殷明波
- 作品数：7 被引量：5H指数：2
- 供职机构：中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所更多>>
- 发文基金：美国国立卫生研究院基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 日本血吸虫地域特异性相关单核苷酸多态性及其应用
- 本发明公开了日本血吸虫地域特异性相关基因ND2及其应用。具体地，本发明提供了一种检测日本血吸虫地域特异性的方法，它包括检测个体的日本血吸虫ND2基因的两个单核苷酸多态性SNP位点，从而区分日本血吸虫来源于湖区还是山区。基...
- 胡薇殷明波李鸿雁冯正徐斌莫筱瑾张颋周晓农
- 文献传递
- 日本血吸虫种群的遗传标志应用研究进展被引量：2
- 2007年
- 日本血吸虫种群遗传结构的研究有助于更好地理解日本血吸虫病的传播和感染途径，这对于血吸虫病的监控与防治以及对其疫苗的发展都将具有重要的意义。近年来，随着分子遗传学理论与实验技术的发展，在日本血吸虫种群遗传学上取得了一些重大的研究进展。多种遗传标志如：限制性片段长度多态性、线粒体DNA、微卫星等在日本血吸虫种群遗传学上均得到了很好的应用，该文就应用于日本血吸虫的种群遗传学上主要的遗传标志作一综述。
- 殷明波胡薇
- 关键词：种群遗传学日本血吸虫
- 一段检测锥虫特异性核酸靶序列的筛选及评价被引量：1
- 2017年
- 目的以60S核糖体蛋白L44(60S RPL44)基因为靶基因,筛选出一段可特异性检测锥虫属(Trypanosoma)原虫的核酸靶序列,并对其敏感度和特异性进行初步评价。方法将布氏锥虫指名亚种(T.brucei brucei)的60S RPL44基因序列与公共数据库中田鼠巴贝虫(Babesia microti)、杜氏利什曼原虫(Leishmania donovani)、间日疟原虫(Plasmodium vivax)、恶性疟原虫(P.falciparum)和刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)等24种非锥虫属常见的血源性原虫,以及8种锥虫属内其他种的同源序列进行比对。同时,利用Primer Premier 6对布氏锥虫指名亚种的60S RPL44基因序列设计多对引物,结合序列比对结果和各引物评价情况,从中筛选出一对评价情况良好且理论上仅能扩增锥虫属靶序列的引物。利用该对引物检测布氏锥虫指名亚种、布氏锥虫罗德西亚种(T.b.rhodesiense)、刚果锥虫(T.congolense)、伊氏锥虫(T.evansi)以及上述5种其他属原虫,评价其特异性。采用梯度稀释(10 ng/μl、1 ng/μl、100 pg/μl、10 pg/μl、1 pg/μl)的伊氏锥虫基因组DNA为模板评价其敏感度。结果选出一段基于60S RPL44的特异性序列,针对该序列的扩增引物为P1:5′-CCTGATGAAAGGTGCAATG-3′,P2:5′-CGTTTTCGCCTTCTTGTGGA-3′。该引物扩增布氏锥虫指名亚种、布氏锥虫罗德西亚种、刚果锥虫、伊氏锥虫的DNA均为阳性,扩增片段长156 bp;扩增田鼠巴贝虫、杜氏利什曼原虫、间日疟原虫、恶性疟原虫、刚地弓形虫等非锥虫属原虫均为阴性;该引物检测伊氏锥虫DNA的敏感度为10 pg/μl。结论筛选获得一段敏感度较高、特异性强的检测锥虫属原虫的核酸靶标序列。
- 洪清华王韵丞李鸿雁张瑞祥李健陈木新刘骁殷明波王敬文胡薇
- 关键词：PCR检测靶序列
- 微卫星作为遗传标记在日本血吸虫种群遗传学中的研究
- 微卫星(microsatellite)是1-6个碱基作核心，单位串联重复排列而成为的一类dna序列。由于核心单位重复的次数不同以及重复的程度不一致而导致这些序列具有多态性。微卫星上不同长度的等位基因按孟德尔方式遗传，具有...
