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谷子waxy基因exon2-exon4区间序列比对分析被引量：4: 2015年; 为了明确中国春谷子waxy基因序列的变异,本研究以引进的53份谷子品种(系)为材料,采用PCR产物测序,对waxy基因exon2-exon4序列进行比对分析。研究结果显示:非糯、低直链淀粉含量和糯质类型频率分别为22.6%、54.7%和9.4%;在非糯类型中,11、12、22、23号材料检测到碱基缺失和置换,1、13、18和27号仅存在碱基缺失;在低直链淀粉类型中,9、17和24号同时存在碱基插入、缺失和置换,14和15号品种为碱基缺失和置换,大红谷(00009836)为碱基插入和缺失,20号和43号仅分别出现置换和缺失;在糯质类型中,红粘谷(00000537)同时检测到碱基插入、缺失和置换,杏黄粘存在缺失和置换。根据exon2-exon4区间序列变异,以阈值为78将53份材料聚为十大类,其中第一类品种数量较多,第五类群SNP多态性较丰富。; 陈晓敏李书田杨自力孙宇燕刘斌张立媛王四清王丹丹郭世华; 关键词：谷子 WAXY

谷子农艺性状的聚类和主成分分析被引量：22: 2013年; 文章以引进的52份谷子种质资源为材料,对其9个农艺性状进行聚类和主成分分析。结果表明:参试材料农艺性状变异系数为16.18%-60.30%,叶片数的变异系数最小,为16.18%;穗粒重的变异系数最大,为60.30%,说明产量性状的变异潜力较高。聚类分析中将参试材料聚为5大类群,其中第三类群为A2-7005,除千粒重外,它的各性状均值都很高。主成分分析结果表明,前6个主成分累计贡献率为88.91%,可以用来表述谷子性状的全部信息。; 陈晓敏赵云昆郭世华; 关键词：谷子农艺性状聚类分析主成分分析

春谷子农艺和品质性状的变异分析被引量：10: 2015年; 为有效利用糯谷子种质材料，以引进的53份谷子为材料，采用 SAS9．0软件对其农艺和品质性状的变异进行分析。主要结果如下：农艺性状的变异幅度为5．7％～36．08％，其中穗粒重的变异幅度最大（C ．V 为36．08％），生育日数的变异幅度最小（5．7％）。株高与穗长、节数呈极显著正相关，与叶片数、穗下节间长呈显著正相关，但与穗粒重呈显著负相关。穗越紧，穗下节间和穗毛越短。采用类平均法，在欧式距离4．1148，将供试材料聚为八大类，其中第二、第三和第八类群共25份材料为高产潜力组合类型。非糯、低直链淀粉和糯质类型频率分别为24．5％、60．4％和0。丰谷12、利谷21等16份材料的糊化温度为70℃～74℃（碱消值在4～5），频率为30．2％。赤谷10号、利谷21等29份材料（频率54．7％）的胶稠度大于115 cm 。; 孙宇燕李书田陈晓敏刘斌张立媛王丹丹郭世华; 关键词：谷子农艺性状品质性状

谷子农艺性状和蒸煮品质与GBSS1基因等位变异分析: Waxy /(GBSS1/)基因编码直链淀粉的合成,其碱基插入或缺失使编码的氨基酸序列改变,胚乳直链淀粉含量低,支链淀粉含量较高,甚至全为支链淀粉,使谷子表现为糯质。本文以引进的88份谷子品种/(系/)为材料,...; 陈晓敏; 关键词：谷子农艺性状蒸煮品质; 文献传递

春谷子Waxy基因序列变异及其SNP分析被引量：5: 2015年; 为了明确春谷子Waxy基因序列变异和为品质育种提供实验依据,本研究以引进的15份春谷子为材料,利用特异PCR标记和序列比对,研究了Waxy基因序列单核苷酸多态性。结果表明:引物ex1/TSI2R、M5/M9和ex2int2/ex4在供试15份材料中分别扩增出约380 bp、1 800 bp和1 000 bp的谱带;引物ex1/ex2在利谷21、赤谷4号、A2不育度低和A2-1不育系等4份材料中均未扩增出谱带,在其余11份材料中均扩增出约1 200 bp的谱带;M2/R4在丰田501和金丰谷中未扩增出条带,在其余13份材料中均扩增出约1 500 bp的谱带。与Gen Bank粳谷KF372879的Waxy基因序列比对,共检测到419个SNPs位点和2 082个氨基酸变异。不同材料之间,总SNPs最多的为赤谷16、赤谷6号和公矮5号,分别为38、37和37,SNPs较少的有赤谷4号和利谷21,均为16;SNP多态性最多的引物为ex1/TSI2R,为159个,最少的为M5/M9,为40个;外显子共检测到47个SNPs,大白毛、A2-1不育系、丰田501、公矮5号和赤谷5号较多,分别为6、5、5、5和5个。非糯、低直链淀粉含量和糯质类型在外显子上的SNP分别为17、22和8个。; 孙宇燕陈晓敏王丹丹郭世华; 关键词：WAXY基因 SNP

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陈晓敏