黄大荣
- 作品数：16 被引量：11H指数：2
- 供职机构：昆明医学院更多>>
- 发文基金：云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：生物学理学医药卫生文化科学更多>>
- α-胰凝乳蛋白酶离子基团的离解常数的计算
- 2005年
- 研究了当离子基团从水中转至蛋白球中时,离解常数改变的测定.借助两种溶剂—N,N—二甲基甲(DMF)酰胺和甲酰胺(FA)模拟了近程相互作用的能量变化.考虑到处于蛋白球中的离子与它们周围的电解质溶液的相互作用,研究了Bornian溶剂化能的变化.由于在酶分子中存在内球静电场,研究了离子化能的变化.以上的每项效应对Asp-102-CO2-的能量都有较大的贡献,且相互补偿.
- 邱开雄付继军简虹吉玲黄大荣
- 关键词：离解常数
- 丝氨酸蛋白酶催化机制的量子化学研究(Ⅲ)被引量：2
- 1992年
- 本文提出并用CNDO/2法分析了以水分子作为Ser-195质子中间受体的质子转移模型系统,表明该系统酰化的活化势垒限制了Ser-195的质子及水分子与His-57的N^(ε_2)用氢键结合的质子,分别同步转移至水分子的氧原子和N^(ε_2)原子上的阶段。指出,在具有以水分子作为中问受体的模型中,在四面体的中间化合物完全形成以前,底物的质子化就开始了,而四面中间体仅形成质子化形式。提出了水分子可能是酰化酶去酰化阶段的亲核剂的假设。
- 黄大荣
- 关键词：丝氨酸蛋白酶
- N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺侧链构象的理论分析被引量：1
- 2007年
- 目的分析N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的非键和静电相互作用、拓朴能、键角的弯曲和氢键,研究它们的空间结构。方法当主链的最大构象可能性确定时,侧链的键角和两面角φ,ψ在每一点变化的情况下,用能量低化的方法得到了构象图,并评价了主链和侧链的空间的相互制约性。当主链为低能式而侧链具有最大拓朴势时,φ,ψ,χ_1-χ_5角的所有组合作为初始近似的情况下,计算了分子的优势构象.结果N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的稳定构象与赖氨酸残基在蛋白质中的已知结构的几何构型相符合.结论赖氨酸残基在蛋白质中构象即为赖氨酸孤立单肽的优势构象。
- 谢惠定邱开雄柳波简虹黄大荣
- 关键词：构象分析空间结构
- 丝氨酸蛋白酶催化机制的量子化学研究(Ⅰ)被引量：2
- 1991年
- 用半经验的MNDO/H法对在丝氨酸蛋白酶的活性中心形成四面中间体模拟反应的几个系统进行了研究。讨论了“催化三联体”各组份对增加丝氨酸羟基反应能力所起的作用。表明His和Asp间形成了强氢键,对降低丝氨酸和底物反应的活化能是重要的。分析了Ser和His、His和Asp间质子位置变化。考虑了底物变形对中间体形成能量的影响。
- 黄大荣
- 关键词：丝氨酸蛋白酶量子化学
- 丝氨酸蛋白酶催化机制的量子化学研究(Ⅱ)被引量：2
- 1991年
- 用半经验的 MNDO 法对几个模拟丝氨酸蛋白酶活性中心的系统作了研究,发现稳定化能与攻击基团的亲核能力密切相关。活化能的减少估计为9千卡/摩。表明氨键的形成并不能改变底物的形变。
- 黄大荣
- 关键词：丝氨酸蛋白酶
- 蛋白水解酶催化机制的研究被引量：1
- 2007年
- 用CNDO/2计算了模拟蛋白水解酶的不同底物中,酰胺键和酯键的电子参数及水解反应的中间四面体产物的电子特性,表明取代基的特性和羰基形成的氢键不影响酰胺基的电荷和键序.讨论了酰胺的电子状态与它的平面结构的曲变程度密切相关.指出在双环β-内酰胺中缺乏共振稳定性.在酰胺中,计算了不同杂化状态时,酰胺氮原子的不同pKa值.
- 邱开雄简虹付继军李映苓黄大荣
- 关键词：蛋白水解酶酰胺
- 对临床医学专业本科教育改革的初步设想被引量：1
- 2007年
- 随着科学技术和经济的发展,传统的医学教育已不适应现代社会对医学人才的需要,因此,国际教育专门委员会提出了"全球医学教育最低基本要求(GMER)",为了与该基本要求接轨,提出了对临床医学专业本科教学改革的初步设想.
- 杨凌黄大荣罗开元王爱莲李飞章宗籍杨玉萍袁桩李浩源
- 关键词：全球医学教育最低基本要求临床医学专业教育改革
- N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺对主链的理论构象分析被引量：3
- 2006年
- 目的考虑到N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的非键及静电相互作用、拓扑能、键角的弯曲和氢键,研究了它的空间结构即分析它的主链理论构象.方法当主链的最大构象可能性确定时,侧链的键角和两面角φ,ψ在每一点变化的情况下,用能量低化的方法得到了构象图,评价了主链和侧链的空间的相互制约性.当主链为低能式而侧链具有最大拓朴势时,φ,ψ,χ1-χ5角的所有组合作为初始近似的情况下,计算了分子的优势构象.结果N-乙酰基-L赖氨酸-甲酰胺的稳定构象与赖氨酸残基在蛋白质中的已知结构的几何构型相符合.
- 邱开雄谢惠定付继军黄大荣
- 关键词：构象分析空间结构
- 分子力学在构象分析中的应用被引量：1
- 2005年
- 主要采用MM2对一元取代和二元取代环已烷的构象进行了定量分析.在优化构象下,计算得到的结果与传统观念不相符;因此提出了前优化构象模型法,在前优化构象下的计算结果与传统观念完全一致.所以,可把前优化构象法应用于有机分子的构象分析中.
- 谢惠定黄燕郭蕴蘋柳波黄大荣
- 关键词：分子力学构象
- 胸腺肽及其一些合成类似物的定量构效关系研究
- 2008年
- 目的研究胸腺肽和受体相互作用的分子机制和全方位地寻找其药效基团.方法用理论构象分析法对胸腺肽的生理活性碎片Arg-Lys-Asp-Val-Tyr和它的[Lys1-Arg2]、[Glu3]和[Gly3]3个合成类似物的空间结构进行研究.结果Val和Tyr的低能结构及已知的优势构象作为该5肽结构变体的起始,当所有残基的主链和支链的旋转角变化时,它的能量降低.结论分子的可能构象是具有5种不同主链的构象.
- 简虹邱开雄付继军喻芳黄大荣
- 关键词：胸腺肽构效关系构象分析
