陈世芝
- 作品数：11 被引量：30H指数：3
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- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学理学医药卫生更多>>
- 天花粉蛋白1.73分辨率结构测定及其精化被引量：8
- 1993年
- 本文报道了用面探测器收集一套1.73分辨率天花粉蛋白(TCS)正交晶体的X射线衍射数据,利用已知的α苦瓜子蛋白模型,取10—4范围的TCS强度数据,应用分子置换法测定了晶体结构,并且采用限制参数最小二乘法在10—1.73分辨率范围内修正模型结构。修正结果,晶体学R因子为0.186,键长标准偏差为0.013,键角标准偏差为2.48°,一个不对称单位中找到133个水分子。本文详细描述了天花粉蛋白分子的结构、温度因子、氢键、结合水、保守残基的分布以及分子间相互作用。保守残基14Tyr的羟基与157位的羰基氧形成的氢键,对维持活性部位构象有重要作用;保守残基160Glu和它在活性部位的构象对酶的催化活性起着关键性作用。
- 高奔马星奇王耀萍吴伸陈世芝董贻诚
- 关键词：晶体结构分辨率天花粉蛋白
- Q156A天花粉蛋白的晶体结构研究被引量：1
- 1997年
- 核糖体失活蛋白（RIPs）是一类具有RNA N-糖苷酶活性的毒蛋白,它水解真核细胞28SrRNA第4324位腺苷酸的N-糖苷键,释放出一个腺嘌吟碱基,使核糖体失活。天花粉蛋白（TCS）是单链核糖体失活蛋白的重要代表。我们早已报道了天花粉蛋白0.173nm分辨率的晶体结构。关于天花粉蛋白结构与功能关系的深入研究,已经发表了天花粉蛋白与底物类似物的复合物晶体结构。我们还对一些保守残基的突变体进行了研究,其中R22LTCS和Y14F TCS的晶体结构已经测定,Arg22和Tyr14是位于活性口袋外,但与活性口袋又有密切联系的保守残基,其侧链形成的氢键也十分保守。在TCS晶体结构中还有一类保守残基形成的氢（盐）键也是十分保守的,它们是处于活性口袋之内的残基形成的,如Q156的NH_2与E189的OE2,Y111的OH与E160的OE2,R122的NH_2与E189的OE1等。为了探讨活性口袋内这些保守氢键对活性部位构象和活性的影响,我们用基因定位突变方法。
- 董贻诚朱日荣陈世芝李建辉邵鹏柱
- 关键词：突变体晶体结构天花粉蛋白核糖体失活蛋白
- 1.73分辨率天花粉蛋白晶体中的水结构被引量：1
- 1994年
- 本文报道的天花粉蛋白晶体中水的结构模型,包括了133个水分子,其中118个同蛋白的原子成氢键。天花粉蛋白内部有4个分立的水分子,其中2个水分子W251和W252分剔与A5螺旋变形部位的残基156Gln和157Ser的侧链成氢键,对维持活性部位的构象有贡献。晶体中水结构的比较结果表明,核糖体接近蛋白时,会诱导蛋白活性部位残基的构象发生变化,使各催化基团按催化效果最佳的构象排布,并激活一个水分子(W257)直接参与核糖体失活作用。
- 高奔马星奇王耀萍吴伸陈世芝董贻诚
- 关键词：天花粉核糖蛋白晶体
- 牛凝乳酶的结晶及其二硫键的化学修饰被引量：2
- 1991年
- 为了配合凝乳酶的蛋白质工程,围绕酶的纯化,结晶和二硫键的化学修饰进行了研究。实验结果表明采用FPLC Mono Q柱代替DEAE-纤维素柱层析可以提高同工酶A,B及其降解组分C的分离效果并缩短纯化时间。以10mg/ml的纯凝乳酶B为出发材料,在4℃1.4—2.0mol/L氯化钠条件下进行培养可以获得外形近似为正立方体晶体。化学修饰的结果证明,凝乳酶的三对二硫键处于酶分子不同的空间部位。0.72mmol/L DTT在pH6.3条件下能还原处于分子表面的一对二硫键,经溴化氰降解分肽测定为Cys^(250)-Cys^(283),还原后引起活力下降25%。在二硫键之间引入汞原子其活力与还原酶,羧甲基化酶的活力大体相同,说明Cys^(250)-Cys^(283)在维持凝乳酶具有活力的空间构象中起着一定的作用。
