田斌
- 作品数：44 被引量：147H指数：7
- 供职机构：西南林业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金国家林业公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学轻工技术与工程更多>>
- 云南松基因组微卫星富集文库的序列特征分析被引量：10
- 2014年
- 目的：分析基因组微卫星富集文库的序列特征，探索云南松基因组微卫星的分布特征或变异规律。方法：采用磁珠富集法，从云南松基因组DNA的RsaI酶切产物中富集微卫星片段，富集片段经洗脱分离、载体连接及转化等环节，对富集文库鉴定和测序，分析序列特征。结果：在测序获得的159条序列中，有143条序列含有重复次数不少于3次的微卫星序列，序列长度为135～1138bp，平均520bp，克隆比例为89．94％。在这些序列中，以二核苷酸重复类型最多（56．64％），其次是三核苷酸，有51条（35．66％），此外，出现少量（7．70％）重复类型为4—6bp的微卫星序列；各重复单元的碱基组成以探针及其互补序列为主，并出现少量的非探针类型；重复次数介于3—15，随着重复单元长度的增加而出现的频率降低。结论：分析了云南松基因组微卫星富集文库微卫星重复类型、重复单元碱基组成及其序列长度变异，为进一步分析云南松基因组微卫星的分布特征或变异规律奠定基础，进而为开发SSR引物提供基础信息。
- 许玉兰白青松张瑞丽田斌王大玮何承忠蔡年辉康向阳段安安
- 关键词：云南松微卫星
- 基于高通量测序的云南松转录组分析被引量：20
- 2016年
- 采用新一代高通量测序技术平台Illumina Hiseq 2 000对云南松转录组测序,得到的数据进行de novo组装,获得80 000条Unigenes,N50为1 881 nt、平均890 nt。与公共数据库进行比对,注释到NR、NT、Swiss-Prot数据库的Unigenes分别为43 434、46 415、29 418条。将Unigenes与COG数据库比对,有14 792条Unigenes成功注释,根据功能大致分成25类;与GO数据库比对,有26 743条Unigenes获得注释,按功能分为细胞组分、分子功能和生物过程3大类55亚类,其中参与的生物过程较多;以KEGG数据库参考,有25 873条Unigenes参与128条代谢途径分支,以代谢相关的通路较为集中,并找到与木质素合成关键酶的Unigenes。这些研究极大地扩充了云南松的基因资源,将有助于云南松基因的发掘与利用、分子标记的开发及其种质资源遗传改良的研究等。
- 蔡年辉邓丽丽许玉兰徐杨周丽王大玮田斌何承忠段安安
- 关键词：云南松转录组
- 木棉的SSR引物开发(英文)
- 2013年
- 木棉是分布于热带地区的重要经济树种。通过磁珠富集方法开发了木棉的SSR引物,并在采自于西南干热河谷的32个木棉个体中进行了多态性验证。结果表明:这些位点等位基因数量为2～6个,期望杂合度和观测杂合度范围分别为0～0.525和0.121～0.561。仅有一个位点显示Hardy-Weinberg平衡的偏离。这些微卫星标记的开发在木棉属中尚属首次,对于木棉的野生种群遗传多样性研究和木棉遗传资源利用上有很高的潜在价值。
- 田斌田向楠许玉兰马焕成
- 关键词：木棉微卫星标记
- 组织培养结合秋水仙素诱导滇杨四倍体的方法
- 本发明涉及植物组培技术，尤其是一种组织培养结合秋水仙素诱导滇杨四倍体的方法，其特征在于组织培养时，以滇杨的叶柄作为组培材料，并在滇杨叶柄分化培养基中加入秋水仙素诱导滇杨产生多倍体，处理时间为20-30天，处理完后转入未附...
