晁燕
- 作品数：31 被引量：87H指数：6
- 供职机构：青海大学农牧学院动物科学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学更多>>
- 黄河裸裂尻鱼细胞色素C氧化酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚基基因的克隆及序列特征分析被引量：3
- 2011年
- 采用RT-PCR技术克隆获得了黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)COⅠ、Ⅱ、Ⅲ基因的编码序列,并对此进行了初步分析。结果表明,黄河裸裂尻鱼COⅠ基因全长为1 551 bp,开放阅读框(ORF)由基因全长组成,编码516个氨基酸;COⅡ基因全长为691 bp,开放阅读框为690 bp,编码230个氨基酸;COⅢ基因全长为786 bp,其开放阅读框也是由基因全长组成,编码261个氨基酸。序列同源性分析显示,黄河裸裂尻鱼与其他9种鲤科鱼类3个亚基在基因和氨基酸序列上均有较高的同源性,虽然不同物种亚基基因间存在序列差异,但是所编码的氨基酸序列却趋于一致,揭示了鲤科鱼类细胞色素C氧化酶在线粒体呼吸链电子传递中的功能稳定性。黄河裸裂尻鱼与滇池金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)在COⅠ和COⅡ亚基上均存在相同位置、相同种类和相同数量的功能位点,而且在基于COⅠ亚基基因和氨基酸序列、COⅡ及COⅢ亚基基因序列的系统发育树中聚在同一支上,表明两者具有较近的亲缘关系,该结论与裂腹鱼亚科鱼类起源于晚第三纪广泛分布于青藏地区的喜温性原始鲃类的观点相一致。
- 晁燕祁得林申志新王国杰杨成
- 关键词：系统发育
- 青海省藏系绵羊种质资源遗传多样性评价及其选育提高方案研究
- 祁得林毛学荣王志有晁燕洒威杨葆春李太平张军霞繁萍谢昌元张延生
- 项目针对青海省藏系绵羊整体体质下滑，生产性能下降，种质资源保护薄弱，但又缺乏相应的遗传学基础数据，选育提高进展缓慢的现状。通过线粒体细胞色素b基因(Cyt b)和D-loop序列的直接测序方法，研究了青海省4种表型类型藏...
- 关键词：
- 关键词：绵羊遗传多样性评价品种选育
- 利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员
- 2020年
- 淡水钩虾是重要的环境指示生物,尤其是细胞色素P450家族成员的表达可作为早期预警的生物标记。为了鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员,采用Illumina Hiseq^TM2500高通量测序技术对青海钩虾转录组进行测序,并对P450家族成员进行分析鉴定。结果表明:青海钩虾中共获得了273507个转录本,总长为167791835 bp,隶属于233462个unigene,大小为137818327 bp。从转录本中鉴定到青海钩虾14个细胞色素P450家族成员,大部分基因均获得了全长序列60%以上的片段。
- 郑志琴陈祺昌刘丹章昭晁燕祁得林
- 关键词：高通量测序转录组细胞色素P450
- 青海省都兰县羊亚科野生动物残体的分子鉴定被引量：1
- 2017年
- DNA条形码(DNA barcode)已被广泛用于野生动物的物种鉴定、身份识别、系统发生等领域的研究。本研究利用DNA条形码技术对青海省都兰县宗加镇收集到的羊亚科野生动物残体进行了分子鉴定。结果表明:在13份羊亚科野生动物残体中成功获得3个样品的细胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)基因全长序列,通过生物信息学和系统发育关系分析显示,来自野外分化头骨齿髓和1份皮张样品的Cyt b基因序列与盘羊的基因序列聚在一起,结合都兰县羊亚科动物的分布格局,推测这2个样品可能属于盘羊组织;而来自腿骨骨髓的Cyt b基因序列与岩羊已发表序列聚在一起,共同形成一个单系群,推测腿骨样本可能属于岩羊个体。研究结果揭示,无论是从序列差异还是系统发育关系,细胞色素b基因序列作为DNA条形码均可确切鉴定羊亚科的物种。
