廖峭
- 作品数：57 被引量：185H指数：8
- 供职机构：广州血液中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金广州市医药卫生科技项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学政治法律更多>>
- 深圳东部地区43305名无偿献血者HTLV感染情况调查被引量：4
- 2020年
- 目的了解深圳东部地区无偿献血人群中人类嗜T淋巴细胞病毒(HTLV)感染的流行情况。方法采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对43 305名无偿献血者的标本进行HTLV-Ⅰ/Ⅱ抗体筛查,对其中的阳性的标本使用电化学发光(ECL)检测,检测阳性的标本再经RT-PCR或WB法确证并通过巢式PCR扩增进行基因测序和同源性分析。结果 ELISA法筛查HTLV-Ⅰ/Ⅱ抗体阳性的标本有33例,阳性率为0.076%;ECL检测阳性的标本5例,阳性率为15.15%;经RT-PCR或WB法确证阳性2例,确证感染率为0.004 6%;此2例病毒株均为HTLV-1A型,均为世界人种亚群。结论深圳东部地区无偿献血者属于HTLV低流行人群;是否将HTLV纳入无偿献血者常规筛查,有待进一步的监测数据支持。
- 黄华霖温秀明陈亮方瑛单振刚廖峭焦晓阳
- 关键词：人类嗜T淋巴细胞病毒无偿献血者
- 广州市2009-2011年无偿献血人群丙型肝炎病毒流行情况及分析被引量：1
- 2013年
- 目的研究广州无偿献血人群中丙型肝炎病毒（HCV）流行情况，了解HCV在广州地区流行趋势，为保障血液安全及制定HCV防控政策提供基础资料。方法选取2009-2011年在广州血液中心无偿献血者中抗-HCV检测双试剂呈反应性的献血员1407人；收集性别、年龄、学历等人口学特征数据，随机抽取HCVRNA阳性者765例分析HCV亚型信息，对3年的结果进行比较。结果2009-2011年广州市无偿献血人群的HCV感染率分别为0．17％、0．21％和0．19％。χ2检验显示：2010年的感染率显著高于2009年（χ2=9．774，P=0．008）；〈20岁年龄组中，2011年HCV阳性率高于2009及2010年（χ2=39．041，P=3．33×10^-9）；20～29岁年龄组中，2010年及2011年HCV阳性率高于2009年（χ2=12．678，P=0．002）；男性HCV阳性率2010年及2011年有所上升（χ2=6．770，P=0．034）；2010年及2011年大学/大专学历者中HCV阳性率较2009年有显著提高（χ2=17．736，P=1．408×10^-8）。广州地区流行的HCV亚型主要为HCV1b和HCV6a，3年间的亚型分布无明显变化（P=0．153）。结论广州地区献血人群的HCV阳性率处于较低水平，但30岁以下、男性、大学／大专文化程度的献血者中HCV阳性率有上升的趋势，需加强对HCV的宣教和防控工作。
- 戎霞许茹沈爱文王敏黄珂黄杰庭熊华平张雪梅廖峭林昌周付涌水
- 关键词：无偿献血人群丙型肝炎病毒人口学特征基因型
- IL-28B基因多态性与丙型肝炎自然转归的相关性研究被引量：1
- 2015年
- 目的:探讨IL-28B单核苷酸多态性与丙型肝炎病毒(HCV)感染自然转归的相关性。方法:采用Sanger基因测序法检测广州地区无偿献血人群中266名HCV感染者(107名自发清除者和159名慢性感染者)和97名健康献血者IL-28B rs12979860位点基因型和等位基因,并统计分析其在HCV感染者与健康献血者,HCV慢性感染者与健康献血者,HCV自发清除者与慢性感染者中的分布差异。结果:159名HCV慢性感染者,107名自发清除HCV者和97名健康献血者多表现为CC基因型,分别占83.6%、95.3%和86.6%,CT基因型分别占16.4%、4.7%和13.4%,未发现TT基因型。HCV感染者和健康献血者,HCV慢性感染者和健康献血者CC/CT基因型分布差异均无统计学意义(χ2=0.204,P=0.652;χ2=0.406,P=0.524),但在HCV慢性感染者和自发清除HCV者中CC/CT基因型分布差异有统计学意义(χ2=8.474,P=0.004),自发清除组中CC基因型比率高于慢性感染组,自发清除组C等位基因的频率高于慢性感染组(χ2=7.949,P=0.005)。结论:在广州献血人群中,IL-28B rs12979860基因多态性与HCV的易感性不相关,但与HCV感染的自发清除相关,表现为C等位基因有利于丙型肝炎病毒(HCV)的自发清除。
