王星懿
- 作品数：5 被引量：15H指数：1
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- 玉米大斑病菌MAPK超家族的全基因组鉴定及途径模型建立被引量：15
- 2014年
- 【目的】从全基因组水平鉴定玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)的MAPK超家族基因,并对其进行系统进化、基因结构、多重序列比对及保守位点分析,构建玉米大斑病菌中的MAPK级联途径模型,为深入研究该植物病原菌中MAPK级联途径的功能奠定基础。【方法】利用玉米大斑病菌基因组数据库,通过基于隐马尔科夫模型的HMMER 3.0软件搜索基因组,鉴定并获得MAPK超家族成员序列、基因组定位信息;采用MEGA 5.0软件进行系统进化分析;通过GSDS工具进行基因结构分析;利用ClustalX、MEME工具分析MAPK蛋白激酶区的保守性及保守位点。【结果】在玉米大斑病菌基因组中发现了4个MAPK基因、3个MAPKK基因和3个MAPKKK基因。系统进化分析将MAPK分为Kss1/Fus3、Slt2、Hog1及Ime2 4类;MAPKK分为Pbs2、Ste7及Mkk1 3类;MAPKKK分为Ste11、Bck1及Ssk2 3类。基因组定位及基因结构分析表明,MAPK超家族散布在基因组中,且MAPK基因的结构最为复杂多样,MAPKK次之,MAPKKK结构最简单。多重序列比对与保守位点分析表明,玉米大斑病菌MAPK超家族的激酶结构域均高度保守,其中MAPK具有保守的"-TxY-"磷酸化位点,MAPKK含有保守的"-SD[V/I]WS-"磷酸化位点,MAPKKK含有"-G[S/T][V/P][F/M][W/Y]M[A/S]PEV-"特异性保守位点。【结论】全基因组分析表明,玉米大斑病菌中包括4个MAPK基因、3个MAPKK基因和3个MAPKKK基因。通过系统进化、基因结构及多重序列比对和保守位点分析,在玉米大斑病菌中构建了Fus3/Kss1-homolog、Slt2-homolog、Hog1-homolog和Ime2-homolog4条MAPK级联途径,其中Ime2 homolog为一条新发现的MAPK级联途径。该信息为深入解析植物病原真菌MAPK超家族的功能奠定了基础。
- 巩校东张晓玉田兰王星懿李坡张盼王玥范永山韩建民谷守芹董金皋
- 关键词：玉米大斑病菌系统进化
- 棉花抗黄萎病遗传位点挖掘及变异分析
- 黄萎病(Verticillium wilt)是棉花生产毁灭性病害,严重影响产量和棉纤维品质。鉴定抗性遗传变异、挖掘抗病相关基因对于棉花抗黄萎病遗传改良具有重要意义。本研究利用大丽轮枝菌强致病力菌系Lx2-1和中等致病力菌...
- 张艳陈斌孙正文崔彦茹柯会锋王志城王国宁吴立强张桂寅李志坤杨君吴金华阎媛媛王星懿王省芬马峙英
- 关键词：陆地棉黄萎病全基因组关联分析
- 优质高产品种派生RIL群体与重测序鉴定新的棉花QTL和基因
- [背景]作物重要目标性状数量性状位点（Quantitative trait locus,QTL）定位是开展基因图位克隆和分子标记辅助育种的重要基础。陆地棉作为棉花主要栽培种之一,具有适应性广、产量高的优良特性,其面积占全...
- 王省芬谷淇深柯会锋张艳李志坤吴立强张桂寅杨君王国宁张冬梅吴金华阎媛媛崔彦茹吴立柱王星懿马峙英
- 关键词：棉花纤维品质QTL定位
- 优质高产品种派生RIL群体与重测序鉴定新的棉花QTL和基因
- 【研究背景】作物重要目标性状QTL定位是开展基因图位克隆和分子标记辅助育种的重要基础。陆地棉作为棉花主要栽培种之一,具有适应性广、产量高的优良特性,其面积占全球棉花的90%以上。目前,研究者针对棉花纤维品质、产量、抗逆性...
- 王省芬谷淇深柯会锋张艳李志坤吴立强张桂寅杨君王国宁吴金华阎媛媛张冬梅崔彦茹吴立柱王星懿马峙英
- 关键词：棉花纤维品质QTL定位
- 文献传递
- 组织特异性表达GhnsLTPs介导苯丙烷代谢流重定向协调了棉花抗病虫性
- 生产上棉花经常遭受病虫害侵袭,利用遗传抗性是最经济有效的防治策略。目前作物上鉴定的具有一因多效的基因或位点鲜有报道。本研究基于陆地棉核心种质全基因组关联分析鉴定到At10染色体上存在的1个显著关联的抗病位点,结合转录组数...
- 陈斌张艳孙正文柯会锋王国宁吴立强张桂寅杨君李志坤崔彦茹吴金华阎媛媛王星懿王省芬马峙英
- 关键词：陆地棉抗病虫性
