张坤
- 作品数:4 被引量:6H指数:1
- 供职机构:河北农业大学更多>>
- 发文基金:河北省自然科学基金国家自然科学基金转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域:生物学自动化与计算机技术经济管理农业科学更多>>
- 牛PEG11基因生物信息学分析
- 2013年
- 采用生物信息学方法对牛PEG11基因进行分析,为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机理奠定基础。选取6种哺乳动物PEG11基因的CDS序列作为研究对象,进化分析表明:包括牛、羊、小鼠、熊猫、猪和人在内的6种哺乳动物间的遗传距离小于0.109,且牛与猪遗传距离最小,为0.036,与基因进化树分析结果一致。CpG岛在线软件预测显示,在牛中该基因上游5kb内没有CpG岛。启动子在线软件预测和转录因子分析相结合显示,启动子可能位于该基因5′端上游2 181~2 131bp处,此区域包括大量潜在转录因子结合位点,并在2 173bp处存在一个TATA框。蛋白质在线软件分析表明,PEG11基因编码一种螺旋形跨膜蛋白质,有α-螺旋、β-转角和自由卷曲3种二级结构。
- 石运娇苏红张坤李冬杰李世杰
- 关键词:生物信息学
- 基于单片机的仓库防火预警系统研究
- 仓库是一个企业物资集中储存的重要场所,仓库安全是仓库管理的首要目标,而对仓库安全的威胁主要来自人为的破坏和仓库物资因存储环境的变化或物资本身的自变,其中人为的引起火灾是仓库安全威胁最大的因素。一旦发生火灾,会造成严重的经...
- 张坤
- 关键词:火灾探测器单片机
- 牛Meg9基因的序列预测与分析、可变剪切体的表达及印记状态研究
- 基因组印记是一种表观遗传现象,是指来自亲本的等位基因在发育过程中产生专一性表观遗传修饰而使基因表达具有亲本特异性。印记基因表达紊乱会导致哺乳动物胚胎和胎盘的发育异常。通过包括体细胞核移以及体外受精等辅助繁殖技术得到的动物...
- 张坤
- 关键词:胚胎发育细胞分化
- 牛Meg9基因序列及结构的预测与分析
- 2012年
- 应用生物信息学方法对牛Meg9基因的序列进行预测及分析,发现牛Meg9基因共含有3个外显子,存在3种可变剪切体。与鼠、人和羊序列进行相似性分析,发现牛Meg9基因与绵羊相似性最高,为92%。应用在线软件对牛Meg9基因启动子区及转录因子结合位点进行预测,发现启动子可能位于5′侧翼区1 903~1 953bp处,有16种转录因子结合位点。CpG Island在线软件分析发现牛Meg9基因5′侧翼区和内含子1处共有3个CpG岛。以上研究结果将为研究牛Meg9基因的功能及印记的分子机理奠定基础。
- 张坤苏红石运娇李冬杰李世杰
- 关键词:启动子CPG岛