- 陈秋宇熊华平许茹王敏廖峭黄珂黄杰庭戎霞付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒基因多态性
- 基因1型和6型HCV CD4 T细胞抗原表位的初步鉴定
- 2022年
- 目的 研究基因1型(GT1)和6型(GT6)HCV Core蛋白和NS3蛋白的CD4 T细胞抗原表位。方法 合成覆盖GT1和GT6 HCV Core和NS3全长的重叠肽段(16-mer)298条。通过肽段库刺激17例HCV+献血者和7例健康献血者的外周血单个核细胞(PBMC),IFN-γELISPOT测定T细胞应答,初步筛选出21条阳性肽段。再将这些肽段单独刺激20例HCV+和18例健康献血者PBMC。比较2组之间对阳性肽段的应答频率的差异。结果 综合分析肽段库和单条肽段的试验结果,HCV+组对其中5条肽段(GT1 NS3_(1273-1288)和NS3_(1315-1330);GT6 NS3_(1033-1048)、NS3_(1087-1102)和NS3_(1351-1366))刺激的应答频率较高(18.9%~27.0%),且健康对照组无应答或低应答(0%~4.0%),2组之间应答频率有差异(P<0.05)。经序列比对,免疫表位数据库(IEDB)中没有与这5条肽段序列一致的抗原表位。结论 本研究鉴定出HCV GT1和GT6 HCV NS3蛋白新的CD4 T细胞抗原表位,对HCV疫苗的研发具有潜在的应用价值。
- 黄杰庭尤庆柱李丰沛许茹王敏廖峭单振刚戎霞付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒基因型疫苗献血者
- 机体自发清除丙型肝炎病毒和主要组织相容性复合体区域单核苷酸多态性关联的初步研究被引量：2
- 2014年
- 目的了解中国丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染人群机体自发清除HCV和主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)区域单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的关联性。方法选择96名抗-HCV阳性并成功随访1年的献血者为研究对象,分为自发清除组(HCV RNA阴性)和慢性感染组(HCV RNA阳性),采用Illumina MHC Mapping Panel试剂盒对两组人群进行MHC区域的SNPs检测,利用SPSS16.0分析软件、Matlab软件编程,采用t检验、χ2检验及分层分析等方法对各SNP位点及性别、年龄因素与HCV清除与否进行关联性分析。结果获得HCV自发清除组和慢性感染组样本分别为19份和77份。两组间年龄差异无统计学意义(t=0.610,P=0.543),HCV自发清除组中女性感染者的比例明显高于男性(χ2=17.668,P=2.63×10-5)。检测的1 293个SNPs中,rs2246626(χ2=10.777,P=0.001)、rs12386522(χ2=7.725,P=0.005)、rs2534679(χ2=7.522,P=0.006)和rs1264457(χ2=6.821,P=0.009)与HCV的自发清除显著相关。结论MHC区域共发现4个与HCV自发清除存在显著性关联的SNPs,女性发生HCV自发清除比例高于男性。该结果将为进一步研究机体自发清除HCV和MHC基因的关联奠定基础。
- 戎霞王敏黄杰庭黄珂许茹廖峭熊华平付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒主要组织相容性复合体单核苷酸多态性
- 海南省白沙县黎族和汉族1992年后出生人群的HBV流行病学研究被引量：3
- 2019年