- 殷明波
- 关键词：日本血吸虫种群遗传学微卫星标记基因组数据库
- 文献传递网络资源链接
- 日本血吸虫地域特异性相关单核苷酸多态性及其应用
- 本发明公开了日本血吸虫地域特异性相关基因ND2及其应用。具体地，本发明提供了一种检测日本血吸虫地域特异性的方法，它包括检测个体的日本血吸虫ND2基因的两个单核苷酸多态性SNP位点，从而区分日本血吸虫来源于湖区还是山区。基...
- 胡薇殷明波李鸿雁冯正徐斌莫筱瑾张颋周晓农
- 文献传递
- 新的具有高度多态性的日本血吸虫微卫星位点的鉴定被引量：2
- 2008年
- 目的从基因组序列中选择和设定新的、可用于研究日本血吸虫多态性的微卫星位点。方法672个日本血吸虫标本取自安徽、江西、湖南、湖北和四川等5省的7个流行区现场。根据日本血吸虫基因组数据库中的初始数据设计引物,对标本的17个全新的日本血吸虫微卫星位点进行分析。用GenMapper4.0软件(Applied Biosystems)进行初始数据处理,用GenClone1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用GenAlEx6软件统计等位基因的变化;用GenClone1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用UPGMA谱系图分析种群间遗传距离。结果17个微卫星位点均呈现多态性。对江西都昌种群的这17个位点进行分析,标本之间的遗传距离大多为25～32,显示江西都昌种群内各个标本之间的遗传差异明显。对7个地区种群分析的结果显示种群间的差异较为明显。类平均法系统聚类分析(UPGMA)谱系图显示,江西都昌、安徽铜陵、湖北沙市和湖南常德的种群同为一簇,其遗传距离为0.0178～0.0363;安徽贵池和湖南岳阳的为另外一簇,其遗传距离为0.0247;而四川西昌单独为一簇,与其他两簇的遗传距离为0.0192～0.0693。结论选择的17个微卫星位点可作为研究日本血吸虫种群遗传学的有效标记,并揭示中国大陆该虫种存在着复杂的遗传变异。
- 殷明波朱根凤张祥林徐斌莫筱瑾孙胜强王升跃David Blair胡薇冯正
- 关键词：日本血吸虫微卫星多态性
- 群体水平日本血吸虫弹性蛋白酶遗传差异研究
- 2013年
- 目的分析不同地理来源的日本血吸虫群体弹性蛋白酶基因的遗传差异,研究该基因是否受到自然选择。方法PCR扩增不同流行区的血吸虫成虫弹性蛋白酶基因并测序,分别计算血吸虫各群体遗传多态性指数(Watterson’sθ和Tajima’sπ)、选择压力指数(dN/dS和Tajima’s D)以及群体间分化指数(F st),用Network软件进行系统进化分析。结果共获得73条来自不同群体的日本血吸虫弹性蛋白酶基因序列。分析发现:长江中下游地区(安徽铜陵和湖南岳阳)群体内遗传差异最大,而菲律宾和湖北沙市的群体内无遗传差异;仅湖南岳阳日本血吸虫群体的Tajima’s D>0,其他群体均为负值;安徽铜陵群体dN/dS>1,台湾群体dN/dS<1,其他群体dS=0,但非同义突变数明显高于同义突变数;群体分化和系统进化分析均显示台湾群体与其他群体之间遗传距离最远。结论不同地理来源的日本血吸虫群体在弹性蛋白酶基因上的遗传多态性有较大差异,特别是长江中下游群体之间;弹性蛋白酶基因在进化过程中可能受到了正向选择;台湾的日本血吸虫群体与其他群体的遗传分化最大。
- 苏敬徐斌刘秀凤殷明波胡薇
- 关键词：日本血吸虫弹性蛋白酶遗传多态性自然选择
