黄钟洲
- 作品数：4 被引量：10H指数：2
- 供职机构：南方医科大学珠江医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 流感pH1N1病毒血凝素基因进化特征及选择性被引量：2
- 2014年
- 目的 分析广东地区2012-2013年新型H1N1（pH1N1）病毒血凝素（HA）基因、表位和受体结合位点（receptor binding sites,RBS）进化特征和选择性。方法 检测广东地区2012-2013年分离的pH1N1毒株HA基因核苷酸序列,与GenBank中全球相应毒株序列比对,应用MEGA 6.05构建进化树,通过Chimera v1.8.1建模并标记,应用DATAMONKEY筛选HA选择性位点。结果 与疫苗株A/California/07/2009的HA基因比较,广东地区2012-2013年pH1N1毒株的HA基因同源性为98.1%~98.7%;变异位点H155Q、K180Q/N和S202T分别位于HA抗原的Ca2、Sa和Sb表位,S220T和R222K均位于HA抗原的Ca1表位区域;位点A151V位于RBS的140环上。正向选择位点为AA202位点。广东毒株A/Guangdong/64/2013与其他毒株相比,发生6个氨基酸位点变异,包括V6I、N55S、S101G、A151V、H155Q和V267A。结论 广东2012-2013年pH1N1毒株HA基因变异导致了HA抗原表位和RBS 140环位点变异将分别影响毒株的抗原性和受体功能;正向选择位点AA202位点承受着较大的免疫压力;毒株A/Guangdong/64/2013的抗原表位Ca2和RBS位点变异可能是下个流感流行季节优势毒株的分子基础。
- 黄钟洲梁丽君邹丽容黄平宋颖超
- 关键词：H1N1亚型血凝素表位选择性
- 空气环境中几种细菌检测与16S rRNA测序鉴定被引量：5
- 2010年
- 采集空气环境微生物,根据菌落和革兰氏染色特征,分离5株细菌。提取分离株DNA,采用设计的16SrRNA引物扩增DNA片段;纯化PCR产物,进行测序反应并再纯化,上机读序。拼接与校对DNA序列,在NCBI网站进行Blast,鉴定细菌型别。5株菌株分别是表皮葡萄球菌、头状葡萄球菌、施氏假单胞菌、溶血葡萄球菌和大肠杆菌;其中溶血葡萄球菌是致病菌,其他4株是条件致病菌。这提示,应警惕空气环境中致病菌的感染。
- 黄钟洲杨艳君黄平杨勇斌管大伟
- 关键词：细菌RRNA致病菌
