对已测序草麻黄转录组的原始数据进行重新组装、拼接等生物信息学分析,共得到7 947 954个clean reads,13 389条unigene序列。经过Nr,KOGs,GO,KEGG和Swiss-Prot等数据库分析后,获得10 481个Nr注释,4 533个KOG功能注释,7 121个GO功能注释,5 833个KEGG注释,8 039个Swiss-Prot注释,并利用KEGG通路分析技术发掘草麻黄中参与黄酮类化合物代谢途径相关基因,为克隆草麻黄黄酮合成关键基因、黄酮类化合物的生物合成提供重要的遗传资源,同时为其抗逆机制的研究和药用价值开发提供依据。
- 马婧成铁龙孙灿岳邓楠史胜青江泽平
- 关键词:草麻黄转录组高通量测序黄酮类化合物
- 买麻藤引种现状与繁殖技术
- 买麻藤科植物具有特殊的科学研究价值和重要的经济开发价值,分布于亚洲、非洲和南美洲的热带和亚热带地区.该科植物可以入药,果实和叶片可食用,在非洲等地区出口量很大;然而,在引种、驯化及培育方面研究较少,阻碍了该科资源的开发和...
- 常二梅史胜青刘建锋兰倩邓楠郑凌予江泽平
- 关键词:买麻藤资源分布引种驯化繁殖技术
- 文献传递
- ABA对盐胁迫下侧柏活性氧代谢及其相关基因表达的研究被引量:9
- 2017年
- 以侧柏幼苗为试验材料,采用水培方式,研究不同浓度NaCl(0、100、200、300和400mmol·L^(-1))以及ABA(0、0.5、1、10、100和200μmol·L^(-1)处理对盐胁迫下侧柏幼苗活性氧代谢的影响。结果显示:(1)随着NaCl处理浓度增加,侧柏幼苗叶片过氧化氢(H_2O_2)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)和脯氨酸含量,以及抗氧化物酶(SOD、POD和CAT)活性呈上升趋势,而可溶性蛋白含量降低。(2)于300mmol·L^(-1)NaCl胁迫处理48h后进行ABA(1和10μmol·L^(-1))处理,分析发现侧柏幼苗叶片的SOD、POD和CAT活性提高,GSH、脯氨酸和可溶性蛋白含量增加,H_2O_2和MDA的积累减少。(3)NaCl胁迫后,侧柏幼苗叶片活性氧代谢相关基因(Cu/Zn-SOD、CAT、GR、APX、MDAR和GST)的表达水平随ABA浓度增加呈先升后降的趋势,并于10μmol·L^(-1) ABA处理48h时达到峰值。研究表明,适宜浓度ABA通过促进盐胁迫下侧柏幼苗叶片的抗氧化物酶活性,提高渗透调节能力,增加GSH含量,降低H_2O_2和MDA积累,从而有效降低活性氧对侧柏叶片的伤害,保护细胞膜结构的完整,增强其抗盐性。
- 姚侠妹纪敬岳剑云谢田田邓楠史胜青江泽平常二梅
- 关键词:侧柏盐胁迫活性氧代谢基因表达
- 海南省小叶买麻藤种子形态及营养成分研究被引量:1
- 2013年
- 以海南省小叶买麻藤为研究对象,通过对不同气候条件下种子形态与营养成分的研究,发现不同地理位置和生长环境对小叶买麻藤种子各形态指标和营养成分均有显著影响。种子形态在不同地区间差异明显,而同一地区不同单株间基本一致;同一地区不同单株间总淀粉和不同地区间总糖无显著差异。含水量、总脂肪、总黄酮等各指标在不同地区及不同单株间均表现出显著性差异,脂肪含量总体较低,但含有人体必需脂肪酸。吊罗山地区小叶买麻藤种子含水量(41.20%)、总淀粉(40.85%)和总黄酮(15.07%)含量占有绝对优势,这与当地较大的降水量,适宜的温度以及优质的山地黄壤有着密切关系。小叶买麻藤种子营养丰富,但不同生长环境对种子形态及营养成分影响较大,因此进行全面系统的研究对该属植物的开发利用具有重要意义。
- 兰倩史胜青刘建锋常二梅邓楠江泽平
- 关键词:小叶买麻藤营养成分黄酮降水量地理分布
- 膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析被引量:9
- 2015年
- 以不同萌发期间的膜果麻黄(E.przewalskii)种子为研究对象,应用新一代高通量测序技术平台Illumina Hi SeqTM2000对其进行转录组测序和数据重新组装,结果获得了12 999 122条初始序列,总长为1 169 920 980bp,初始序列组装获得序列片段的平均长度与N50值分别为351和548 bp;与COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了49 449个GO功能注释、17 751个COG功能注释以及16 748个KEGG注释;并从KEGG通路中找到有关芪类、二芳基庚烷和姜醇合成途径的编码基因片段230个。
- 邓楠史胜青常二梅刘建锋兰倩江泽平
- 关键词:转录组芪类高通量测序
- 小叶买麻藤种子营养及药用成分分析被引量:2
- 2014年
- 小叶买麻藤(Gnetumparvifolium(Warb.)C.Y.Cheng)是一种珍贵的药用裸子植物,主要分布在热带、亚热带地区,作为珍稀濒危物种,已被收入中国物种红色名录。作为我国传统中药,小叶买麻藤具有降血压、祛除风湿、止血凉血等功效。
- 兰倩刘建锋史胜青常二梅邓楠江泽平
- 关键词:小叶买麻藤种子种子形态营养成分药用成分
- 买麻藤及其变种光合特性比较
- 买麻藤属(Gnetum)植物是一类系统进化位置特殊的藤本(稀乔木、灌木)裸子植物,由于富含生物碱、黄酮和芪类化合物等生物活性物质而具有重要的经济开发价值.本研究以在温室培养的买麻藤(G.montanum)及其变种1年生幼...
- 邓楠史胜青赵育新兰倩江泽平
- 关键词:买麻藤系统进化光合参数荧光参数
- 文献传递