- 晁燕祁世荣
- 关键词：分子鉴定
- 花斑裸鲤胚胎/仔鱼型血红蛋白基因家族成员鉴定与时序表达研究被引量：1
- 2022年
- 为了探讨花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)血红蛋白时序转换利用花斑裸鲤全基因组数据鉴定胚胎/仔鱼型血红蛋白基因家族成员,并通过整胚原位杂交方法,检测花斑裸鲤胚胎/仔鱼型血红蛋白基因在胚胎发育不同阶段的表达及定位。结果表明,花斑裸鲤基因组中共鉴定到5个胚胎/仔鱼型血红蛋白基因,分别为hbae1、hbae4、hbae5、hbbe1和hbbe3,与斑马鱼(Danio rerio)相比,花斑裸鲤基因组缺少hbae3和hbbe2基因,暗示第四轮全基因组复制事件后所经历的小规模基因删除事件在花斑裸鲤特异性血红蛋白基因形成中发挥了重要作用。整胚原位杂交结果显示,hbae1基因在胚胎发育的120h至432h内持续表达,hbbe1基因在96h开始表达持续至432h,hbbe3基因杂交信号出现在胚胎发育120h至384h内,在胚胎发育全过程中未能观察到hbae4和hbae5基因的杂交信号。杂交信号主要位于胚胎正中轴、后部侧向中胚层、背主动脉腹侧区、尾部造血区及卵黄。正义探针作为阴性对照,在胚胎发育阶段均无任何杂交信号。花斑裸鲤具有与其他鱼类不同的胚胎/仔鱼型血红蛋白基因家族成员及血红蛋白转换表达特征;hbae1、hbbe1和hbbe3基因在花斑裸鲤早期胚胎发育过程中发挥重要作用,而hbae4和hbae5基因的生物学功能可能有所弱化。
- 王发艳刘丹高强晁燕聂苗苗杨朝杰倪伟琳王丽晗祁得林
- 关键词：血红蛋白基因胚胎发育
- 藏系绵羊mtDNA遗传结构及多样性研究被引量：5
- 2015年
- 为了研究青海地区藏系绵羊遗传结构、多样性和母系起源,采用PCR扩增和直接测序方法获得了青海地区高原型、欧拉型、山谷型和青海黑藏羊8个群体共187个个体的mtDNA D-loop序列片段,对序列数据进行遗传多样性、遗传结构、系统发育和网络关系分析。结果显示,187个个体均获得长度为527bp的mtDNA D-loop序列片段,共定义了94个单倍型。青海地区高原型藏羊具有较高的遗传多样性,而欧拉型和青海黑藏羊遗传多样性相对较低,这与各类群藏系绵羊在青海地区的资源现状、分布范围相适应。种群间遗传分化及AMOVA分析均显示,欧拉型与其他类群间存在较显著的遗传分化,其余类群间分化不明显。系统发育分析表明青海地区藏系绵羊可能有3个母系起源,与以往研究相一致。
- 晁燕毛学荣雷良煜祁世荣王志有张军霞祁得林
- 关键词：MTDNA藏系绵羊
- 裂腹鱼亚科鱼类Hif-α基因的分子进化及低氧诱导表达
- 2019年
- 目的 探究低氧诱导因子Hif-α在裂腹鱼亚科鱼类适应低氧环境中的作用及表达调控。方法 利用RT-PCR技术获得了裂腹鱼亚科鱼类13个代表物种的Hif-1αΑ、Hif-1αB、Hif-2αΑ和Hif-2αB基因编码区序列,基于裂腹鱼亚科鱼类系统进化关系开展了基因选择压力分析,并选取花斑裸鲤进行低氧诱导表达研究。结果 Hif-1αΑ、Hif-1αB、Hif-2αΑ和Hif-2αB基因编码区长度分别为2196、2325、2544和2511 bp。通过序列比对发现裂腹鱼亚科鱼类HIF1αΑNODD结构域中保守脯氨酸羟基化基序LxxLAP发生缺失,特化及高度特化的裂腹鱼的HIF1αBCODD结构域中脯氨酸羟基化基序突变为PxxLAP。与常氧组相比,在重度缺氧条件下花斑裸鲤的脑和心脏组织中部分Hif-α基因表达量显著下降,在中度低氧中心脏组织中的Hif-1αA和Hif-2αA基因表达量上调。结论 Hif-α基因在13个物种中受到正向选择作用,但具体物种分支有待进一步研究,同时裂腹鱼亚科鱼类在适应慢性低氧和急性低氧环境可能存在两种不同的表达调控机制。
