陈雪峰
- 作品数：4 被引量：28H指数：3
- 供职机构：第四军医大学唐都医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系被引量：15
- 2006年
- 从GenBank获得大肠杆菌K-12MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱。另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析。
- 王侃刘次全曹槐陈雪峰
- 关键词：大肠杆菌密码子偏好性MRNA二级结构
- 与烟草细胞质雄性不育相关的线粒体基因atp9的mRNA研究被引量：9
- 2007年
- 已知导入未编辑atp9 mRNA的烟草表现细胞质雄性不育(CMS),因此认为线粒体基因atp9是引起高等植物CMS的主要基因。为了解atp9在CMS中的作用机制,从3对烟草不育系及其同型保持系中提取atp9,利用实验与理论结合来分析其mRNA在编辑前后以及在不育系及其同型保持系中的一维、三维信息差别。结果表明,atp9mRNA一维信息方面的差异,更重要的是二级结构的差异和稳定性,可能是影响ATP合成而导致CMS的根本原因。
- 周玮刘齐元陈雪峰刘飞虎曹槐刘次全
- 关键词：细胞质雄性不育MRNA二级结构烟草
- 穷举折叠序列路径模型和保守mRNA发夹结构
- 随着RNA分子越来越多种类和功能的发现，人们对RNA的理解正在逐步发生变化，开始以一种全新的观念重新认识RNA分子在生物体内所起的重要作用。但一般来讲，这种重新认识的焦点主要集中在所谓的功能RNA分子。这类非编码RNA分...
- 陈雪峰
- 关键词：发夹结构核苷酸序列
- 文献传递
- H5N1亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析被引量：4
- 2008年
- 以H5N1亚型禽流感病毒(avianin fluenza viruses,AIV)毒株血凝素(hemagglutinin,HA)蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,研究其密码子的偏好性及对应mRNA序列折叠二级结构的特点.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.结果表明,裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤(A)的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,极少数位于配对螺旋区.此外,本研究还从理论上提出了防治H5N1亚型AIV感染的对策,考虑以位于环区的mRNA核苷酸,运用RNAi的方法阻止H5N1亚型AIV的HA的表达。
- 张素霞王昕陈雪峰王侃曹槐张闻刘次全
- 关键词：禽流感血凝素裂解位点MRNA二级结构
