宋锐
- 作品数:5 被引量:25H指数:3
- 供职机构:四川农业大学玉米研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 用生物信息学挖掘玉米中的microRNAs及其靶基因被引量:14
- 2010年
- microRNA(miRNA)是一类内源性的、19~24碱基长度的小分子非编码RNA,通过碱基互补调控靶基因的表达,在多细胞生物的基因表达调控过程中扮演着十分重要的角色。植物中的miRNAs具有高度的保守性,这为通过同源比对发现保守的miRNAs提供了思路和途径。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的miRNAs与玉米EST和GSS数据库的比对,并设置一系列严格的筛选标准,共筛选到23条新的玉米miRNAs;利用WMD3在线植物miRNAs靶基因预测软件,对新发现的玉米miRNAs进行靶基因预测,总共预测到89个靶基因,进一步功能分析发现,这些靶基因参与玉米的生长发育、信号转导、转录调节、新陈代谢及逆境胁迫响应等调控过程。
- 张志明宋锐彭华罗茂沈亚欧刘丽赵茂俊潘光堂
- 关键词:生物信息学靶基因玉米
- 玉米丝裂病的抗性QTL定位被引量:1
- 2009年
- 选用感丝裂病的玉米自交系R08与抗丝裂病的自交系Es40组配F2群体共348个单株,构建了包含115个SSR标记的分子遗传连锁图谱,覆盖玉米基因组2178.6cM,平均图距为18.9cM。采用复合区间作图法,对F2:4家系丝裂病数据进行抗性QTL分析,共检测到12个QTL,分别位于第1、2、4、5和7染色体,贡献率为4.22%~37.95%。其中在第1、3染色体上检测到主效QTL,贡献率均大于30%,基因作用方式均为显性,其余10个QTL的作用方式多为加性或部分显性。
- 魏昕李丽华王振华宋锐曾兴张志明荣廷昭潘光堂
- 关键词:玉米QTL定位SSR
- 玉米纹枯病胁迫相关miRNA功能研究被引量:9
- 2013年
- microRNA(miRNA)是一类内源性的、19-24个碱基长度的小分子非编码RNA,通过碱基互补调控靶基因的表达,参与调控植物生长发育,并在多种非生物与生物胁迫响应中发挥重要作用。但目前关于玉米纹枯病胁迫相关miRNA表达调节与功能尚不完全清楚。利用生物信息学挖掘玉米中的microRNA及其靶基因,筛选到23条新的玉米miRNA,预测到89个靶基因。本文在前期研究基础上,以对纹枯病抗性不同的自交系R15和掖478作为对象,采用半定量方法对预测获得部分miRNA前体初步鉴定,采用实时荧光定量PCR手段对R15和掖478中表达存在差异的成熟miRNA进行抗纹枯病组织特异性表达验证。结果提示,部分miRNA在玉米抗纹枯病胁迫过程中可能起着重要的调控作用。
- 罗茂彭华宋锐高健潘光堂张志明
- 关键词:MIRNA半定量实时荧光定量PCR玉米
- PRRSV-ORF5基因与结核杆菌HSP70基因的融合表达研究
- 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是目前困扰养猪业的一道世界性难题,研究表明PRRSV-GP5蛋白是PRRSV的主要保护性抗原,能引起有效的免疫应答,其编码基因ORF5是开发猪繁殖与呼吸综合征基因工程疫苗的重要目的基因。同时...
- 宋锐
- 关键词:HSP70基因猪繁殖与呼吸综合征结核杆菌
- 文献传递
- 基于生物信息学方法预测玉米抗纹枯病相关miRNA及功能分析
- microRNA(miRNA)是广泛存在于真核生物细胞内的一大类内源性的、18-25 bp的小分子非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在多细胞生物的基因表达调节和控制中扮演着十分重要的角色,并参与植...
- 宋锐
- 关键词:生物信息学玉米纹枯病遗传育种
- 文献传递