张瑶
- 作品数：6 被引量：61H指数：2
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 拜城盐山免培养放线菌多样性研究被引量：2
- 2012年
- [目的]研究新疆拜城盐山高盐环境中的放线菌多样性,为今后的开发和利用奠定基础。[方法]应用基于16S rRNA基因序列的免培养技术和系统发育分析方法对拜城盐山样品中的放线菌多样性进行研究。采用SDS-CTAB方法提取样品中的总DNA,利用特异性引物扩增样品DNA中的放线菌16S rRNA基因,并构建放线菌16S rRNA基因克隆文库;通过比较酶切图谱,挑选克隆文库中的代表克隆,进行序列测定和BLAST比对分析。[结果]构建的放线菌克隆文库共包含216个放线菌克隆。克隆序列经过BLAST比对分析,放线菌亚纲中的克隆有171个,占总克隆数的79.2%。酸微菌亚纲45个克隆,占总克隆数的20.8%,与GenBank中已知的微球菌16S rRNA基因序列最大相似度小于92%,是酸微菌亚纲中新的类群。优势放线菌为放线菌亚纲棒杆菌亚目诺卡氏菌科(Nocardiaceae)的红球菌属(Rhodococcus),占克隆总数的51.9%。有24.5%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表着放线菌新的类群。[结论]拜城盐山存在着较为丰富的放线菌种类,并且潜藏着新类型的放线菌资源。
- 周慧杰周慧杰夏占峰张娇张瑶张利莉
- 关键词：放线菌多样性
- 引物偏嗜性对未培养放线菌多样性研究的影响
- 【目的】为了研究引物的偏嗜性对未培养放线菌多样性及群落结构的影响。【方法】本研究应用基于16S rRNA基因序列系统发育分析的免培养方法对新疆塔里木盆地咸水滩高盐环境进行放线菌多样性分析。利用放线菌特异性引物S20/A1...
- 张瑶曹鑫波李军张利莉
- 关键词：放线菌多样性文库
- 文献传递
- 转录组测序技术在生物测序中的应用研究进展被引量：54
- 2015年
- 转录组所代表的是细胞或组织内全部RNA转录本(RNA transcripts),它反映着不同的生命阶段、不同的组织类型、不同的生理状态以及不同的环境条件下表达的基因。转录组的研究可以从整体水平上反映出细胞中基因的表达情况及其调控规律。随着基因组时代的到来,转录组测序技术将会在较为广泛的领域中得以应用并快速发展。本文参考近几年发表的有关转录组研究的文献,综述了转录组测序技术在各研究领域中的应用及取得的成果,并对该技术在核桃研究中的应用进行了展望。
- 贾昌路张瑶朱玲张锐
- 关键词：转录组玉米单细胞蛋白质组
- 一种分离高盐环境放线菌的培养基及其应用
- 本发明公开了一种分离高盐环境放线菌的培养基及其应用。培养基由甘露醇1%、丙氨酸0.1%、K<Sub>2</Sub>HPO<Sub>4</Sub>0.1%、MgSO<Sub>4</Sub>?7H<Sub>2</Sub>O0...
- 张利莉陈正军李艳宾关统伟夏占峰张瑶张娇吕玲玲贾晓宇
- 文献传递
- 一种分离高盐环境放线菌的培养基及其应用
- 本发明公开了一种分离高盐环境放线菌的培养基及其应用。培养基由甘露醇1%、丙氨酸0.1%、K<Sub>2</Sub>HPO<Sub>4</Sub> 0.1%、MgSO<Sub>4</Sub>?7H<Sub>2</Sub>O...
- 张利莉陈正军李艳宾关统伟夏占峰张瑶张娇吕玲玲贾晓宇
- 阿克苏高盐咸水滩放线菌分离新策略及系统发育多样性被引量：5
- 2013年
- 【目的】探讨高盐咸水滩放线菌的分离新策略,为高盐地区放线菌资源的分离提供理论依据。【方法】以甘油-精氨酸培养基、海藻糖-肌酸培养基、甘油-天冬氨酸培养基、甘露醇-酸水解酪蛋白培养基、干酪素-甘露醇、甘露醇-丙氨酸培养基、壳聚糖-天冬酰胺培养基和高氏一号琼脂培养基8种培养基为基础培养基,采用营养成分十倍稀释法、据土样理化性质模拟原始生态环境、免培养分子技术检测菌株的分离培养基及培养条件指导放线菌可培养以及借鉴半咸水海洋环境放线菌分离培养基等4种策略来优化设计培养基,进行阿克苏高盐咸水滩土样放线菌的分离,并采用细菌通用引物进行16S rRNA基因扩增和序列测定,并构建系统发育树。【结果】共分离到403株,分属于放线菌的8个亚目10个科,Streptomyces、Streptomonospora、Saccharomonospora、Plantactinospora、Nocardia、Amycolatopsis、Glycomyces、Micromonospora、Nocardiopsis、Isoptericola、Nonomuraea、Thermobifida、Actinopolyspora和Actinomadura等14个属。69.96%菌株属于链霉菌亚目(Streptomycineae),9.68%菌株属于链孢囊菌亚目(Streptosporangineae),9株为潜在新种。【结论】4种分离新策略显著地提高了高盐地区放线菌的可培养性,还发现了许多新物种,为放线菌的分离提供了新思路与途径。
- 张瑶夏占峰曹鑫波李军张利莉
- 关键词：放线菌培养基
