郭民伟 作品数:48 被引量:119 H指数:6 供职机构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技基础条件平台建设计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 环境科学与工程 轻工技术与工程 更多>>
无柄灵芝遗传多样性的SRAP、ITS、TEF1-α和LSU分析 被引量:15 2016年 【目的】研究来自我国不同地区的45株无柄灵芝菌株的遗传多样性。【方法】利用ITS、TEF1-α和LSU多基因分析及SRAP分子标记两种方法,对供试无柄灵芝菌株进行聚类分析和遗传多样性研究。【结果】筛选出8对SRAP引物共扩增出95条条带,其中具有多态性条带79条,平均多态性比例为82.4%,多态性信息含量(PIC)变幅在0.28-0.43,平均为0.38。ITS、TEF1-α和LSU多基因序列分析结果显示,同一地域的部分菌株聚在一起,亲缘关系较近,而地域相隔较远的部分菌株也聚在同一个进化支上,其亲缘关系也很近,这与SRAP聚类分析结果相吻合。【结论】无柄灵芝菌株遗传多样性较为丰富,其遗传相似性与地理分布存在一定的相关性,ITS、TEF1-α、LSU基因及多基因分析更适合无柄灵芝分类鉴定,而SRAP分子标记更适合于无柄灵芝遗传多样性分析。 谭秀梅 阿地力·沙塔尔 朴春根 薛寒 郭民伟 汪来发 李永关键词:SRAP ITS LSU 检测枣疯病、槐树丛枝病或樱桃致死黄化植原体的LAMP引物组及其试剂盒和应用 本发明公开了检测枣疯病、槐树丛枝病和樱桃致死黄化植原体的LAMP引物组及其试剂盒和应用。本发明针对16SrV‑B组植原体tuf基因保守序列设计用于检测枣疯病、槐树丛枝病和樱桃致死黄化植原体的LAMP引物组。本发明还公开了... 王圣洁 林彩丽 王胜坤 田国忠 于少帅 王曦茁 汪来发 朴春根 李永 郭民伟文献传递 2个欧美杨品种树皮内生真菌多样性及优势种群动态变化 被引量:5 2013年 利用组织分离法从欧美杨2品种欧美杨107杨、中林46杨中(996块组织)分离内生真菌1252株,107杨和中林46杨分别分离出645株和607株。利用形态特征和分子生物学方法鉴定为17个属、32个分类单元,包括担子菌2个分类单元,子囊菌30个分类单元均为子囊菌。在基于ITS构建的系统进代树上、2杨树品种内生菌均形成5个稳定的分支,包括在囊菌纲2个分支,包括散囊菌纲、类壳菌纲等。2个杨树品种内生真菌优势种群包括链格孢、葡萄座腔菌、镰孢菌、间座壳菌等,其中链格孢、葡萄座腔菌是最为常见的优势种群,2品种内生菌的优势种群会随季节变化而发生变化。 李永 朴春根 贺伟 常聚普 王海明 郭立民 谢守江 郭民伟关键词:内生真菌 欧美杨 树皮 多样性 两种杨树树皮内生真菌多样性及优势种群动态变化 被引量:1 2013年 为了解健杨94(转基因抗虫杨94)、三倍体毛白杨2个杨树品种干部树皮内生真菌区系及其优势种群的季节变化情况,本研究利用组织分离法从2个杨树品种996块组织中分离内生真菌1 175株,健杨94和三倍体毛白杨分别分离612、563株。利用形态特征和分子生物学方法鉴定为15个属、35个分类单元,包括担子菌1个分类单元,子囊菌34个分类单元。2个杨树品种内生真菌优势种群包括链格孢、葡萄座腔菌、镰孢属真菌、间座壳属真菌等,其中,仅有链格孢、葡萄座腔菌和桑砖红镰孢是两品种共有的优势种群种类,而且优势种群会随季节变化而变化。在两品种的内生真菌中,链格孢、葡萄座腔菌是最为常见的优势种群。 李永 朴春根 郭利民 常聚普 王海明 贺伟 谢守江 郭民伟关键词:内生真菌 优势种群 多样性 树皮 杏鲍菇遗传多样性的SRAP和ITS分析 被引量:4 2016年 研究来自中国不同地区和日本的27株杏鲍菇栽培菌株的遗传多样性,以期为杏鲍菇的鉴定和选育提供分子依据。利用SRAP和ITS标记联合使用的方法,通过聚类分析对供试杏鲍菇菌株进行研究。筛选出9对SRAP引物共扩增出151条条带,其中具有多态性条带130条,平均多态性比例为83.3%,多态性信息含量(PIC)变幅在0.27~0.42,平均为0.36。通过ITS序列对供试菌株进行亲缘关系分析,与SRAP分析的结果一致,均表明地域来源相近的部分菌株聚在一起,亲缘关系较近,而地域相隔较远的部分菌株也聚为一类,其亲缘关系也很近。2种标记均显示供试杏鲍菇栽培菌株的遗传多样性较为丰富,其遗传相似性与地理分布存在一定的联系。SRAP和ITS联合使用能够得到更好的效果,从而为杏鲍菇遗传多样性研究提供更为有力的参考。 谭秀梅 李永 朴春根 薛寒 郭民伟 阿地力.沙塔尔关键词:杏鲍菇 SRAP ITS 泡桐丛枝和枣疯病植原体tuf基因上游序列结构、功能和遗传变异比较分析 被引量:3 2016年 【目的】探究泡桐丛枝和枣疯病植原体tuf基因上游序列结构、功能差异及其遗传多样性。