徐红林
- 作品数：13 被引量：24H指数：3
- 供职机构：江南大学理学院更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金江苏省计算机信息处理技术重点实验室基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术文化科学生物学电子电信更多>>
- 浅析课堂教学中研究生科研创新能力的培养
- 2013年
- 科研创新能力是评价研究生质量的重要依据,而课堂教学是研究生获取知识的重要途径,因此,如何在课堂教学过程中更好地培养研究生的科研创新能力是一个重要的研究课题。通过与传统的课堂教学相比较,提出调整教学内容的顺序和变换教学角色两种改进方法。并且以数学类研究生课程"随机过程"为例,结合心理学的知识,简单分析了这两种方法对于增强研究生的科研创新意识,提升他们的科研创新能力所起的作用。
- 沈莞蔷徐红林
- 关键词：课堂教学科研创新能力
- 改进的时序基因表达数据动态聚类算法
- 2007年
- 文[1]采用了一种基于动态模型的聚类算法,将时序基因表达数据作为一组时间序列进行动态的聚类分析,得到了较为理想的聚类结果。对上述算法在数据初始化方面进行了合理改进,并利用贝叶斯理论对数据的联合概率分布进行了重新分析。实验表明,提出的改进算法所得聚类结果明显优于原算法所得结果。
- 刘宇宏王士同徐红林
- 关键词：自回归模型动态模型贝叶斯理论
- 基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对方法被引量：3
- 2007年
- 蚁群遗传算法是在蚁群算法的基础上用遗传算法对其参数进行优化而产生的一种改进算法。把蚁群遗传算法应用于生物信息学中的氨基酸序列比对上,从而提出了一种新颖的蚁群遗传序列比对算法,实验结果表明这种新颖的序列比对算法是非常有效的。
- 郭俊恩王士同徐红林
- 关键词：生物信息学蚁群算法蚁群遗传算法氨基酸序列
- 一种识别蛋白质的保守氨基酸残基的新方法被引量：2
- 2007年
- 保守氨基酸残基在生物进化过程中具有较强的稳定性,一般不会发生太大的变化;生物信息学认为:氨基酸序列决定蛋白质结构,蛋白质结构决定蛋白质功能。因此,作者基于氨基酸的生化特性、几何特性和动态特性描述了一个新颖的算法去发现蛋白酶家族中的保守氨基酸残基,而保守氨基酸残基将对蛋白质的结构和功能的研究具有重要的意义。
- 郭俊恩王士同徐红林
- 关键词：生物信息学
- 基于辅助空间与主空间合作的半监督聚类方法被引量：2
- 2007年
- 无监督聚类仅仅基于主空间,当辅助空间被引入聚类过程时,无监督聚类成为半监督聚类。代价函数的设计既考虑到主空间又考虑到辅助空间,从而一个新颖的基于辅助空间与主空间合作的半监督聚类方法APMSC被提出。该算法通过迭代优化,使得相应的代价函数最小化,最终得到有效的聚类结果。通过实验证实了APMSC的有效性和优越性。
- 罗晓清王士同徐红林
- 关键词：代价函数半监督聚类
- 线性p-Bézier曲线的几何形状被引量：3
- 2014年
- 为了丰富非多项式空间的拟Bézier系统的几何性质,针对线性三角多项式空间的p-Bézier曲线进行研究.首先通过几何变换与参数变换将椭圆的参数方程化为p-Bézier形式;然后通过对比,指出除去退化情况外线性p-Bézier曲线必为椭圆弧;再给出该椭圆的中心,焦点,长、短轴顶点这些几何元素与其控制顶点间的关系式;最后给出了线性p-Bézier曲线为圆弧的充要条件.实例结果表明,文中的几何元素可以通过控制顶点的线性插值得到.
- 沈莞蔷汪国昭徐红林
- 关键词：椭圆弧线性插值
- 基于物联网的远程机柜智能运维控制器的设计
- 解决远程机房设备故障定位困难、监控维护不及时、管理成本高等问题,基于物联网技术,设计、开发了机柜微环境运维控制器,通过对环境监控数据的关联分析,建立以智能机柜为监控单元的分布式机房级联监控系统,实现了自动化的实时环境监控...
- 张宏财徐红林郑烁孙丹
- 关键词：计算机机房监控系统物联网
- 用于基因调节网络建模的概率布尔型基因网络结构分析被引量：5
- 2004年
- 基于IylaShumlevich提出的概率布尔型网络(PBN)模型,讨论了概率布尔型网络PBN的结构分析问题.依据PBN网络模型中任意两基因之间量化了的相互影响,对基因调节网络图进行分割,得到各自独立的子网络.同时,依据一定规则找到对网络的稳定性起决定作用的关键基因,通过对关键基因的状态分析,并扩展到整个网络,最终确定PBN的状态.
- 徐红林王士同
- 基于AR模型的动态模糊聚类算法被引量：1
- 2008年
- 与传统的硬划分聚类相比,模糊聚类算法(以FCM为例)对数据的比例变化具有鲁棒性,能够更准确地反映数据点与类中心的实际关系,目前已得到广泛应用。然而对于时序基因表达数据来说,传统的聚类算法往往不能充分利用到数据中时间上的动态关联信息。因此可以在模糊聚类算法的基础上引入自回归(AR)模型,将时序基因表达数据作为一组时间序列进行动态的聚类分析。这样不仅可以充分利用到时序基因表达数据的内部自相关性,并且可以进一步利用隶属度函数对AR模型的预测过程进行模糊化调整,从而得到更为理想的聚类结果。
- 刘宇宏王士同徐红林
- 关键词：自回归模型模糊聚类
- 基于能量因子的基因调控网络重构
- 2010年
- 重构基因调控网络有助于探索生命系统的本质问题。线性组合模型以其形式简单和易于求解的特点被成功应用于基因网络的重构过程中。作者针对线性组合模型只考虑了基因之间的线性调控关系的缺陷,引入了能量因子的概念,从而使得模型具备了分析基因间的非线性调控关系的特性。将模型应用于大肠杆菌(Escherichia coli)的SOS DNA修复过程中,实验证明:该模型能较好地拟合大肠杆菌的SOS DNA修复过程,进一步提高了调控网络的构建精度。
- 谭左平徐红林王士同堵国成
- 关键词：基因表达调控网络DNA修复
