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孙菲菲: 作品数：24 被引量：102H指数：7; 供职机构：南京市蔬菜(花卉)科学研究所更多>>; 发文基金：南京市科技发展计划项目国家自然科学基金江苏省自然科学基金更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

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不结球白菜同源四倍体种质创建及特性研究被引量：8: 2016年; 利用优良二倍体不结球白菜华凤为试验材料,采用秋水仙素活体诱导其生长点,旨在创建同源四倍体种质。通过形态学比较、流式细胞仪测定遗传物质含量等方法鉴定了变异植株倍性,从中筛选获得了同源四倍体。在此基础上,选取3个优异同源四倍体自交系为研究对象,发现四倍体的营养品质提高,花期延长约10 d,结实率达到了应用的水平。研究结果表明,不结球白菜同源四倍体种质具有良好的应用前景。; 王夏孙菲菲郦月红王强孙雪花刘庆叶; 关键词：不结球白菜同源四倍体秋水仙素种质创新

南京地区白菜种质资源遗传主成分与聚类分析被引量：6: 2014年; 为了了解南京地区不结球白菜种质遗传多样性,对50份白菜种质的株高、株型等15个形态学性状进行了主成分分析和聚类分析。结果表明,15个形态学性状的平均变异系数为30.35%,其中叶柄长的变异系数最大,为58.48%,其次为株型、叶柄质量和叶形。主成分分析表明植株叶片指标、叶柄指标、植株外形和颜色指标等4个主成分代表了80.04%的变异,并以此进行聚类分析,依据种质间遗传距离将供试材料聚为夏播品种、秋播品种和腌制品种等3个大类。; 孙菲菲王夏王强郦月红; 关键词：白菜种质资源主成分分析聚类分析

不结球白菜高亲和性硝酸盐转运蛋白NRT2.2的克隆和表达分析被引量：2: 2014年; 以不结球白菜品种"苏州青"为材料,克隆得到了1个高亲和性硝酸盐转运蛋白基因——BcNRT2.2,该基因的全长为1593 bp,编码530个氨基酸。序列分析结果表明:BcNRT2.2基因含有AGWGNMG共识别基序,其氨基酸序列与拟南芥NRT2.2的同源性为86%;其二级结构主要由α-螺旋和自由卷曲构成;预测BcNRT2.2蛋白含有12个跨膜域。实时定量PCR分析结果表明:BcNRT2.2主要在根部表达,并受高浓度硝酸盐的诱导;BcNRT2.2在原始叶片中表达量较低,但受低温、高温和干旱胁迫的诱导后而高量表达。; 孙菲菲王镇李建刚王夏孙雪花侯喜林; 关键词：不结球白菜克隆非生物胁迫

矮小型小白菜新品种——珍奇被引量：1: 2014年; 珍奇生长期短,品质优,株型矮小、美观,适应市场消费需求,推广种植面积达500hm2（7500亩）. 南京市蔬菜科学研究所2005年以由日本引进的小白菜一代杂种华冠为母本,以矮抗青小白菜为父本进行杂交,杂交后代经自交、分离、提纯,采用常规育种方法,经过7代定向选育,培育出矮小型小白菜新品种珍奇（图1）.; 王强孙菲菲王夏; 关键词：小白菜矮小型杂交后代种植面积一代杂种

不结球白菜硝酸还原酶基因BcNR的克隆及其在拟南芥中的转化被引量：5: 2009年; 【目的】克隆不结球白菜硝酸还原酶基因(BcNR),并转化拟南芥做初步的功能鉴定。【方法】采用分段RT-PCR及3′RACE和5′RACE技术克隆了BcNR基因的全长cDNA,利用生物信息学方法进行序列分析和蛋白结构分析。构建pCAM-BcNR植物过量表达载体,通过农杆菌介导的真空渗透法将其转入野生拟南芥中,经抗性筛选及PCR验证获得T0代转基因植株,用Real-timePCR方法对30mmol·L-1KNO3溶液处理的转基因拟南芥的硝酸还原酶基因表达进行检测,并测定转基因植株的硝酸还原酶活性。【结果】获得了编码不结球白菜硝酸还原酶基因(BcNR)的cDNA全序列3049bp,包含有2733bp的开放阅读框,编码910个氨基酸。其氨基酸序列与拟南芥、烟草、甘蓝型油菜、马铃薯等编码的氨基酸序列具有较高同源性。蛋白质结构域分析表明,所推导的氨基酸序列具有完整的硝酸还原酶结构,同时证明从不结球白菜中克隆的这条基因属于NADH-NR型。GenBank登录号为EU662272。转基因拟南芥T0代植株进行GUS基因PCR检测,证明重组质粒已整合到转基因植株基因组中。硝酸盐处理后的转基因植株硝酸还原酶基因的表达比野生型显著提高,且硝酸还原酶活性有不同程度的提高。【结论】本研究首次从不结球白菜中克隆获得BcNR基因的全长cDNA序列,揭示了其序列特征并对其进行了初步的功能鉴定,为进一步利用该基因开展蔬菜硝酸盐含量的基因调控研究奠定了基础。; 孙菲菲侯喜林李英高红亮张昌伟; 关键词：不结球白菜硝酸还原酶克隆

