施勇
- 作品数:95 被引量:276H指数:7
- 供职机构:江西省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:江西省卫生厅科技计划项目江西省卫生厅基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 2009年江西省新分离流行性乙型脑炎病毒株全基因组分子生物学特性研究被引量:2
- 2010年
- 目的对2009年分离自江西省蚊虫标本的流行性乙型脑炎(乙脑)病毒JX0939株进行全基因组序列测定,分析其基因组特征。方法使用针对乙脑病毒全基因组测序引物进行PCR扩增基因组片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因组序列。利用生物信息学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒JX0939株基因组全长10965个核苷酸,从97位到10392位,共10296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸。与GenBank中登录的所有59株乙脑病毒全基因组序列比较发现,其核苷酸总体差异率为1%~17%,氨基酸总体差异率为0.1~5%。与目前使用的减毒活疫苗株SA-14-14-2株相比较,只有88%的核苷酸同源性,全基因组共存在1237个核苷酸差异,83个氨基酸差异。提取GenBank登录的及本实验室测定的不同省份的乙脑病毒全基因组序列,进行全基因组序列系统进化分析显示JX0939株属于基因1型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒JX0939株属于基因1型,与2007年中国分离株SH17M-07进化关系最接近,与疫苗株SA-14-14-2相比关键位点氨基酸未见变异。
- 王力华李铭华付士红姜红月陈维欣唐松戴新平应彩霞詹漫华施勇梁国栋
- 关键词:乙型脑炎病毒全基因组系统进化分析
- PCR—RFLP方法快速鉴别水痘-带状疱疹病毒野病毒与疫苗株
- 2016年
- 目的PCR—RFLP的方法快速鉴别2010-2015在江西省采集的水痘-带状疱疹标本中的野病毒与疫苗株。方法选取2010-2015年在江西省南昌市采集的的水痘-带状疱疹感染临床诊断病例的疱疹液和咽拭子标本共112份,分别使用特定引物对水痘一带状疱疹病毒(VZV)ORF62区、ORF38区和ORF54区进行扩增,对阳性扩增产物分别使用限制性内切酶SmaI、PstI及BglI进行酶切,对酶切产物进行片段长度多态性分析。结果112份标本中,39份标本的病毒核酸经特定区域的PCR扩增后,对产物进行酶切结果为SmaI-、PstI+及BglI+,而疫苗株酶切的结果为SmaI+、PstI-及BglI+。结论PCR—RFLP方法可以快速鉴定VZV的野毒株与疫苗株,江西省2010—2015年采集的水痘一带状疱疹标本中的VZV均为野病毒。
- 周珺龚甜熊英施勇
- 关键词:水痘-带状疱疹病毒野毒株疫苗株
- 江西省2009年至2012年甲型H3N2流感病毒耐药性分析被引量:6
- 2014年
- 目的分析江西省2009-2012年甲型H3N2流感病毒M2以及NA基因的特点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病控制提供参考。方法从江西省流感监测网中随机选择19株甲型H3N2流感病毒,经核酸提取和one-step RT-PCR扩增M以及NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar5.0和Mage4.0序列分析软件分析M2以及NA基因特征以及耐药性位点。结果 19株毒株M2基因31位氨基酸均由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N);所有毒株NA蛋白催化活性位点和辅助位点均未发生氨基酸替换。结论 19株毒株均对金刚烷胺类药物耐药,对流感病毒神经氨酸酶抑制剂药物均敏感,但仍应加强对流感病毒的耐药性监测。
- 李健雄熊英施勇龚甜周珺徐刚
- 关键词:M2耐药性
- rRT-PCR法在脊髓灰质炎病毒型内鉴定中的应用被引量:1
- 2015年
