芦晓飞
- 作品数：5 被引量：35H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院蔬菜花卉研究所更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项国家重点基础研究发展计划“十一五”国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 利用小亚基核糖体RNA技术分析温室黄瓜近根土壤古菌和真菌多样性被引量：5
- 2011年
- 土壤古菌和真菌在温室生态系统是仅次于细菌的微生物,具有类似于细菌的重要生态功能。通过构建古菌16S rRNA和真菌18S rRNA基因克隆文库,分析温室黄瓜近根土壤古菌和真菌群落结构组成,为开发利用温室这一特殊的生态环境中丰富的微生物资源以及理解微生物与植物间的互作提供参考依据。采用研磨-冻融-溶菌酶-蛋白酶K-SDS热处理以及CTAB处理等理化方法,提取和纯化微生物总DNA,构建古菌16S rRNA和真菌18S rRNA基因克隆文库。利用DOTUR软件将古菌和真菌序列按照相似性97%的标准分成若干个可操作分类单元(OTUs)。土壤古菌克隆文库主要包括泉古菌门和未分类的古菌两大类,并有少部分广域古菌类群,所有泉古菌均属于热变形菌纲,共45个OTUs;真菌克隆文库包括真菌门的大多数亚门真菌,共24个OTUs,未发现担子菌亚门真菌。古菌多样性比较丰富,且发现少量的广域古菌(甲烷菌),这一情况可能与温室长期高温高湿,高有机质含量,土壤处于缺氧环境有关;土壤真菌的优势种群为子囊菌,占到土壤真菌的80%以上,这可能与绝大多数植物真菌性病害属于土传病害,通过菌丝体、菌核或子囊壳在土壤病残体中越冬有一定的关系。
- 赵志祥芦晓飞陈国华茆振川杨宇红刘二明谢丙炎
- 关键词：土壤微生物群落RRNA基因RRNA基因
- 拮抗南方根结线虫PKS基因的筛选及活性评价被引量：1
- 2010年
- 土壤环境中蕴藏着巨大的微生物资源,而99%的土壤微生物不能用传统的纯培养。本研究基于西藏米拉山高寒草甸土壤微生物宏基因组Fosmid文库,采用PCR方法从文库中筛选PKS基因,以南方根结线虫(Meloido-gyne incognita)为靶标测定其杀线活性,并验证温室盆栽防效。从Fosmid文库中筛选得到2个含PKS基因的克隆K99和K82。K99属于Ⅰ型PKS,K82属于杂合PKS/NRPS;K99发酵液、热处理发酵液浸泡南方根结线虫J2 12 h后,杀线活性为100%。温室盆栽防效结果表明,K99的发酵菌液对南方根结线虫的防效为89%。K99能产生一种外分泌有杀线活性的物质,其热稳定性好,具有重要的开发利用价值。
- 罗坤赵志祥芦晓飞黎定军谢丙炎
- 关键词：PKS南方根结线虫杀线活性
- 西藏米拉山高寒草甸土壤微生物DNA提取及宏基因组Fosmid文库构建被引量：19
- 2009年
- 青藏高原土壤中富含特殊的微生物资源,因大多数未能得到培养而无法利用.提取微生物总DNA及构建宏基因组文库的方法是研究未培养微生物的重要方法(免培养法).西藏米拉山高寒草甸土壤中腐植酸、有机质含量非常高,DNA提取非常困难,本研究表明直接法提取该样品的DNA片段小,杂质含量高,不能满足构建大插入片段文库的要求;结合低速离心和Nycodenz密度梯度离心先分离出微生物细胞的间接法虽然DNA产率降低,但是纯度高,片段长,多样性丰富,更适合于构建大插入片段文库.在间接法提取高质量西藏高寒草甸土壤微生物DNA的基础上,成功构建了一个包含30624个克隆、库容量超过1Gbz稳定性好的宏基因组Fosmid文库,为从西藏高原土壤中挖掘和利用新的功能基因研究奠定了基础.
- 芦晓飞赵志祥谢丙炎杨宇红冯东昕
- 关键词：高寒草甸土壤微生物宏基因组FOSMID文库
- 宏基因组学及其在植物病害生物防治中的应用被引量：5
- 2010年
- 利用微生物及其代谢产物来控制有害生物是生物防治的主要方法之一,目前使用的生防菌株大多来源于培养基筛选。然而由于受到技术的限制,现在能够利用培养法获得的微生物种类不足自然环境中的1%。宏基因组学技术(metagenomic technology)是完全不依赖于人工分离培养直接获得环境中理论上所有微生物基因组信息的一种有效手段,为发掘这些尚不能被纯培养的微生物资源提供了良好的契机。本文综述了宏基因组学的概念、研究策略及其在植物病害生物防治中的应用前景,以期为开发和使用新型植物病害微生物生防菌剂提供思路。
- 芦晓飞罗坤谢丙炎陈国华茆振川
- 关键词：微生物生物防治宏基因组学
- 西藏米拉山高寒草甸土壤微生物多样性研究
- 青藏高原是世界上海拔最高的高原,其平均海拔在4 000米以上,高寒、缺氧、降水少、日照长、辐射强,独特的自然地理环境使其富含特殊的微生物资源。但是由于全球气候的变化导致青藏高原气温不断升高,加之人类过度放牧的影响使得高寒...
- 芦晓飞
- 关键词：高寒草甸土壤微生物多样性宏基因组
- 文献传递
