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李龙: 作品数：11 被引量：13H指数：2; 供职机构：西北农林科技大学林学院更多>>; 发文基金：博士科研启动基金中国博士后科学基金国家自然科学基金更多>>; 相关领域：农业科学医药卫生生物学文化科学更多>>

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杜仲CONSTANS-like全基因组鉴定、系统进化及表达模式分析被引量：2: 2022年; 【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲基因组中共鉴定到8个EuCOLs基因,分别命名为EuCOL1~EuCOL8,氨基酸数目为315~469,理论等电点分布范围为5.10~6.47,分子量为35.21~52.65 kDa。亚细胞定位预测均定位在细胞核中,为亲水性蛋白,分布于8条染色体。系统进化分为2个亚家族(群组Ⅰ和群组Ⅲ),分别包含2和6个EuCOLs蛋白,同一亚家族基序具有相似性。EuCOLs基因结构简单,启动子中含有多个光周期响应元件。表达模式分析显示:EuCOLs在杜仲叶片发育中表达水平相对较低,EuCOL7在杜仲胶形成中表达量最高,各家族成员表达特征存在差异。蛋白互作预测显示:EuCOL7可与多个光周期响应蛋白互作。【结论】杜仲CONSTANS-like基因家族含有典型的CCT和B-box结构域,可能参与叶片发育及杜仲胶的形成。; 刘俊李龙陈玉龙刘燕吴耀松任闪闪; 关键词：生物信息学

柴松、油松苗期形态解剖和生理特性差异性比较: 2014年; 采集柴松和油松天然林种子并进行播种育苗和栽培试验,比较研究2种松树1年生幼苗的形态解剖和生理特征。结果表明:在生理方面,柴松针叶的POD酶活性大于黄龙、周至、洛南3个居群的油松并差异显著。柴松针叶叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素含量均略小于3个居群的油松。关于针叶解剖的指标,柴松的单个树脂道面积、单个针叶横截面的树脂道总面积、内皮层厚度、针叶厚度、针叶宽度均小于3个居群的油松并存在显著地差异。柴松的针叶截面面积和针叶截面周长均小于黄龙油松和周至油松并存在明显的差异,而与洛南油松无明显区别。柴松的树脂道总面积与针叶横截面面积比显著的小于洛南油松,而与黄龙和周至2个居群无明显差异。关于茎干解剖特征的指标,柴松的木质部厚度、皮层厚度、单个树脂道面积、单个茎横截面树脂道总面积均小于3个居群油松并存在显著差异。柴松的韧皮部厚度小于周至和黄龙2个居群的油松并差异显著。柴松与黄龙油松的周皮厚度存在显著差异,而与周至和洛南2个居群无明显区别。利用系统聚类法分别对柴松和3个居群的油松生理学特征、针叶解剖学特征、茎干解剖学特征进行聚类分析,聚类结果显示,3个居群的油松亲缘关系较近,而与柴松亲缘关系较远。; 李龙解庆李周岐刘志红; 关键词：柴松油松生理特性

杜仲TCP转录因子鉴定及生物信息学分析: 2022年; 目的对杜仲TCP(teosinte branched 1/cycloidea/proliferating)基因家族进行筛选分析,以期为EuTCPs基因功能深入研究奠定基础。方法以杜仲基因组数据库为基础,通过生物信息学系统分析TCP基因家族的理化性质、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及其在杜仲叶片发育及胶形成中的表达水平。结果从杜仲基因组中共鉴定到14个EuTCPs,氨基酸数目介于139~492,理论等电点分布在5.54~9.72,相对分子质量区域为18 880~53 620,亚细胞定位预测在细胞核中,均为亲水性蛋白。系统进化分为PCF、CIN和CYC/TB13个亚家族,分别包含5、6、3个EuTCPs蛋白。表达模式分析显示,EuTCPs在杜仲叶片不同发育时期存在显著差异,每个发育时期EuTCPs表达量各不相同,EuTCPs正调控杜仲胶的形成。结论杜仲中TCP家族包含14个成员,各成员的分子特征和组织表达特异性存在差异,EuTCPs可能参与杜仲叶片发育及杜仲胶的形成。; 刘俊李龙吴耀松刘燕任闪闪陈玉龙; 关键词：亚细胞定位系统进化

