曲新泽
- 作品数:6 被引量:5H指数:2
- 供职机构:山东农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金:山东省农业科学院青年科研基金山东省科技攻关计划更多>>
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- 传染性支气管炎病毒S1基因的遗传多样性被引量:3
- 2010年
- 为全面分析传染性支气管炎(IBV)流行株S1基因的遗传变异,结合1992-2008年间从山东乃至全国分离鉴定的IBV毒株,在进行抗原性研究的基础上,对17株IBV毒株分别进行了S1基因的克隆测序,并与GenBank中具有代表性的参考株进行同源比较,同时对其高变区HVRⅠ氨基酸基序进行分析。根据系统发育树,结合病毒发生的年代、地域和临床病理,将58株IBV国内外毒株初步分为6个基因型,其中,国内流行株主要涵盖5种基因型,大部分流行株属于基因Ⅴ型(北方株为主)和基因Ⅳ型(南方株为主),两种类型毒株相互交织,呈现复杂的流行形式。对IBV高变区HVRⅠ氨基酸基序分析表明,多数毒株存在不同程度的点突变,尚有4株分离株在33位和34位之间有氨基酸残基的插入。S1基因的遗传变异具有多样性,与常规疫苗株和国外参考株相比,无论是核苷酸还是氨基酸均发生了较大的变异。不同IBV毒株S1基因片段与其全长之间遗传变异高度相关(r=0.968),但IBV流行株与疫苗株的遗传距离愈来愈远,彰显出IBV流行株在H120的免疫压力下,已经发生了较大程度的变异。
- 曲新泽袁小远王友令徐怀英秦卓明姜世金
- 关键词:传染性支气管炎病毒S1基因基因分型
- 自然发生的1株传染性支气管炎病毒S1和N基因之间的重组被引量:2
- 2010年
- 本研究从出现典型呼吸道和肾脏病变的患病雏鸡中分离出1株传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitisvirus,IBV),命名为SC06,旨在探讨该病毒的重组机制。SC06接种10日龄SPF鸡胚可出现明显的"侏儒胚";对5日龄SPF鸡攻毒,可诱发呼吸道症状和肾脏病变。对其S1和N基因分别克隆测序,结合在GenBank中发表的其他IBV参考株序列,对其S1和N基因核苷酸(氨基酸)序列分别进行同源比较,绘制系统发育树。结果表明:SC06与英国4/91株的S1基因核苷酸(氨基酸)同源性最高,为98.7%(98%),而与国内大部分流行株的核苷酸同源性仅为75.6%~76.0%;然而,SC06与国内流行株DY06、SDGE01的N基因核苷酸(氨基酸)同源性达99.3%(99%)、93.4%(93.6%),而与英国的4/91的N基因核苷酸(氨基酸)同源性仅为85.7%(92.4%)。S1基因系统发育方面,SC06与英国的4/91和7/93B属于同一基因型,而与作者实验室近年分离的SDGE01等大部分山东流行株及国内流行的LX4等株分属不同的基因型;但其N基因分型时,SC06和DY06与国内部分流行株属于同一个进化分支,而与英国的4/91和7/93B不同。综合上述结果,推测SC06为英国4/91和国内流行株的重组株,其S1基因来自4/91疫苗,而N基因来自国内DY06类型的IBV国内流行株。
- 徐怀英张伟秦卓明曲新泽王友令黄兵李玉峰
- 关键词:传染性支气管炎病毒S1基因N基因
- 传染性支气管炎病毒S1和N基因的遗传变异比较
- 目的:通过比较传染性支气管炎(IBV)流行株S1基因和N基因的核苷酸同源性及其基因分型,探讨S1和N基因遗传变异的相关性。方法:结合1992—2008年间分离鉴定的1 7株IBV毒株S1和N基因序列,与GenBank中具...
- 秦卓明徐怀英曲新泽王友令黄兵李玉峰
- 关键词:传染性支气管炎病毒
- 传染性支气管炎病毒的基因分型及S1基因和N基因遗传多样性分析
- 鸡传染性支气管炎(Infectious Bronchitis,IB)是由鸡传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis virus,IBV)引起的一种急性、高度接触性呼吸道病,主要侵害鸡的呼吸系统、泌尿...
- 曲新泽
- 关键词:传染性支气管炎病毒S基因N基因基因分型
- 肉鸽新城疫病毒山东分离株的分离鉴定及其F基因的分子特性分析被引量:1
- 2010年
- 从山东某发病肉鸽的体内分离到一株新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV),命名为Pigeon-Shandong-JN-08(简写JN08),对其融合蛋白(fusion,F)进行序列和分子特性的分析,以了解肉鸽NDV的遗传起源和分子特性。JN08经病毒蚀斑克隆纯化后动物回归试验可产生典型的NDV病变。研究结果发现,F蛋白多肽裂解位点的序列为112RRQKRF117,符合鸽源NDV强毒氨基酸基序。F基因分型及同源性比较显示:JN08与绝大多数鸽源毒株同属于基因Ⅵ型;其F基因与基因Ⅱ型毒株LaSota,B1,Bingham,TEX-48氨基酸同源性为89.9%,89.7%,90.4%,89.7%,与基因Ⅰ型毒株Ulster67的氨基酸同源性为91.3%,与基因Ⅲ型传统强毒F48E9的氨基酸同源性为92.8%;与国内鸽分离株P1-03,CH98-98,JS1-06,PB01-96和GZ-07的氨基酸同源性分别为91.3%,94.6%,94.8%,95.1%,94.0%;与国外鸽分离株Capital3-97,Tigre6-99,1166-02,IT227-97,2736-00,NY-84,TX3503-04,248VB-98的同源性分别为96.2%,93.8%,98.0%,96.8%,97.1%,96.8%,96.8%,98.4%。从F基因遗传进化树上发现:JN08与国外分离株的遗传距离较近,处于同一基因亚型上,而与国内分离株的遗传距离较远。
- 袁小远徐绍建曲新泽张玉霞秦卓明
- 关键词:新城疫病毒F基因分子特性
- 传染性支气管炎病毒S1基因和N基因的遗传变异及其基因分型的比较
- 【方法】选取山东、四川等1992-2008年的17株IBV毒株,克隆其S1和N基因,与GenBank中具有代表意义的40个参考株进行同源分析,绘制系统进化,进行基因分型比较。【结果】S1基因:IBV流行株同源性十分复杂,...
- 秦卓明徐怀英曲新泽王友令黄兵李玉峰
- 文献传递