- 吴蓉蓉晁燕赵永丽陈祺昌郑志琴夏明哲祁得林
- 关键词：低氧诱导因子分子进化低氧环境
- 黄河裸裂尻鱼肌酸激酶M-CK cDNA的克隆及组织表达分析被引量：3
- 2016年
- 肌酸激酶(CK)能够催化磷酸基在二磷酸腺苷(ADP)和磷酸肌酸之间的可逆性转移,在细胞能量代谢过程中发挥重要作用。本研究利用RT-PCR和RACE方法克隆了黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)肌酸激酶基因全长c DNA序列,并进行了生物信息学分析和系统发育关系研究。黄河裸裂尻鱼肌酸激酶c DNA全长1 599 bp,开放阅读框(ORF)1 143 bp,编码380个氨基酸,具有典型的N-端结构域和C-端催化结构域。氨基酸序列同源性分析表明,黄河裸裂尻鱼肌酸激酶与斑马鱼(Danio rerio)和鲤(Cyprinus carpio)M3-CK有较高的同源性,其序列一致度达94%以上。系统发育分析显示,黄河裸裂尻鱼肌酸激酶与斑马鱼和鲤的M3-CK聚在一支,形成一个单系群,初步判定克隆获得的黄河裸裂尻鱼肌酸激酶基因可能与鲤和斑马鱼M3-CK是直系同源基因。利用Real-time PCR方法检测和分析了黄河裸裂尻鱼主要组织肌酸激酶m RNA表达水平,肌肉、肠、眼、心中肌酸激酶转录本表达较高,在肝胰脏和脑中表达微弱。肌酸激酶在肌肉、肠、和心中高表达与其能量代谢功能相适应,而在眼组织中的高表达是否与肌酸激酶的其他功能相关,有待于进一步研究。
- 孔庆辉晁燕夏明哲李长忠祁得林
- 关键词：肌酸激酶基因克隆
- 线上线下混合教学模式下课程教学探索——以“动物遗传学”为例被引量：7
- 2021年
- 面对重大公共突发事件,教育部提出了"停课不停教、停课不停学"的要求,各高校及教师选择了不同的网络教学工具,开展了在线直播和线上互动等形式的完全线上教学方式积极应对突发情况,给学生提供与传统教学方式不同的教学形式。以什么样的方式将线上教学与线下教学有效融合,以改变传统教学模式,充分应用网络教育平台,激发学生的学习兴趣,提高教学效果是我们每一位教育工作者需要考虑的问题,基于此,以"动物遗传学"课程为例,将以前传统教学方式结合线上教学的经验,对线上线下混合式教学进行相应调整和有效融合,以期能有效提高"动物遗传学"课程教学质量。
- 张军霞祁得林晁燕
- 关键词：动物遗传学教学设计
- 拟鲶高原鳅黄河和大通河种群的遗传多样性和分化水平研究被引量：7
- 2011年
- [目的]探究拟鲶高原鳅(Triplophysa siluroides)黄河种群与大通河种群的遗传多样性和分化水平。[方法]采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序方法获得拟鲶高原鳅线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cytb)基因的全序列。[结果]拟鲶高原鳅2个种群共47个个体均获得Cytb基因的全长序列(1140 bp),共定义了12个单倍型。拟鲶高原鳅黄河种群遗传多样性低于大通河种群。[结论]人类活动的影响和引入外来种可能引起了拟鲶高原鳅黄河种群遗传多样性的下降;同时,拟鲶高原鳅黄河种群和大通河种群间存在显著的分化,建议在实践中应将2种群分开管理和保护。
- 晁燕申志新王国杰杨成祁得林
- 关键词：线粒体细胞色素B基因种群分化