柴松与油松针叶和木材解剖结构的差异被引量：1: 2013年; 对柴松、油松的针叶(徒手切片法)和木材(木材切片法)解剖结构比较研究发现:柴松针叶的厚度、宽度均小于油松。柴松和油松针叶的单个纵生树脂道平均面积分别为1 394.40、1 651.81μm2,单个针叶横截面的平均树脂道分别为4.87个和6.70个。柴松的早材宽度、晚材宽度均小于油松,早晚材宽度比柴松为1.97,油松为1.94。柴松和油松的早材管胞壁腔比分别为0.188、0.193,晚材管胞壁腔比分别为0.478和0.475。柴松和油松木材纵生树脂道的单个平均面积分别为3 620.69、5 113.65μm2,横生树脂道平均面积分别为2 727.62、3 571.74μm2。两者的针叶和木材解剖结构只是在各组织的大小、面积、密度等指标上存在一定差异,在解剖结构的组成上两种松之间并无明显区别。; 李龙解庆李周岐刘志红; 关键词：柴松油松针叶木材

杜仲WOX家族基因鉴定及在叶片发育中的表达: 2023年; 【目的】Wuschel(WUS)相关的同源异型盒(Wuschel-related homeobox,WOX)转录因子家族在植物生长发育中发挥重要作用。本研究旨在探索WOX转录因子在杜仲Eucommia ulmoides中的分布及表达特征。【方法】以杜仲基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对杜仲WOX家族进行全基因组鉴定;基于转录组数据分析EuWOXs在叶片发育及杜仲胶形成中的表达特征,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测EuWOXs在‘紫叶’杜仲‘Ziye’叶片不同发育时期的表达模式。【结果】杜仲基因组中共鉴定出8条EuWOXs,分布于8条染色体;EuWOXs蛋白质长度为182~352个氨基酸,理论等电点为5.10~6.47,分子量为20.7~40.4 kDa;亚细胞定位预测EuWOXs均定位在细胞核中,均为亲水性蛋白。根据系统进化关系,杜仲WOX家族包括3个亚家族,分别含2、1和5个EuWOXs基因。EuWOXs均含有内含子,并包含多个基序,启动子中富含激素、胁迫和光周期响应元件。大部分EuWOXs在杜仲叶片中表达量较低,EuWOX13-1随叶片发育表达量逐渐降低,EuWOX13-2在生长叶中表达量最高。【结论】杜仲中有8个EuWOXs基因,EuWOX13-1和EuWOX13-2可能在杜仲叶片发育中发挥重要作用。; 刘俊李龙陈玉龙陈随清; 关键词：生物信息学分析基因表达叶片发育

杜仲ARF基因家族全基因组鉴定和表达分析被引量：4: 2021年; 【目的】杜仲是我国特有的传统药用和胶用木本植物,其生长发育相关基因研究对杜仲育种有重要意义。生长素响应因子(ARF)是生长素信号转导途径中重要的转录因子,了解ARF在杜仲器官发育中的作用具有重要的理论和实际应用价值。【方法】利用杜仲全基因组测序数据鉴定杜仲ARF基因,并对这些基因进行生物信息学分析;根据杜仲EuARFs与拟南芥、水稻和欧美杨ARF蛋白的序列比对,构建系统进化树;根据转录本全长测序数据分析杜仲叶片不同生长时期的ARF基因表达谱,并利用qRT-PCR分析杜仲ARF基因与调控ARF基因的miRNA在不同器官不同发育时期的表达模式。【结果】共鉴定出18个杜仲ARF基因,根据系统进化树可以将EuARFs分为5类;miRNA靶位点分析表明eu-miR160s调控Ⅱ亚族的EuARFs,eu-miR167s调控除了EuARF8.2的V亚族的EuARFs。表达谱结果显示EuARFs在叶片不同生长时期的表达不同,其中V亚族EuARFs与Ⅵ亚族EuARF19.2在3 cm长的生长叶和完全展开的幼叶中表达量较高。qRT-PCR试验结果显示,EuARFs在正常生长条件下不同发育阶段(幼嫩和成熟)的器官(根、茎和叶)中均有表达,在根中表现为在成熟阶段上调表达,叶和茎段中表现为在成熟的器官中下调表达;eu-miR160s主要在幼嫩的根中表达,eu-miR167s则主要在成熟的叶片中表达。【结论】共鉴定出18个杜仲ARF基因,这些EuARFs在正常生长条件下不同发育阶段(幼嫩和成熟)的器官(根、茎和叶)中均有表达,根据表达量可以预测V亚族的EuARFs对幼苗的生长发育具有调控作用,EuARF19.2对杜仲叶片生长具有重要调控作用。; 刘闵豪李龙叶靖周轩辕李周岐范睿深徐郡儡; 关键词：基因表达模式

