袁芳
- 作品数：14 被引量：52H指数：4
- 供职机构：宁夏回族自治区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：宁夏回族自治区卫生厅科研项目宁夏回族自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 从1例急性弛缓性麻痹患儿分离到的埃可病毒33型全基因组序列分析
- 2023年
- 目的了解2015年宁夏地区埃可病毒33型(echovirus type 33,E33)分离株基因特征,为今后的科学防控提供参考。方法将2015年急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)监测系统中收集到的病例粪便标本和密切接触者粪便标本按照监测方案要求进行处理后,接种于人恶性胚胎横纹肌瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞,分离获得病毒后,提取病毒RNA,通过扩增肠道病毒完整VP1区序列鉴定型别,选取2株采用Illumina全基因测序方法进行全基因组序列测定。用MegaX、DNAstar进行遗传进化分析,利用RDP4和SimPlot3.5.1进行重组分析。结果分离的4株毒株均扩增到完整VP1区序列,鉴定为E33病毒,将测序获得的2株全基因组序列与GenBank中下载的E33原型代表株Toluca-3的全基因组序列比较,核苷酸相似性为79.9%,氨基酸同源性为95.7%。基于E33 VP1区843 bp核苷酸序列构建系统进化树,宁夏地区分离到的E33分离株属于C2亚型,与湖南、江苏、新疆等地流行的E33属于同一亚型,氨基酸序列同源性和核苷酸序列相似性较高。基于全基因组序列和P1、P2、P3区序列分别构建系统进化树,结果显示宁夏地区流行的E33在全基因组进化树上与新疆地区流行的EV-B85聚类,未与E33原型株聚类。宁夏地区流行的E33在P1区基因进化树上与E33原型株聚类,在P2、P3区基因进化树与EV-B85聚类。用RDP4和Sim Plot3.5.1软件进行重组分析后证实宁夏地区流行的E33为重组株,在P1区与E33原型株重组,在P3区与EV-B85重组。结论宁夏地区流行的E33为E33原型株和EV-B85重组形成的新的重组病毒,有关该重组株的致病性有待进一步的研究。
- 袁芳周娟曹慜张薇马学旻马江涛魏新峰马学平王青利
- 关键词：急性弛缓性麻痹肠道病毒全基因组遗传进化分析
- 一种用于收集空气中呼吸道病毒采样装置
- 本实用新型公开了一种用于收集空气中呼吸道病毒采样装置，包括装置主体和设置在装置主体外壁的拆卸机构，所述拆卸机构包括卡合组件，通过设置卡杆，当在通过病毒采样装置对病毒进行采样时，为了提高对不同尺寸粒径的滤网和采集盒进行便捷...
- 马学平蒯文和张银豪吴忠兰詹军裴建新孙晓强杨东智曹慜袁芳李龙山张薇穆婷
- 2013-2014年宁夏甲型H1N1流感病毒血凝素基因变异状况及序列分析
- 目的 了解2013-2014 年度宁夏甲型H1N1 流行性感冒(流感)病毒的检测情况和血凝素(HA)基因变异情况.方法 对全区流感监测哨点医院采集的流感样病例(ILI)标本采用real time RT-PCR 方法进行核...
- 孙晓强温秋芳陈晓梅袁芳马学旻马江涛詹军
- 关键词：甲型H1N1流感病毒血凝素基因测序
- 一种快速鉴别新型冠状病毒型别的试剂盒及方法
- 本发明公开了一种快速鉴别新型冠状病毒型别的试剂盒及方法，该试剂盒包括荧光标记探针和引物对：引物对包括用于扩增与新冠病毒ORF1ab区互补的cDNA的引物对1和用于扩增与新冠病毒ORF8区互补的cDNA的引物对2；荧光标记...
- 马江涛蒯文和张银豪赵建华马学平袁芳曹慜马学旻高建炜刘翔赵军李海军
- 一种可快速鉴别新冠病毒的试剂盒
- 本实用新型涉及病毒检测装置领域，具体公开了一种可快速鉴别新冠病毒的试剂盒，包括常温室和低温室，低温室内设置有若干支撑杆，支撑杆底端与低温室底壁转动连接，每个支撑杆上端固定设置有限位盘，限位盘上开设有若干限位槽，限位槽为倒...
- 赵建华马江涛蒯文和张银豪马学平刘翔袁芳曹慜马学旻
- 文献传递
- 一种便携式呼吸道传染病标本采集防护装置
- 本实用新型公开了一种便携式呼吸道传染病标本采集防护装置，涉及医疗器械技术领域。包括，透明面罩,所述透明面罩的边缘处固定连接有固定圈，所述固定圈的两侧均固定连接有两个弹力带，两个所述弹力带的另一端固定连接有三角连接片，一侧...
