严国权
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金杭州市科技发展计划项目广东省教育部产学研结合项目更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 芯片探针杂交效率的影响因素分析
- 芯片技术是近年发展起来的高通量筛选技术,已应用于生命科学研究的诸多领域,特别是在基因组再测序、基因多态性的信息检测和基因表达检测等方面得到快速发展和应用。芯片技术操作流程探针设计、芯片制备、样本纯化标记、芯片杂交、信号检...
- 严国权
- 关键词：DNA芯片高通量筛选RNA二级结构
- 影响RNA芯片探针杂交效率的因素分析
- 2012年
- RNA芯片作为研究ncRNA的主要技术之一,已受到广泛关注。然而因RNA芯片中靶序列的单链特征,使得RNA芯片的探针设计比DNA复杂。本研究对加强型绿色荧光蛋白(EGFP)RNA序列进行覆瓦式探针设计,制作了RNA原位合成芯片,研究探针/靶序列杂交双链ΔG和Tm、靶序列二级结构以及探针的末端碱基对RNA芯片杂交信号强度的影响。结果表明,探针/靶序列杂交双链ΔG和Tm相同的探针间的杂交信号存在较大差异,探针/靶序列杂交双链ΔG和Tm与RNA芯片杂交信号之间未发现明显的规律性;靶序列二级结构的探针PT-sc参数与芯片杂交信号强度间呈较好的线性关系;探针5’末端碱基组成对芯片杂交信号强度也有影响,5’末端碱基为G/C的探针杂交信号总体上高于其邻近的5’末端碱基为A/T的探针的杂交信号,为RNA芯片的探针筛选提供一定的理论基础。
- 马琴琴严国权郭江峰丁先锋