不结球白菜热激蛋白BcHSP81-4基因原核表达及生物信息学被引量：1: 2011年; 从不结球白菜Pol_CMS胞质不育系SSH差减文库中得到1条热激蛋白基因的EST序列,通过对该基因的NCBI网上BLAST比对发现,与热激蛋白的同源性最高,与拟南芥HSP81-4(AT5G56000)同源性高达96%,命名为BcHSP81-4。将BcHSP81-4基因片段连接到原核表达载体PGEX-4T-3,转化大肠杆菌BL21(DE3)后诱导重组蛋白的表达。经IPTG诱导后进行SDS-PAGE电泳,产生了预期大小的重组蛋白,进一步证明了该基因属于热激蛋白90家族。并采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜热激蛋白BcHSP81-4的理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位及蛋白质结构进行预测和分析。理化性质分析结果显示,该蛋白质含699个氨基酸,分子量为80 050,理论等电点pI值为4.95。TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本对应。用TargetP server和WOLFPSORTserver程序预测该蛋白质为细胞质蛋白质,二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。; 刘同坤李英王枫孙菲菲张蜀宁侯喜林; 关键词：不结球白菜原核表达生物信息学

不结球白菜抗芜菁花叶病毒蛋白BcTuRsO的生物信息学分析被引量：3: 2010年; 采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)蛋白BcTuRsO的系统进化、理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位、所含模体及蛋白质结构进行预测和分析。系统进化树分析结果表明,该蛋白在不同物种之间具有保守性。理化性质分析结果显示该酶含194个氨基酸,分子量为21 731.3,理论等电点pI值为6.60。TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本重叠。用Target P server和WOLFPSORTserver程序预测该蛋白为细胞质蛋白。结构域分析结果显示该蛋白含多种磷酸化位点。二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。; 马景蕃侯喜林肖栋孙菲菲单晓政刘同坤; 关键词：不结球白菜生物信息学

不结球白菜Pol胞质雄性不育系和保持系蕾期基因的差异表达被引量：4: 2010年; 以不结球白菜Pol胞质雄性不育系及其保持系为材料,利用cDNA-AFLP技术分析它们蕾期基因的差异表达,以获得与胞质不育相关的差异表达基因.结果共得到7条在GenBank中有同源性的差异表达片段,5条存在于不育系中,2条存在于保持系中.序列分析发现,在不育系花蕾克隆到的5条差异片段,分别与芥菜胞质雄性不育系线粒体orf108和atpA、拟南芥焦磷酸酶基因、拟南芥的锚定蛋白家族基因、甘蓝型油菜中的水胁迫蛋白、大白菜叶绿体基因片段有较高同源性;在保持系花蕾克隆到的2条差异片段分别与拟南芥未知蛋白基因有较高同源性.采用实时定量PCR验证其中5条差异片段在不育系和保持系花蕾中的表达水平,结果表明bcA19T15、bcA7T9在不育系中特异表达,bcA6T9、bcA19T8、bcA12T19在不育中表达比保持系中略强.; 张昌伟张蜀宁侯喜林齐莉孙菲菲; 关键词：不结球白菜 POL CDNA-AFLP

不结球白菜硝酸还原酶基因cDNA的克隆及序列分析被引量：8: 2006年; 采用离体法测定了经50 mmol.L-1的KNO3诱导不同时间后的雪克青、苏州青、矮脚黄、乌塌菜(黄心乌)4个不结球白菜品种叶片硝酸还原酶的活性。结果表明,4个品种的硝酸还原酶活性变化趋势相似,且分别在4、4、6、6 h达到最高峰。苏州青经50 mmol.L-1的KNO3诱导4 h后,提取其叶片总RNA,用RT-PCR方法获得硝酸还原酶基因cDNA的2条片段,长度为1 125 bp和438 bp,分别编码374个和135个氨基酸,命名为nr1125和nr438。nr1125在GenBank的登录号为DQ001901。; 孙菲菲侯喜林李英崔秀敏; 关键词：不结球白菜硝酸还原酶 PCR 克隆

萝卜种质资源的遗传多样性和聚类分析被引量：15: 2013年; 为了解萝卜种质资源的遗传多样性,对68份萝卜种质的10个形态性状进行了主成分分析及聚类分析,主成分分析表明:对萝卜种质进行分类,应依次考虑的因素分别为植株颜色、植株株型、叶部特征、根部特征和根部颜色;聚类分析表明:68份萝卜种质能够分成3个类别,即普通红萝卜、樱桃型萝卜和非红普通萝卜。; 王夏孙菲菲王强; 关键词：萝卜种质资源主成分分析聚类分析

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