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大竹蛏AFLP分子标记反应体系的建立与优化被引量：5: 2011年; [目的]建立一套适合大竹蛏的AFLP分子标记反应体系,为大竹蛏的遗传多样性研究提供技术支持。[方法]采用比较实验法,以大竹蛏基因组DNA为模板,对其AFLP体系中的酶切时间、预扩产物稀释倍数及选扩引物E+3/M+3的配比等进行优化。[结果]优化的AFLP体系为:酶切时的DNA模板浓度为100 ng/μl,双酶切2 h;预扩模板最佳用量1.0μl;预扩产物的最适稀释倍数为40倍;选扩引物浓度配比为1∶4。同时,筛选出12对引物组合,可用于大竹蛏的AFLP分析。[结论]采用优化的AFLP反应体系及筛选后的引物,对大竹蛏群体进行了初步扩增,得到了清晰的电泳图谱。; 张滔刘相全孙国华刘丽娟孙振兴; 关键词：大竹蛏 AFLP 分子标记

大竹蛏5个地理群体遗传多样性的AFLP分析: ＜正＞大竹蛏（Solen grandis）是沿海潮间带常见的一种大型食用经济贝类,也是贝类养殖的潜在对象。本文应用扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism,AFLP...; 张滔刘相全孙振兴; 关键词：大竹蛏 AFLP标记; 文献传递

大竹蛏(Solen grandis)不同地理群体遗传多样性的AFLP分析被引量：8: 2013年; 应用AFLP分子标记技术对我国沿海大竹蛏(Solen grandis)群体的遗传多样性进行了分析,利用筛选出的7对AFLP引物,对丹东、烟台、莱州、日照和南通5个地理群体的141只大竹蛏个体进行了扩增,共得到了403个位点,片段大小在100—700bp之间。其中丹东、烟台、莱州、南通4个群体的大竹蛏遗传多样性水平接近,日照群体的多态位点比例高于其它4个群体,结合Shannon’s信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)看,日照群体的遗传多样性水平最高,而南通群体的遗传多样性水平最低。AMOVA分析得到群体间遗传分化系数Φst=0.2250(P<0.001),群体间的变异百分率为22.5%,群体内为77.5%,说明群体的遗传变异主要来源于群体内个体间的遗传差异,但群体间也存在一定程度的基因渗透。; 张滔刘相全孙振兴乔洪金孙国华刘丽娟宋向军; 关键词：大竹蛏 AFLP

大竹蛏群体遗传多样性的研究: 大竹蛏（Solen grandis）是我国沿海潮间带常见的一种大型食用经济贝类，也是贝类养殖的潜在对象。本文应用扩增片段长度多态性（amplified fragment lengthpolymorphism, AFLP）...; 张滔; 关键词：大竹蛏 AFLP标记微卫星标记; 文献传递

大竹蛏(Solen grandis)cDNA文库中微卫星标记的筛选被引量：5: 2012年; 利用微卫星查找软件SSRIT对大竹蛏cDNA文库(2038条EST)中2—6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行了筛选。最少重复次数设定为5次,共发现包含微卫星位点的EST96条,占整个EST数据库的4.71%;共发现微卫星位点103个,其中含双碱基重复序列77个,数量最多,占总数的74.76%;三、四碱基重复序列分别占微卫星序列总数的22.33%、2.91%,没有发现五或六碱基的重复。对含有SSR位点符合微卫星引物设计的EST序列,利用在线引物设计软件Primer3设计合成引物14对,以南通野生群体为模板PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳发现,其中5对有多态性位点。在5个微卫星位点上,等位基因的数目从2—7个不等,观测杂合度和期望杂合度分别为0.067—1.000和0.066—0.775,香农指数在0.146—1.545之间。结果表明,所筛选的微卫星标记可用于遗传分析。; 乔洪金刘相全孙国华房景辉韦秀梅张滔; 关键词：大竹蛏微卫星表达序列标签等位基因

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张滔