- 黄葵陈世芝杨开宇
- 关键词：二硫键化学修饰
- α－苦瓜子蛋白晶体结构中的次级相互作用的研究Ⅱ疏水相互作用的分析
- 1996年
- α－苦瓜子蛋白结构模型中共有疏水残基１４１个，占践基总数的５７％。其中１２８个疏水残基有相互作用，占疏水残基的９１％。疏水残基之间的相互作用与其是否在α－螺旋或β片层内没有多大关系。本文着重分析了α－螺旋间和α螺旋与β结构之间的疏水相互作用；讨论了α５和大β片层中疏水残基与亲本残基的分布特点，这一特点对该蛋白分子最后折叠成特定的空间结构有重要影响。类似的情况在同源蛋白天花粉蛋白中也是存在的。
- 董贻诚陈世芝朱曰荣王耀萍
- 关键词：疏水相互作用晶体结构
- 蛋白质晶体中的分子堆砌与晶体生长被引量：2
- 1990年
- 根据蛋白质晶体结构研究的结果,阐述了蛋白质晶体中分子堆砌模式和分子间的相互作用;并讨论了某些因素对分子堆砌及结晶的影响。
- 陈世芝
- 关键词：蛋白质晶体晶体生长
- 微重力下天花粉蛋白晶体生长初探被引量：2
- 1990年
- 报导了国内首次在微重力下进行蛋白质晶体生长的试验.与地面对照实验所生长的晶体相比较,在空间生长的多数天花粉蛋白晶体具有较完整的外形,初步展示了微重力条件对蛋白质晶体生长所具有的优越性.
- 陈世芝桂璐璐牛秀田谢殿霖毕汝昌
- 关键词：微重力花粉蛋白晶体
- α－苦瓜子蛋白晶体结构中的次级相互作用的研究──Ⅰ结构中氢键相互作用的分析被引量：1
- 1994年
- α－苦瓜子蛋白是一种单链核糖体失活蛋白，具有Ｎ－糖苷酶活性，２．０Ａ分辨率的三维结构已经测定。α－苦瓜子蛋白中总共有３５３个氢键，其中主链原子间氢键１６５个，主链原子与侧链原子间氢键５４个，侧链原子间氢键２１个，蛋白分子中原子与溶水剂的氢键１１３个，主链Ｃ＝Ｏ，主链ＮＨ及侧链分子结构中有９５％的残基能生成氢键，Ａｓｐ．Ｇｌｕ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ具有较强的生成多个氢键的能力，并对１３个没有任何氢键的残基作了分析。Ａｎ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、ＧｌＵ、Ｇｌｎ在α螺旋中出现税率较大，Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｔｙｒ、Ｉｌｅ、Ｔｈｒ在β结构中占了一半以上，Ａｒｇ容易形成远程的氢键，而Ｓｅｒ、Ｔｈｒ则容易形成近程氢键。某些氢键，特别是保守残基间的氢键，对形成蛋白分子局部特征构象和活性部位的特征构象有影响，α－苦瓜子蛋白的特定折叠方式对其与溶剂水分子成氢键有影响。
- 王耀萍陈世芝董贻诚任景山
- 关键词：氢键
- α-苦瓜子蛋白和β-苦瓜子蛋白紫外光谱的研究被引量：1
- 1995年
- 对α－ｍｍｃ及β－ｍｍｃ进行了溶剂微扰差光谱的研究及在不同温度条件下的光谱滴定，结合最新得到的α－ｍｍｃ的晶体结构进行了分析和讨论，并与天花粉蛋白的紫外光谱进行了比较。
- 陈世芝徐薇王耀萍董贻诚
- 关键词：紫外光谱
- 在不同物理化学条件下天花粉蛋白的圆二色性研究被引量：5
- 1989年
- 用圆二色谱研究了天花粉蛋白在酸性和碱性溶液中的构象,并观察了在十二烷基磺酸钠(SDS)溶液中天花粉蛋白分子构象的变化,用Chen,Yang与Martinez等人的方法计算了各种条件下天花粉蛋白二级结构含量.结果表明:在很宽广的pH范围内(从pH2到pH12)分子构象基本上是稳定的.但是,在强碱性条件下即pH>12(室温)或pH11.5(40℃)螺旋含量显著减少.在碱性条件下,于250nm附近出现一新的CD带,它的强度与离解的酪氨酸残基个数呈线性关系,说明这一新带主要是由离解的酪氨酸残基产生的.
- 陈世芝许文清董北
- 关键词：天花粉蛋白分子构象圆二色性
