赵亮
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：复旦大学化学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于质谱技术研究黑色素瘤血清特异性O-糖链
- 2010年
- 对接种和未接种B16黑色素瘤细胞的C57小鼠进行血清O-糖链比较糖组学研究,寻找黑色素瘤血清特异性O-糖链.小鼠血清10μL,β-消除反应释放O-糖链.反应混合物经石墨化炭黑固相萃取小柱(GCC SPE)分离纯化后,用于MALDI-Qit-TOF-MS分析.通过Launchpad软件采集并输出质谱数据,MATLAB进行数据解析,找到了10个稳定出现的差异糖链质谱峰.利用串联质谱分析了其中5个主要差异糖链的结构.
- 白晨吴刚赵亮
- 关键词：质谱糖组学黑色素瘤分子标志物
- 评估几种降维分类器应用于生物质谱数据的性能被引量：3
- 2010年
- 在基于质谱的蛋白质组学数据分类研究中,降维技术能够通过提取特征来降低变量维度,有助于机器学习方法进行准确高效地分类.为了研究和比较机器学习分类器与降维技术相结合的分类模型在蛋白质组学数据分类中的性能,为相关的分类研究提供参考,将线性判别分析、k-最近邻、决策树、支持向量机及人工神经网络分类方法与主成分分析及偏最小二乘降维技术相结合,应用于质谱公共数据的分类中.本文所使用的结合式分类模型中,PLS-LDA,PLS-SVM和PLS-ANN方法表现出了最高的分类准确率.为进一步提升分类效果,基于最优的这3种组合分类方法,采用多数投票法构建了专家分类系统.在10倍交叉验证中,多数投票模型仅使用前5个主成分即达到100%的分类准确率.本研究方法和结论为质谱及其他类型的指纹图谱分析研究提供了有益的参考.
- 罗凯旋钟凡赵亮贺福初
- 关键词：蛋白质组学降维