- 目的本研究拟对1992年后出生的海南省黎族和汉族人群的HBV流行情况进行调查和统计。方法 2014年7月-2015年10月,收集海南省白沙县中学1992年后出生的学生和老师的血浆标本610份,用两种不同的ELISA试剂对HBsAg进行检测,用电化学发光法对抗-HBc和抗-HBs进行检测。对黎族和汉族之间HBsAg、抗-HBc和抗-HBs阳性率的差异进行卡方检验,通过卡方检验和多因素Logistics回归分析影响整个人群中HBsAg阳性和抗-HBc阳性的风险因素。结果黎族和汉族性别、年龄、HBsAg阳性率、抗-HBc阳性率无统计学差异,抗-HBs阳性者在汉族人群中明显高于黎族人群(OR=1.49, 95%CI 1.06-2.09,P<0.05)。统计分析显示穿耳洞为HBsAg阳性的独立影响因素(OR=3.28,95%CI 1.68-6.39,P<0.01),年龄(OR=1.80, 95%CI 13.4-2.43,P<0.01)和穿耳洞(OR=2.12,95%CI 1.34-3.43,P<0.01)为抗-HBc阳性的独立影响因素。结论白沙县1992年后出生黎族和汉族的HBV感染率没有明显差距,穿耳洞是目前白沙县HBV流行率高的一个风险因素,因此增加民众尤其学生对HBV感染风险的认知尤为重要。
- 许茹宋丹丹王敏王敏廖峭黄杰庭戎霞廖峭
- 关键词：黎族汉族乙型肝炎病毒乙肝表面抗原
- 高通量测序技术在静脉吸毒人群HCV gt3感染者中的应用和研究被引量：1
- 2020年
- 目的针对广东地区静脉吸毒人群中流行的HCV gt3建立高通量二代测序技术,以期获得HCV gt3全基因组序列用于流行病学研究。方法随机选取10例病毒滴度>10~6 IU/mL以及10例病毒滴度<10~6 IU/mL的标本进行高通量二代测序方法的探讨。通过样品均质化、过滤和核酸酶消化等前处理,对RNA提取方法进行比较,对不同滴度的标本采用不同的建库方法。采用"比对到HCV参考序列"和"宏基因组"2种生物信息学方法进行分析获得全基因组序列,将分型结果与前期NS5B和E1进行比较。结果磁珠法比柱提法获得的HCV RNA产出量高(79.428%vs 38.462%),富集法获得的"HCV reads/reads"的比例远远大于直接建库法(P<0.05),当病毒滴度>10^6 IU/mL时,用富集法和直接建库法获得的基因组覆盖度无差异(P>0.05)。当病毒滴度<10^6 IU/mL时,富集法获得的基因组的覆盖度远远大于直接建库法(P<0.05)。获得的全基因组序列的基因分型与NS5B和E1的基因分型一致。结论对于HCV gt3的NGS测序方法,RNA提取采用磁珠法,对于病毒滴度>10^6 IU/mL的标本,采用直接建库法可以获得全基因组序列,而对于病毒滴度<10^6 IU/mL的标本,只有采用富集法才能获得全基因组序列。
- 许茹黄杰庭杜荣松钟惠珊王敏廖峭单振刚戎霞付涌水
- 关键词：静脉吸毒
- HLA-DRB1^(*)11:01与HCV感染的病毒选择压力及与CD4+T细胞表位的关系探讨
- 2023年
- 目的我们前期研究显示,无论在汉族人群还是黎族人群中,HLA-DRB1^(*)11∶01均是与机体自发清除HCV相关联的HLA-Ⅱ类基因,因此,本研究的目的是探讨HLA-DRB1^(*)11∶01基因与HCV感染的病毒选择压力及与CD4+T细胞表位的关系。方法对广东地区常见的HCV 6a慢性感染者HLA-DRB1^(*)11∶01阳性组和阴性组的E1E2和NS3基因进行病毒选择压力以及病毒群体扩张的分析。采用覆盖我国常见HCV基因型保守区的CD4+T细胞表位的重叠肽段刺激HCV自发清除组和慢性感染组,通过ELISPT实验,根据每孔的斑点形成细胞数以及在不同组出现的频次评估HLA-DRB1^(*)11∶01基因与CD4+T细胞表位的关系。结果广东地区常见的HCV 6a感染者HLA-DRB1^(*)11∶01阴性组E1E2和NS3的阳性选择位点以及位于CD4+T细胞表位的位点数均大于HLA-DRB1^(*)11∶01阳性组;两组HCV 6a感染者在广东地区均具有群体扩张趋势,且HLA-DRB1^(*)11∶01阴性组的扩张趋势明显高于HLA-DRB1^(*)11∶01阳性组。