- 目的应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)对脊髓灰质炎病毒(PV)进行型内鉴定,并对该方法进行评估。方法采用世界卫生组织(WHO)推荐的脊髓灰质炎ITD和VDPV rRT-PCR方法对江西省既往分离的14株脊髓灰质炎毒株和2013年分离的15株脊髓灰质炎毒株进行ITD和VDPVs筛选,并将检测结果与毒株的VP1编码区核苷酸序列测定结果进行比较分析。结果 ITD rRT-PCR的实验结果除1株毒株漏检外,其余与毒株的VP1编码区序列测定结果完全相符,VDPV rRT-PCR的结果与VP1编码区序列测定结果不完全相符,共有14株Ⅱ型脊髓灰质炎病毒疫苗类似株被错判为VDPV株,11株Ⅲ型VDPV株错判为疫苗类似株。结论对脊髓灰质炎型内进行rRTPCR鉴定的方法可以替代中和试验的常规检测方法,但不能完全取代测序技术用于脊髓灰质炎VDPV的鉴定。
- 李建雄熊英施勇刘师文刘晓庆肖芳
- 关键词:实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应脊髓灰质炎病毒
- 2013-2016年江西省麻疹病毒分离株H基因特征分析
- 2021年
- 目的探究江西省2013-2016年麻疹病毒的流行特点与流行趋势。方法用Vero/SLAM细胞对麻疹病毒进行分离培养,对获得的麻疹毒株扩增其H基因序列,并对获得的基因片段进行核苷酸序列的测定,再与Gengbank上麻疹各基因型别的参考序列进行比对,分析其亲缘关系、同源性等变异情况。结果2013-2016年获得75株麻疹毒株,均为H1a基因型。75个毒株H基因之间的核苷酸同源性为97.86%~100%,与疫苗株Shanghai-191 H基因的核苷酸同源94.23%~94.71%,与H1a基因型代表株CHN/93/2(AF045196)H基因的核苷酸同源性为98.41%~99.02%;进化树显示,2013-2014年出现过11株小的分支流行但很快消失了。结论目前江西省麻疹病毒优势流行株的基因型别为H1a基因型。
- 张艳妮龚甜李健雄施勇徐刚
- 关键词:麻疹病毒基因型
- 江西省1778例细小病毒 B19 抗体水平检测结果分析被引量:1
- 2022年
- 目的抽样调查,了解江西省人群中细小病毒B19感染情况。方法收集不同县区、不同年龄结构的血清标本,采用酶联免疫吸附实验方法检测人细小病毒B19特异性IgG抗体水平,采用SPSS软件对检测数据进行统计分析。结果共检测1778例血清标本,检出人细小病毒B19 IgG抗体阳性244例,阳性率为13.72%(244/1778);不同县区人群抗体阳性率在8.33%~21.45%之间,差异具有统计学意义(P<0.01);不同年龄组抗体阳性率在1.15%~52.81%之间,差异具有统计学意义(P<0.01),其中3~5岁这部分人群的抗体水平最低。结论首次在江西省内进行细小病毒B19抗体水平调查,了解了人群人细小病毒B19感染情况。
- 刘晓庆龚甜李健雄刘师文施勇熊英
- 关键词:细小病毒B19抗体水平酶联免疫吸附
- 2017年江西省部分地区健康人群血清水痘-带状疱疹病毒IgG抗体水平调查被引量:6
- 2018年
- 目的了解江西省健康人群中水痘-带状疱疹病毒抗体的水平,评估接种疫苗的最佳对象。方法根据2017年传染病报告信息管理系统的水痘-带状疱疹病例监测资料进行分析;选区江西省3个设区市的6个县(市)随机采集1816例健康人群血清标本,使用酶联免疫吸附法进行水痘-带状疱疹病毒IgG抗体检测。结果⑴2017年江西省共报告水痘-带状疱疹病例19749例,平均发病率为43.01/10万,其中赣州市发病率最高,全省11个设区市的100个县区均有病例报告;每月均有水痘-带状疱疹病例的报告,有5~7月及11~12月两个流行高峰。各年龄组人群均有发病,以15岁以下的学生及儿童发病最多,尤其是5~15岁的学龄儿童;⑵1816例健康人群血清标本共检出水痘-带状疱疹抗体阳性1149例,阳性率为63.27%,抗体水平中位数为357.03mIU/ml;不同县市的水痘-带状疱疹抗体IgG抗体阳性率及抗体水平值差异无统计学意义(P>0.05);男性和女性的抗体IgG抗体阳性率及抗体水平值差异均具有统计学意义(P<0.01);不同年龄组的抗体IgG抗体阳性率及抗体水平值差异均具有统计学意义(P<0.01);不同年龄组的抗体阳性率及抗体水平随年龄而增长,1岁以下年龄组抗体阳性率和抗体水平中位数均为最低。结论儿童是水痘发病的主要人群,当前推荐的出生后12~15月龄进行第一次水痘-带状疱疹疫苗接种,并在4~6岁进行第二次疫苗接种的策略可以有效减少水痘病例的发生。