【方法】利用热不对称交错式PCR(TAIL-PCR)扩增枣疯病植原体tuf基因上游未知序列,利用启动子探针载体pSUPV4构建了泡桐丛枝和枣疯病植原体tuf基因上游序列的大肠杆菌异源表达体系,分析泡桐丛枝、苦楝丛枝、莴苣黄化、桑萎缩、长春花绿变等16SrI组和枣疯病、樱桃致死黄化、重阳木丛枝等16SrV组株系tuf基因上游调控序列的遗传变异特征和启动子活性。【结果】泡桐丛枝等16SrI组植原体株系tuf基因和其上游fus A基因之间的间区序列长129-130 bp,预测有完整的启动子保守结构。泡桐丛枝植原体tuf基因上游130 bp片段具有启动子活性,此间区序列在5种35株16SrI组株系中存在4种变异类型;枣疯病植原体等16SrV组株系fusA和tuf基因间区长53-54 bp,未预测到完整启动子结构。枣疯病植原体tuf基因上游144 bp和346 bp片段均未检测到启动子活性,fus A和tuf基因间区序列在3种20株16SrV组株系中存在2种变异类型。fus A-tuf基因间区序列相对保守,基于此序列构建的进化树可清晰区分不同组别的植原体株系。【结论】研究方法和结果为深入研究植原体基因表达与调控、揭示植原体生长繁殖规律及其致病机理等奠定了良好的基础。 于少帅 林彩丽 潘皎 任争光 朴春根 汪来发 郭民伟 田国忠关键词:植原体 启动子 TAIL-PCR 根癌农杆菌介导的淡紫拟青霉遗传转化体系的建立 被引量:10 2010年 基于根癌农杆菌介导的遗传转化方法,选择植物线虫生防真菌淡紫拟青霉的分生孢子为受体,建立以G418为筛选标记遗传转化体系。通过优化遗传转化条件,达到较高的转化效率:1000~2400个转化子·10-6分生孢子。对转化子进行PCR验证,表明T-DNA已整合到淡紫拟青霉的基因组中,表型测定发现转化子的遗传表现稳定。农杆菌介导淡紫拟青霉突变体库的建立,为进一步筛选对植物线虫致病性高的突变体、了解淡紫拟青霉的侵染过程和侵染机制提供基础,对培育更优良的植物线虫生防菌株,开发高效生防制剂等具有重要的意义。 王曦茁 朴春根 李虹 汪来发 郭民伟 李永 刘晓莉关键词:根癌农杆菌 淡紫拟青霉 猪屎豆丛枝病植原体的分子检测与鉴定 被引量:3 2010年 Crotalaria witches’-broom phytoplasma (CrWB) collected from Hainan Province,was classified and identified by sequencing techniques and Virtual RFLP.Two different type universal primer pairs of phytoplasma were used to amplify a 1.8 kb fragment of 16S rDNA and a 1.3 kb fragment of rp gene.The PCR-amplified products were cloned and sequenced.The results of sequencing and homologuous comparison with other phytoplasmas showed that Crotalaria witches’-broom phytoplasma shared 99.9 % similarity with peanut witches’-broom phytoplasma in 16S rRNA gene and 99.9% in rp gene.Crotalaria witches’-broom phytoplasma is sorted into Peanut witches’-broom group(16SrII),16SrII-A,according to the results of Virtual RFLP of 16S rDNA,phylogenetic analysis of 16S rRNA and rp gene,which is related to Ca.Phytoplasma australasiae. 李永 徐启聪 田国忠 郭民伟 朴春根关键词:植原体 分子鉴定 根癌农杆菌介导淡紫拟青霉的遗传转化 淡紫拟青霉[Paecilomyces lilacinus(Thom)Samson]是目前研究较为广泛的一种线虫寄生真菌,通过构建淡紫拟青霉遗传转化体系,可以为进一步筛选与侵染线虫相关的基因,明确淡紫拟青霉对 汪来发 王曦茁 郭民伟 朴春根松茸菌丝的培养方法及其专用装置 本发明公开了一种松茸菌丝的培养方法及专用装置,属于松茸菌丝的人工培养领域。所述专用装置包括:罐体(1)、罐盖(2)、搅拌棒(3)、搅拌叶(4)、出气口(5)、接种口(6)、两个外部循环接口(7)和(8)、取样口(9)、入... 朴春根 李永 郭民伟 薛寒 田国忠 汪来发 王曦茁 林彩丽文献传递