孙奉玉
- 作品数：8 被引量：15H指数：3
- 供职机构：南华大学药学与生命科学学院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区科学研究与技术开发计划广西海洋生物技术重点实验室主任基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生更多>>
- 广西沿海及邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性分析
- 目的：本文采用ISSR标记、RAPD标记和16SrRNA基因标记3种分子标记，分析广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹的遗传多样性和群体遗传结构，为种质资源的保护和选育提供依据。
方法：1.应用ISSR标记技术分析来自广...
- 孙奉玉
- 关键词：拟穴青蟹DNA分子标记随机扩增多态DNA线粒体DNA
- 文献传递
- 拟穴青蟹形态性状与性腺重量的相关分析被引量：1
- 2013年
- 选取16月龄池塘养殖雌性拟穴青蟹(Scylla paramamosain)67只,测量其头胸甲长(X1)、头胸甲宽(X2)、腹部宽(X3)、体重(X4)和性腺重(Y),利用相关分析和通径分析方法计算形态性状对性腺重的相关系数、通径系数和决定系数,明确影响拟穴青蟹性腺重的主要形态性状,为拟穴青蟹选育提供理论依据和技术支持。结果表明,形态性状与性腺重相关性极显著(P<0.01),其中体重对性腺重的直接影响和决定程度最大(0.736,54.2%),腹部宽次之,头胸甲长最小。通过头胸甲长、腹部宽和体重估计性腺重的多元回归方程为:Y=14.467-1.556 X1+1.626 X3+0.245 X4(R2=0.499)。
- 赵鹏宋忠魁聂振平童万平李梦芸孙奉玉
- 关键词：拟穴青蟹形态性状
- 基于RNA干扰的抗HIV-1研究被引量：1
- 2012年
- 艾滋病是由艾滋病毒感染而引起的传染病,目前在全世界广为流行,但目前还没有彻底的根治方法。该文简要综述了RNA干扰技术在抑制艾滋病毒感染中的研究进展、存在的问题和发展前景。
- 王静孙奉玉周云王芳宇
- 关键词：艾滋病艾滋病毒趋化因子受体RNA干扰
- 广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析被引量：5
- 2012年
- 采用随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术检测广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹(Scylla paramamosain)6个地理群体的遗传变异和遗传结构,8条10 bp寡核苷酸随机引物扩增99个个体,分析其中的44个位点,31个位点表现出多态性,在种水平的多态位点百分率为70.45%。POPGENE分析结果显示,6个群体的多态位点百分率为29.55%～54.55%,平均为36.97%;群体的遗传多样性自高至低排列为钦州湾群体>党江群体>珍珠湾群体>闸口群体>清化群体>流沙湾群体;群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异,群体间的遗传分化程度较大。AMOVA分析显示,群体内遗传变异占87.03%,群体间遗传变异占12.97%,群体间发生中等程度遗传分化。Mantel检测结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,群体间聚类无明显的地域性分布格局。
- 孙奉玉宋忠魁赵鹏聂振平苏琼王芳宇
- 关键词：拟穴青蟹RAPD遗传分化
- 拟穴青蟹不同大小个体遗传多样性分析被引量：1
- 2012年
- 在拟穴青蟹(Scylla paramamosain)育种实践中,建立了一种选择个体大小的策略,应用ISSR和RAPD标记技术并以拟穴青蟹雄性个体组建供试群体检验所建立的选择策略的有效性.ISSR与RAPD标记方法的分析数据都表明,大、中、小个体组的几个对应遗传参数值高低依次按中个体组、大个体组、小个体组排列.其基因多样性的Nei’s分析表明,ISSR分析所得到的总遗传多样性(Ht=0.322 3)、平均遗传多样性(Hs=0.270 1)、遗传分化系数(Gst=0.162 2),均高于RAPD分析得出的对应遗传参数值(Ht=0.274 6,Hs=0.233 6,Gst=0.149 3).基于ISSR数据的遗传分化系数表明大、中、小个体组组间遗传分化程度达到较高水平,而基于RAPD数据的遗传分化系数表明大、中、小个体组组间遗传分化程度达到中等水平.上述结果表明应用ISSR标记技术比应用RAPD标记技术能揭示出更加丰富的遗传变异信息.基于ISSR和RAPD分析数据的组间遗传分化系数表明,大个体组与小个体组间的遗传分化系数最高(Gst值分别为0.165 8、0.139 9),与中个体组间的次之(Gst值分别为0.156 6、0.127 2),中个体组与小个体组间的遗传分化系数最低(Gst值分别为0.050 5、0.082 4).基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析结果表明,ISSR和RAPD分析数据均支持大个体组优先分离.基于Dice’s系数的个体聚类分析结果也揭示了大个体组个体优先分离并呈现出单独聚类趋势.这表明ISSR与RAPD分析数据均支持了拟穴青蟹个体大小选择策略的有效性.此外,研究结果也表明:拟穴青蟹供试群体遗传多样性高低分布趋势与群体内的不同个体类型的数量分布趋势基本一致,呈正态分布趋势;大个体组的遗传多样性高于小个体组,或小个体组的遗传多样性高于大个体组并不影响大个体组作为育种材料的潜力.