- 马学平赵建华蒯文和张银豪吴忠兰裴建新马江涛杨东智曹慜李龙山孙晓强袁芳穆婷詹军
- 宁夏地区2011年病毒性腹泻病例病原学研究被引量：9
- 2014年
- 目的：了解2011年宁夏地区腹泻病例中轮状病毒（HRV）、杯状病毒（HuCV）、星状病毒（HAstV）及肠道腺病毒（HAdV）感染情况。方法2011年收集宁夏不同地区腹泻病例的粪便标本，采用ELISA法检测A组HRV，阳性标本采用RT-PCR法进行分型鉴定；采用RT-PCR或PCR法检测HuCV、HAstV和HAdV。结果共收集腹泻病例粪便标本690份，其中HRV占2.17%（15/690）、HuCV占21.74%（150/690）、HAstV占3.19%（22/690）、HAdv占6.52%（45/690）、混合感染占4.20%（29/690）。15份HRV G血清型与P基因型以G1、G3、P[4]型为优势株。结论2011年宁夏地区病毒性腹泻主要以＜2岁婴幼儿为主，HuCV是主要病原体。
- 詹军马江涛陈慧袁芳马学旻刘翔郝琼
- 关键词：病毒性腹泻杯状病毒星状病毒肠道腺病毒
- 一种新冠病毒核酸检测阳性质控品及其制备方法和用途
- 本发明属于病毒检测技术领域，涉及一种新冠病毒核酸检测阳性质控品及其制备方法和用途，所述阳性质控品由假病毒培养物，与扩增标签基因的引物、探针和RT‑PCR反应液共同组成，所述假病毒培养物由ORF1ab基因、N基因、E基因和...
- 马江涛蒯文和张银豪赵建华马学平高建炜刘翔袁芳曹慜魏开心石安琪
- 文献传递
- 宁夏地区1997--2011年急性弛缓性麻痹病例非脊髓灰质炎肠道病毒分型鉴定分析被引量：1
- 2012年
- 目的对1997--2011年宁夏地区急性弛缓性麻痹（AFP）病例中分离的73株非脊髓灰质炎肠道病毒（NPEV）进行分型鉴定。方法采用简并引物RT-PCR对分离株进行VPl区基因扩增和序列测定，测序结果进行BLAST比较和基因进化分析。结果经过基因测序分析鉴定，73株NPEV中，有4株无法定型，另69株共包括27个血清型，分别属于A组肠道病毒（HEV-A）和HEV-B组，无HEV-C和HEV-D组毒株，其中HEV-A组毒株包括8个血清型23株，HEV-B组毒株包括19个血清型46株。69株病毒中，以EV71所占比例最大（9／69），以CVA4、CVA16、Ech024、Ech06和CoxA9所占比例较高。结论1997--2011年宁夏地区AFP病例分离的NPEV以HEV-B组为主要型别66．7％（46／69）。
- 马江涛陈慧袁芳马学旻关光玉詹军
- 关键词：非脊髓灰质炎肠道病毒流行病学
- 2015-2021年宁夏腹泻病例中人星状病毒分子流行病学特征分析
- 2024年
- 基于宁夏食源性疾病监测系统研究宁夏地区2015-2021年15家哨点医院腹泻病例中的人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)感染状况,流行病学特点和基因特征。对收集的粪便标本,采用Real-time PCR方法筛选出的HAstV阳性标本,进行了回顾性分析。通过逆转录PCR对保存的HAstV阳性样本进行测序和基因分型,确定宁夏地区HAstV流行的基因型别和遗传进化。2015-2021年共收集腹泻病例标本8586例,HAstV阳性率为5.9%(513例),其中单独HAstV感染293例(占57%),和其它病毒共同感染220例(占42%),共同感染中与轮状病毒和诺如病毒GII组感染最多见,其次是两种以上病毒感染。感染发生在所有年龄组,5岁以下儿童的阳性率最高(8.0%),11-20岁年龄组阳性率最低(1.9%)。感染全年发生,一月和六月高发。对保存的168份HAstV单独阳性标本进行测序分析,测序获得94条HAstV基因序列,经鉴定为5种基因型别,分别是HAstV-1、HAstV-2、HAstV-3、HAstV-4、 HAstV-5,其中HAstV-1型为最常见的基因型(占61.7%),其次是HAstV-5(占19.1%)和HAstV-4(占15.9%)。系统发育分析显示HAstV-1分别属于HAstV-1a和HAstV-1b亚型,HAstV-1a较常见。HAstV-5和HAstV-4分别属于HAstV-5c和HAstV-4c亚型。全人群均可感染星状病毒,但主要受影响为5岁以下儿童。HAstV-1型是宁夏地区流行的主要型别,同时存在HAstV-1a和HAstV-1b、HAstV-4c、HAstV-5c共循环。
- 袁芳蒯文和曹慜马学平魏新峰马江涛张薇
- 关键词：病毒性腹泻星状病毒基因特征
