梁瑾
- 作品数：3 被引量：24H指数：3
- 供职机构：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- B细胞表位预测方法研究进展被引量：18
- 2009年
- B细胞抗原表位预测方法的研究对基础免疫学的研究及实际应用有着重要的意义。本文归纳了理论预测B细胞表位的常用方法,并对目前预测B细胞表位方法存在的问题进行了分析。
- 梁瑾王靖飞
- 关键词：B细胞表位
- 氨基酸序列集熵值计算工具实现及应用被引量：3
- 2008年
- 氨基酸序列保守区和可变区分析是蛋白质结构和功能分析预测的关键环节。本研究根据该需求,编写了Entropy软件,实现了氨基酸序列集熵值计算、统计分析和优势序列模型自动生成等功能,并利用其对A型流感病毒血凝素氨基酸序列的特征进行了分析。该软件为氨基酸序列集保守性分析提供了可靠工具。
- 徐进冯宝龙王清艳梁瑾王靖飞
- 关键词：流感病毒血凝素生物信息学
- 异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位被引量：3
- 2010年
- 为了对异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位的可行性进行分析,本研究基于蛋白质相互作用界面的形状互补理论,使用异源抗体(来自于抗原抗体复合物1G9M、1RVF、1TPX、1NCA、1A2Y)的晶体结构同流感病毒血凝素(A/Aichi/2/68(H3N2))的晶体结构进行刚性分子对接,通过计算B细胞表位的预测表面和实际表面C-α原子之间的RSMD以及表位氨基酸的准确率,分析用异源抗体探测出血凝素B细胞表位的可能性。结果表明,不同的异源抗体均可结合到A/Aichi/2/68(H3N2)的已知B细胞表位,最佳的对接构象与原晶体结构重叠后表位残基C-α原子的均方根偏差均小于0.6埃,表位氨基酸预测的准确性大于60%,说明异源抗体对接方法可以尝试用于B细胞构象表位的预测。
- 梁瑾王靖飞吴春艳冯宝龙
- 关键词：分子对接
