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李慧仙
作品数:
5
被引量:5
H指数:1
供职机构:
中国医学科学院北京协和医学院药物研究所
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发文基金:
中央高校基本科研业务费专项资金
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相关领域:
生物学
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合作作者
朱平
北京协和医学院药物研究所天然药...
梁潇
中国医学科学院北京协和医学院药...
陈天娇
中国医学科学院北京协和医学院药...
王芬
中国医学科学院北京协和医学院药...
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作者
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朱平
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李慧仙
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陈天娇
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梁潇
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7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-2基因突变库与高通量筛选体系的构建
对7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-2基因进行定向进化的初步研究,确定易错PCR条件、优化克隆连接方法、建立基于48微孔板高通量筛选模型.利用易错PCR技术对Lxyl-p1-2基因进行随机突变,比较不同浓度Mg2+...
李慧仙
朱平
关键词:
易错PCR
7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-2基因突变库与高通量筛选体系的构建
2013年
对7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-2基因进行定向进化的初步研究,确定易错PCR条件、优化克隆连接方法、建立基于48微孔板高通量筛选模型。利用易错PCR技术对Lxyl-pl-2基因进行随机突变,比较不同浓度M聋’进行易错PCR,每组随机挑取10个克隆进行测序。序列分析表明:在M聋’浓度为7mmol/L条件下,碱基平均突变率为0.12%,即对于Lxyl-p1-2基因(2.4kb)来说,每个基因序列平均有3个碱基突变,达到构建突变文库的频率要求,选择该条件作为易错PCR条件。利用in-fusion技术将Lxyl-p1-2突变基因克隆到pPIC3.5K载体中,获得大量重组突变质粒。该研究优化了in-fusion连接反应中基因片段和载体片段的摩尔比,并探讨了基因片段与载体片段问同源序列长度对in—fusion连接效率的影响。试验结果表明:基因片段与载体片段的摩尔比最佳梯度为5:1;同源序列长度的选择成为影响in—fusion连接效率的关键因素之一。当同源序列长度为100bp时连接效率达到最大值,且显著高于同源序列长度为15~50bp的连接效率,此时阳性重组率提高至90%左右。与常规酶切一连接法相比,in-fusion法具有明显优势,同时将克隆周期由3~4d缩短为1~2d。挑取单菌落,在48微孔培养板上进行培养、诱导表达2d后,取菌液进行酶活测定(底物PNP-Xyl)。以野生型为例,β-木糖苷酶的酶活013405均数μ=3.415,其数据组标准差为δ=±0.078,数值符合正态分布的原理,建立统计学野生型均数分布范围和48微孔板高通量筛选,为后续突变体筛选提供基础。
李慧仙
朱平
关键词:
易错PCR
具有β‑木糖苷酶和β‑葡萄糖苷酶双重活性的糖基水解酶突变体及其应用
本发明提供了一系列糖基水解酶LXYL‑P1突变体蛋白,这些突变体蛋白具有β‑木糖苷酶和/或β‑葡萄糖苷酶活性,均能专一性地从7‑木糖紫杉烷类化合物上水解去除木糖基,本发明涉及这些突变体的氨基酸序列以及编码这些氨基酸序列的...
朱平
梁潇
王芬
李慧仙
陈天娇
文献传递
同源区段长度对In-Fusion技术连接效率的影响
被引量:5
2013年
目的在目的基因原载体(DNA 模板)与克隆载体相同的条件下,探讨了 PCR 扩增片段(含目的基因)的末端与载体间同源区段长度对 In-Fusion 连接效率的影响,并建立以In-Fusion 技术为基础的高通量克隆方法。方法以糖基水解酶 Lxyl-p1-2(2.4 kb)基因突变库的构建为例,设计引物使目的基因的两端分别与线性化载体末端含有15~200 bp 重叠序列,并通过易错 PCR 方法获得含目的基因的 PCR 扩增片段,运用 In-Fusion 技术将 PCR 扩增片段定向克隆至表达载体 pPIC3.5K 中。结果对于长度大约为2.4 kb 的较大片段 DNA 的克隆, PCR 扩增片段的末端与载体间最适同源区段长度约为100 bp,此时连接效率最高,其阳性重组率高达90%左右,是常规酶切连接法的3倍。与后者相比,该技术将克隆周期由3~4 d 缩短为1~2 d。结论优化的同源区段长度可以显著提高 In-Fusion 技术对于2.4 kb 目的基因与载体的连接效率,该方法尤其适用于定向进化过程中基因突变库的构建。
李慧仙
朱平
关键词:
高通量克隆
具有β-木糖苷酶和β-葡萄糖苷酶双重活性的糖基水解酶突变体及其应用
本发明提供了一系列糖基水解酶LXYL‑P1突变体蛋白,这些突变体蛋白具有β‑木糖苷酶和/或β‑葡萄糖苷酶活性,均能专一性地从7‑木糖紫杉烷类化合物上水解去除木糖基,本发明涉及这些突变体的氨基酸序列以及编码这些氨基酸序列的...
朱平
梁潇
王芬
李慧仙
陈天娇
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