- 宋忠魁孙奉玉赵鹏蔡小辉王芳宇聂振平
- 关键词：海洋生物学拟穴青蟹育种ISSRRAPD
- 北部湾拟穴青蟹(Scylla paramamosain)群体遗传结构及其扩张分析被引量：5
- 2012年
- 利用线粒体16SrRNA基因片段分析北部湾拟穴青蟹群体遗传结构及其扩张历史。结果表明,16SrRNA基因片段长度在521—523bp之间,6个拟穴青蟹群体具21种单倍型。群体总体水平的单倍型多样性(h)和核甘酸多样性(π)分别为0.6259和0.001851。群体间遗传距离与地理距离之间无相关性。群体间遗传分化系数(Gst)在0.02008—0.04362之间,基因流(Nm)值在5.48—12.20之间。AMOVA分析表明,群体间遗传变异占0.1%,群体内遗传变异占99.9%。群体间固定指数(Fst)的绝对值在0.00026—0.02977之间,暗示群体间没有产生遗传分化。单倍型邻接树和单倍型中介网络图显示,单倍型没有按采样地形成谱系分支。中性检验和错配分析揭示,北部湾拟穴青蟹群体在历史上经历过群体扩张。群体扩张时间大致在更新世晚期的0.04698—0.01879MY前或0.04520—0.01808MY前。
- 宋忠魁李梦芸聂振平孙奉玉赵鹏苏琼
- 关键词：拟穴青蟹RRNA基因
- HIV-1 pol基因人工miRNA的构建和功能分析
- 2012年
- 以miR-155为基础骨架,根据HIV-1 pol基因序列设计并合成4对miRNA寡聚单链DNA,构建4个人工miR-pol,并对其进行功能分析.qPCR结果显示,4个人工miR-pol对pol基因都具有一定的沉默效果,其中miR-pol-4的沉默效率最高,达76%.进一步的实验证实miR-pol-4不会影响被转染细胞的活性,也不会对细胞干扰素的表达产生影响.此外,HIV-1假病毒实验显示,miR-pol-4对HIV-1的复制具有良好的抑制作用.因此,所获得的miR-pol-4将可为进一步的抗HIV-1感染研究提供基础.
- 王芳宇何丽芳孙奉玉滕涛张志坚焦京
- 关键词：HIV-1RNA干扰
- 北部湾6个拟穴青蟹群体遗传多样性的ISSR分析被引量：3
- 2012年
- 应用ISSR标记技术分析来自北部湾的拟穴青蟹6个地理群体(清化、党江、钦州湾、流沙湾、珍珠湾、闸口)的遗传变异和遗传结构,8条ISSR引物扩增111个个体,分析其中的66个位点,56个位点表现出多态性,表明拟穴青蟹在物种水平上的多态位点百分率是84.85%。拟穴青蟹6个群体的多态位点百分率为51.52%～63.64%,平均为57.58%。群体的遗传多样性按自高至低顺序排列为清化群体>党江群体>钦州湾群体>流沙湾群体>珍珠湾群体>闸口群体。拟穴青蟹在种水平或群体水平上的多态位点百分率和Shannon信息指数表明,拟穴青蟹遗传多样性在甲壳类动物中处于较高层次,但比甲壳类以外的几类经济海产动物遗传多样性低。总的遗传分化系数GST值为0.1841,表明,总遗传变异的绝大部分存在于群体内,群体间的遗传分化程度较大。但是,绝大部分两两群体间的遗传分化系数值在0.0689～0.1276,为中等程度的遗传分化。AMOVA分析表明,群体内遗传变异占87.97%,群体间遗传变异占12.03%,群体间遗传分化程度中等但分化显著。Manteltest结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,来自广西沿海的4个群体聚成一支。
- 宋忠魁孙奉玉李梦芸赵鹏聂振平苏琼
- 关键词：拟穴青蟹ISSR遗传分化