- 周珺李健雄施勇肖芳熊英
- 关键词:水痘-带状疱疹病毒血清抗体水平
- 江西地区啮齿动物中温州病毒的检测及病毒基因特征分析
- 2022年
- 目的了解温州病毒在江西地区啮齿动物中感染的情况及病毒基因特征。方法收集2021年江西省高安市、安义县两地啮齿动物鼠肺组织样本,提取样本核酸,采用温州病毒特异性引物进行巢式PCR扩增,PCR产物进行序列测定。采用Ion GeneStudio S5二代测序平台(NGS)对1株核酸阳性样本进行病毒基因组测序,采用CLC软件对基因序列进行分析。结果共收集高安市、安义县啮齿动物肺组织标本164份,通过巢式PCR检出温州病毒3份,均来自高安地区的黄毛鼠。3株病毒部分L基因序列同源性93.66%~98.50%,氨基酸序列同源性95.21%~100%。选取1株病毒(JXGAW45/2021)进行二代测序,获得全基因组序列,其中S、L基因分别含3429、7145个核苷酸。基因组比对分析发现JXGAW45/2021与其他温州病毒核苷酸序列同源性为82.58%~85.75%,氨基酸同源性为88.76%~96.83%,在S、L基因系统进化树中均独立分支,为温州病毒新的变异株。结论首次在江西地区啮齿动物中发现温州病毒。
- 刘师文李健雄施勇熊英吴杨博文龚甜
- 关键词:啮齿动物基因特征
- 2010-2020年江西省儿童医院急性呼吸道感染病例人副流感病毒流行特征研究被引量:1
- 2023年
- 目的了解江西省儿童医院急性呼吸道感染病例人副流感病毒(HPIV)感染状况及流行特征,为HPIV的防控提供理论支撑。方法收集2010年4月至2020年8月就诊于江西省儿童医院儿童的急性呼吸道感染病例的鼻/咽拭子、痰液和支气管肺泡灌洗液等样本,采用巢式PCR与实时荧光PCR方法检测HPIV 1~4型及其他常见呼吸道病毒,检测结果采用SPSS 25.0软件进行统计分析(χ^(2)检验和Fisher’s精确检验)。结果HPIV总阳性率为12.50%(492/3936),其中HPIV-1、2、3、4的阳性率分别为1.88%、0.61%、8.71%、1.30%。不同性别感染者检出率差异无统计学意义(χ^(2)=2.290,P>0.05)。男、女性感染者均以HPIV-3感染为主,其HPIV-3的阳性率分别为9.21%(247/2683)、7.66%(96/1253)。不同年龄段患者中,0~36月龄儿童最为易感。2020年HPIVs阳性率明显下降,与2010—2019年平均感染率相比差异有统计学意义(P<0.05)。HPIVs感染者最常见的临床表现为咳嗽,占89.84%(442/492);临床初步诊断最多为肺部感染,占33.94%(167/492),其次为支气管肺炎,占22.36%(110/492)。合并感染其他呼吸道病毒的占39.02%(192/492),其中最常见的病毒为人鼻病毒(HRV),其次是人腺病毒(HAd V)和呼吸道合胞病毒(RSV)。HPIV-1感染每隔2年秋季会有大幅上升,主要流行于秋、冬季。HPIV-2流行高峰与HPIV-1交替发生,主要流行于秋季。HPIV-3主要流行于春季和夏季(4—8月),与其他月份相比差异有统计学意义(χ^(2)=23.143,P<0.05)。HPIV-4的流行无显著季节性。HPIV-1和HPIV-3在住院病例与急门诊病例中的阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=6.125、10.525,P<0.05),上、下呼吸道感染病例阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=4.107、8.990,P<0.05)。结论HPIV是江西省儿童呼吸道感染的重要病原体,特别是在<36月龄婴幼儿中,对其感染HPIV的预防可借鉴呼吸道感染疾病的防控措施。
- 冉鑫肖大瑾徐刚刘晓庆李健雄施勇张艳妮周珺刘师文肖芳
- 关键词:人副流感病毒儿童急性呼吸道感染
- 重要新发突发病毒性传染病病原学研究的应用
- 熊英龚甜施勇周珺李健雄刘师文邹明霞张艳妮徐刚肖芳刘晓庆
- 该项目所属领域为传染病防治及卫生检验,主要围绕该省重要、新发、突发病毒性传染病病原(流感病毒、麻疹病毒、流行性出血热病毒、人感染H7N9/ H10N8禽流感病毒、寨卡病毒等),于2004年开始启动相关病原学研究、基因特征...
- 关键词:
- 关键词:病毒性传染病病原学筛查方法