杜仲LBD基因家族全基因组鉴定与进化表达分析被引量：1: 2022年; 目的通过对杜仲LBD基因家族进行全面鉴定,以期为EuLBDs基因功能深入研究提供依据。方法以杜仲基因组数据库为基础,利用生物信息学方法,对杜仲LBD基因家族进行全面鉴定和表达模式分析。结果从杜仲基因组中共鉴定到19个EuLBDs,分为Class I与Class II 2大类,进一步划分为6个亚家族(Ia、Ib、Ic、Id与IIa、IIb)。理化性质分析显示:EuLBDs编码152~293个氨基酸,理论等电点分布于4.62~9.91,相对分子质量区域为17420~31820,均为亲水性蛋白,以α-螺旋和不规则卷曲为主,亚细胞定位于细胞核中。EuLBD基因家族含有类锌指、亮氨酸拉链和甘氨酸-丙氨酸-丝氨酸(GAS)保守结构域。表达模式分析显示,EuLBDs参与杜仲叶片发育,随着叶片发育,水平逐渐降低,EuLBDs基因表达不受叶片胶含量的影响。结论从杜仲基因组水平对LBD基因家族进行了全面鉴定和生物信息学分析,为进一步研究杜仲LBDs基因功能奠定基础。; 刘俊李龙陈玉龙吴耀松刘燕任闪闪董诚明; 关键词：系统进化基因表达

黄牡丹PlWDR3和PlWDR18转录因子基因的克隆与表达被引量：2: 2017年; 以云南野生黄牡丹为试验材料,根据已构建的云南野生黄牡丹花瓣转录组数据库提供的WDR40蛋白的Unigene筛选得到19个与花色素合成相关的WDR40蛋白同源性高的Unigene序列,命名为PlWDR1~19.通过氨基酸序列比较和系统进化树分析,发现PlWDR3和PlWDR18可能参与调控黄牡丹的花色素合成。PlWDR3的ORF包含1个1 032bp的开放阅读框,编码1个344个氨基酸的蛋白,与苹果MdTTG1的亲缘关系最近,相似性达83.29%;PlWDR18的ORF包含1个1 035bp的开放阅读框,编码1个345个氨基酸的蛋白,与葡萄VvWDR2相似性最高,达93.77%。相对荧光定量PCR分析表明,PlWDR3在黄牡丹和紫牡丹的不同时期的表达模式基本相似,在黄牡丹和紫牡丹圆桃期表达量最高,在初开期表达量最低;PlWDR18在黄牡丹花发育初期呈上升趋势,在透色期达到最高峰,然后下降,在初开期达到最小值;在紫牡丹花发育初期亦呈上升趋势,在圆桃期达到最大值,然后逐渐下降,在盛开期降到最小值。PlWDR18在黄牡丹和紫牡丹花的各个发育时期的表达量均高于PlWDR3的表达量。推测PlWDR3和PlWDR18参与黄牡丹花色形成的调控,为今后深入探讨黄牡丹花色形成机制奠定基础。; 史倩倩周琳王雁翟立娟李龙; 关键词：基因克隆

毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析: 2022年; AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析。结果表明,PheAUX1/LAX候选基因分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚组,其中classⅠ的候选基因包含6~7个外显子,而ClassⅡ的候选基因包含8~10个外显子。不同组织器官转录组数据分析表明多数ClassⅠ候选成员在毛竹冬笋中高丰度表达,而ClassⅡ中的PH02Gene38722.t在跳鞭中高丰度表达。通过qRT-PCR对AUX1/LAX候选基因在不同生长发育时期笋中的表达量分析表明,有6个候选基因与对照相比呈现出不同程度的上调表达,表明PheAUX1/LAX候选基因广泛参与毛竹笋的生长发育。本研究将为进一步研究毛竹AUX1/LAX基因的功能和调控机制奠定理论基础。; 杨乐张康李龙; 关键词：毛竹基因表达生物信息学

“遗传学”课程开展思想政治教育的探索被引量：2: 2021年; 课程思政是指在课程教学过程中潜移默化地实施德育教育、落实立德树人精神、发挥好课堂作用,是一种全方位的教育发展理念。“遗传学”是生命科学学科相关本科专业的必修专业基础课程,教学内容丰富,对学生的后续学习和研究工作具有重要影响。梳理了“遗传学”课程理论和实验教学内容,分析了蕴含在“遗传学”课程中的思政元素及其楔入点,并初步探索了“遗传学”课程思政教学实施的路径,将“遗传学”课程建设成为知识、能力和情感培养的主渠道,培养拥有社会主义核心价值观的德才兼备的生物学人才。“遗传学”课程思政教学模式的探索不仅有助于学生思想政治素质、人文素质和职业素养的提高,还大大促进了教师师德、师风和专业技术水平的提升。; 李龙史倩倩李周岐; 关键词：遗传学德育教育教学模式

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