李科
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
- 供职机构：西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室更多>>
- 发文基金：国家烟草专卖局基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- ACLSV山东苹果分离物基因重组及CP序列多样性分析被引量：4
- 2015年
- 【目的】明确苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)山东苹果分离物全基因组的分子特征、潜在重组事件及CP基因的多样性。【方法】采用RT-PCR分段扩增、克隆、拼接获得ACLSV全基因组序列,对其进行分子特征描述,并与已报道的16条全长基因组或近全长基因组序列进行比较和系统发育分析,同时扩增其CP进行多样性分析。【结果】扩增得到ACLSV山东苹果分离物QD-13全基因组序列(Gen Bank登录号KJ522693),QD-13全长7 557 nt,包含3个ORF。构建进化树分析表明,QD-13与日本苹果分离物B6聚为一簇,二者相似性最高,为85.9%。17条ACLSV分离物基因组分段比较表明,5′端和3′端差异较大;ORF3保守性相对较高,除分离物Ta Tao 5和MS外,其推导的氨基酸序列相似性均在91.2%以上。ORF1编码区527—665 aa区域保守性差,所比较的17条序列在该区域的相似性为15.4%—59.7%。基因组重组分析以P≤0.05为标准,3种以上算法同时检测到则为有意义重组事件,结果显示,QD-13存在3个重组事件,它们分别发生在6 507—6 247、6 397-6 497和3 851—4 760 nt。扩增QD-15、QD-20和YT-24分离物ACLSV的CP,共获得22条序列,可分为3种类型。对CP氨基酸序列进行比对分析表明,3种类型为不同氨基酸保守位点的组合,分别是Met60-Ser73-Ser79-Asp82-Asn97-Gly98、Leu59-Met83-Ile193和Ala40-Leu60-Ala72-Phe75-Ile86-Arg88-Ser130-Gly137-Met184。【结论】报道了中国ACLSV苹果分离物的完整基因组序列;明确了其基因组分子特点并发现了3个主要的潜在重组事件;ACLSV山东苹果分离物CP存在3种序列类型,具有丰富的多样性。
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- 关键词：苹果褪绿叶斑病毒基因组外壳蛋白
- 重庆丰都烟区田间烟草病毒病及其Dot-ELISA检测被引量：10
- 2016年
- 为明确重庆市丰都烟区田间烟草病毒病的发生情况,开展了病毒病调查,并于还苗期、伸根期、旺长期和成熟期共采集病毒病样品117 份,利用TMV、CMV、PVY、TEV、PVX、TuMV 和BBWV-2 等7 种病毒的特异性抗体对其进行Dot-ELISA检测.调查发现,病毒病症状主要包括花叶、畸形、坏死斑、脉坏死、矮化和蚀纹等类型.9 个调查点烟草病毒病的发病率在28%～84%,病情指数最低为6.67,最高为60.89.Dot-ELISA 检测结果表明,还苗期样品未检出病毒;伸根期没有检测到PVX;旺长期和成熟期均检测到7 种病毒,其中TMV 和CMV 的检出率较高,其次为TuMV 和PVY,PVX 的检出率较低.此结果表明,烟草病毒病在丰都烟区发生较普遍,且TMV 和CMV 为田间烟草病毒病的优势毒源.
- 时洪伟刘陈晨李科孙淼代先强马冠华青玲
- 关键词：烟草病毒病病毒种类DOT-ELISA检测