- 辛培尧何承忠李根前姜华田斌孙正海唐军荣王大玮辛静
- 同倍体杂交物种形成研究进展
- 2014年
- 同倍体杂交物种形成是促使自然界物种多样化的重要途径。相比以往使用生态或表型特征数据,使用DNA序列数据检验同倍体杂交物种形成所得的分析结果更为准确和可靠。本文主要从同倍体杂交物种形成的条件、物种形成过程中超亲分离的作用、使用序列数据检验同倍体杂交物种的方法等方面概述同倍体杂交物种形成的最新研究进展。下一代测序技术和新统计方法的发展将加深对同倍体杂交物种形成过程的理解。
- 田斌姬明飞张亚威付义余大坤孙永帅
- 关键词：物种形成生殖隔离
- 非洲菊品种红色妖姬的组织培养研究被引量：1
- 2013年
- 以非洲菊品种红色妖姬的幼小花蕾为外植体,选用MS为基本培养基,添加不同浓度和种类的激素,筛选出该品种诱导、增殖和生根培养的较佳配方,为其工厂化生产提供理论及技术指导。结果表明,适合非洲菊品种红色妖姬的诱导培养基为MS+6-BA 8.0mg/L+NAA 0.1mg/L,增殖培养基为MS+6-BA 0.6mg/L+NAA 0.1mg/L,生根培养基为1/2 MS+IBA 0.3mg/L+NAA 0.1mg/L。研究结果有望对该品种的种质保存、工厂化育苗以及进一步的种质创新提供可参考的理论依据与技术指导。
- 田斌唐军荣郑元罗一然
- 关键词：非洲菊
- 一种红心火龙果离体组培快速成苗的方法
- 本发明属于植物繁殖技术领域，具体涉及一种红心火龙果离体组培快速成苗的方法，该方法以红心火龙果带刺座的茎段为外植体，消毒处理后拔去小刺，分别进行诱导培养、增殖培养、生根培养和移栽培养。本发明改进的刺座浸没在培养基中能够显著...
- 何承忠田斌李旦罗一然丁文沙韩国伟何小帆
- 文献传递
- 绣球藤叶片转录组分析及SSR引物开发
- 2018年
- 转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有转录本的集合,转录组研究能够从整体水平上探讨基因功能及基因结构,揭示特定生物学过程的分子机制。利用Illumina测序平台对绣球藤叶片的转录组进行测序,共得到原始reads 92 042 086个;对其测序组装总共获得202 340个unigene,长度分布于201～19 415bp之间,平均长度为642 bp;数据库中的序列同源性比较表明,95 586个unigene与其他生物的已知基因具有不同程度的同源性;绣球藤转录组中的unigene根据基因本体论(gene ontology,简称GO)功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物学过程三大类和38个亚类;将unigene与蛋白质直系同源数据库(cluster of orthologous groups,简称COG)数据库进行比对,根据其功能大致可分为26类; KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将unigene定位到5个代谢途径分支; KEGG通路分析显示,参与翻译的unigenes最多有550条,并得到10 255个简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)位点,能为今后对铁线莲属植物资源的研究和有效利用奠定基础。
- 陶仕珍田斌孙正海张睿
- 关键词：转录组测序
- 基于MaxEnt探究东亚特有属——天女花属(Oyama)的分布格局变迁
- 2023年
- 【目的】探究东亚特有属——天女花属(Oyama)的分布格局及其变迁。【方法】基于温度、降雨、土壤和紫外线辐射共58个环境变量,结合分布点数据,在MaxEnt中分别基于属和种水平对天女花属的生态位进行模拟,并推测其过去(末次冰盛期和全新世中期)及未来(2050年和2070年)4个时期的潜在分布区。【结果】自过去到未来,天女花属植物有向高纬度和高海拔迁移的趋势,但末次冰盛期到当前时期的分布区面积均减少,当前时期到未来的面积变化有增加也有减少。在不同时期,基于种水平的模拟在环境异质性高的西南地区更精确且适生区面积更大,而在东北地区不存在显著差异。基于不同水平模拟的不同时期分布区变化有不同的趋势。【结论】在未来对东亚特有属分布格局变迁模拟的研究中,需要注意不同水平模拟产生的差异并选择适合的方法。
- 何秋香吴海洋叶俊伟田斌
- 关键词：最大熵末次冰盛期
- 一种提高康乃馨切花瓶插寿命的保鲜剂及其制备方法
- 本发明公开了一种提高康乃馨切花瓶插寿命的保鲜剂，按照质量百分比由以下组分构成：仙人掌两种浸提液12％‑18％、花椒1％‑5％、三七0.5％‑0.8％、辣椒2％‑6％、天麻7％‑15％、甲壳素3％‑7％、百部0.5％‑1....
- 孙正海黄海泉王澍王明蓉扬自云田斌林开文周凡蕊周杰珑辛培尧
- 文献传递