HCV自发清除组对其中5条肽段(C-52 E2691-707、C-119 NS31545-1560、C-134 NS4A1669-1684、C-154 NS4B1912-1927和C-159 NS4B1929-1944)刺激的应答率较高,HCV慢性感染组对其中的2条肽段(C-111 NS31497-1512和C-130 NS31650-1665)刺激的应答率较高。当考虑HLA-DRB1^(*)11∶01分型时,在慢性感染组和自发清除组HLA-DRB1^(*)11∶01阳性和HLA-DRB1^(*)11∶01阴性PBMCs产生的HCV特异性免疫应答均无统计学差异。结论研究揭示了HLA-Ⅱ类基因HLA-DRB1^(*)11∶01与HCV感染的病毒选择压力及与CD4+T细胞表位的关系,同时,获得HCV泛基因型CD4+T细胞抗原候选表位,为研发适合HCV泛基因型的T细胞疫苗提供基础数据。
- 许茹黄杰庭黄杰庭廖峭王敏钟惠珊廖峭付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒自然转归
- 广州无偿献血人群中丙型肝炎抗体阳性者HCV基因型与病毒载量的关系被引量：13
- 2012年
- 目的:了解最新广州地区无偿献血人群丙型肝炎病毒(HCV)基因型与病毒载量的关联性。方法:收集2008～2011年广州地区无偿献血人群中抗-HCV阳性标本605份,采用荧光定量PCR(Q-PCR)的方法对其进行核酸及病毒载量检测,阳性标本作NS5B基因扩增;核苷酸序列测定后运用DNASTAR、BioEdit和Mega4.0等软件作序列分析和基因分型,采用SPSS16.0软件对病毒载量与基因型(亚型)的关联性进行分析。结果:337份HCV RNA阳性的标本扩增出NS5B基因320份,HCV 1b、6a、3a、2a、3b、1a、6n比例依次为45.00%、33.44%、8.75%、7.81%、4.38%、0.31%和0.31%。HCV1b与2a、3a、6a、6a与2a、3a之间病毒载量存在显著差异:HCVba病毒载量高于2a、3a和6a,HCV6a病毒载量高于2a和3a。结论:广州地区无偿献血人群中HCV1b和6a为主要亚型且其病毒载量高于其他亚型。
- 廖峭许茹王敏黄珂熊华平叶欣戎霞罗广平付涌水王继红
- 关键词：病毒载量
- 广东HCV进化与注射吸毒者HCV NS5B区正向选择位点的分析研究
- 2022年
- 目的了解广东HCV进化与注射吸毒者(IDUs)HCV NS5B区正向位点的选择压力情况。方法随机收集广东141(人)份HCV RNA阳性献血者和58(人)份HCV患者标本做HCV NS5B序列扩增,结合前期测序得到的2009年~2011年的献血者和IDUs HCV NS5B序列,用分子进化遗传学分析(MEGA)软件做同源性分析,贝叶斯进化分析抽样树(BEAST)软件包做进化分析,用Datamonkey在线软件包进化的混合效应模型(MEME)方法对IDUs分离的序列做选择压力分析,用进化分析软件Arlequin的Tajima和Fu中性检验分析种群扩张情况。结果本组IDUs不同亚型内部同源性比较结果为:HCV-3b同源性最高(97%),其次为HCV-3a(96%),HCV-6a(95%)和HCV-1b(94%);HCV进化速率分析显示:HCV-1b的进化速率最快[2.17E-03替换数/位点/年(y/y/y)],其次为HCV-3b(2.12E-03 y/y/y),HCV-3a(1.58E-03 y/y/y)和HCV-6a(1.28E-03 y/y/y);HCV理论感染人数分析:1980年~1990年是HCV-6a快速增长期,1990年~1995年是HCV-1b快速增长期,2000年~2007年是HCV-3a快速增长期;HCV群体遗传特征:HCV-1b、3a、3b和6a均经历了种群扩张,其中3a和3b最明显。HCV选择压力分析:IDUs NS5B序列中339个核苷酸有2个正向选择位点(第235和243位点),但此段基因的5个直接抗病毒药物(DAA)位点仅在第316位点发生了突变[突变率1.24%(14/1130)]。结论广东地区HCV 3b进化呈明显的种群扩张趋势,尤其在当地IDUs中的比例、同源性较高,应作为本地区HCV防治的重点。鉴于广东IDUs HCV NS5B基因片段的正向选择位点均非DAA结合位点,因此设想DAA对这些患者有较好的疗效。
- 王敏许茹廖峭钟惠珊黄杰庭杜荣松单振刚戎霞付涌水
- 关键词：丙型肝炎病毒注射吸毒者
