汤仁树
- 作品数:17 被引量:54H指数:3
- 供职机构:合肥市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:合肥市科技计划项目公益性行业科研专项国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 合肥市肉鸡沙门菌携带情况调查
- 2014年
- 目的了解合肥市养殖屠宰环节中肉鸡沙门菌的带菌率、血清型分布、抗生素耐药谱分布以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况,为合肥市食品安全提供科学的基础数据,为进一步加强合肥市公共卫生安全提供科学依据。方法 2010年7-9月对合肥市10家肉鸡养殖场和14家屠宰户分别采用肛拭法和胴体漂洗法采集45份肉鸡活体和45份肉鸡胴体标本,根据GB/T 4789.4-2010对沙门菌进行分离、鉴定以及血清学分析;并采用PCR方法进行复核鉴定;对最终确定的阳性菌株使用临床实验室标准化协会(CLSI)推荐的纸片法进行药敏试验;同时采用PFGE方法确定其分子分型。结果在45份肉鸡活体样本中未检出沙门菌;45份肉鸡胴体样本中检出12株沙门菌,检出率为26.7%,经PCR复核检测,所分离的12株沙门菌对invA和hilA基因的携带率均为100%;12株沙门菌分为3种血清型,其中9株为印第安纳沙门菌,2株为鼠伤寒沙门菌,1株为肠炎沙门菌;12株沙门菌对实验中所采用的15种抗生素总耐药以及多重耐药菌株数均为10株;12株沙门菌共分出7种PFGE带型,9株印第安纳沙门菌共分离出5种不同的PFGE带型;同一血清型的沙门菌分子分型结果,基本位于同一大簇中;相同PFGE带型的菌株,耐药谱非常接近。结论合肥市肉鸡胴体沙门菌检出率高,沙门菌的血清型、药敏性以及基因型具有多样性特征,耐药现象严重,相同PFGE带型的菌株,耐药谱非常接近。
- 岳峰王海杜国强汤仁树崔志刚陶芳标
- 关键词:肉鸡沙门菌血清型耐药性分子分型
- 感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学分析被引量:7
- 2011年
- 目的 研究感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学特点.方法 对2008-2010年湖州地区的感染性腹泻疫情标本共119份进行诺如病毒核酸检测,并选取部分阳性扩增产物经序列测定分析诺如病毒的基因型.结果 119份感染性腹泻标本荧光定量PCR检测阳性50份,其中GⅠ型9份,GⅡ型35份,GⅠ和GⅡ混合感染6份.对12份PCR扩增阳性产物进行序列分析显示:5株GⅠ型诺如病毒毒株分属于GⅠ/2和GⅠ/3两种基因型;7株GⅡ型诺如病毒毒株中除1株属于新基因型GⅡb外,其余6株均属于GⅡ/4基因型.结论 诺如病毒是引起湖州地区感染性腹泻疫情最重要的病原菌之一,且湖州地区的诺如病毒存在很高的遗传多样性,同时也存在基因型别的差异.
- 吴晓芳纪蕾徐德顺韩建康沈月华陈莉萍查赟峰汤仁树姚文庭
- 关键词:诺如病毒腹泻流行病学分子
- 合肥市某小学急性呼吸道感染疫情的病原学分析被引量:3
- 2018年
- 目的分析合肥市某小学一起急性呼吸道感染疫情病原学,为疫情发生的生物学病因提供依据。方法采用实时荧光PCR方法(Real-time PCR)对采集的10份患者咽拭子标本进行流感病毒和腺病毒核酸筛查,检出的腺病毒核酸阳性标本经普通PCR扩增腺病毒六邻体基因片段以进行序列测定,测序结果在Genbank上进行Blast比较并作系统进化树分析,以确定其病毒型别。结果 10份咽拭子标本流感病毒核酸检测结果均为阴性,7份标本检出腺病毒核酸,进一步通过基因测序、序列比对、基因进化树分析确定为腺病毒3型。结论依据实验室检测结果并结合流行病学调查和临床症状,确认该起急性呼吸道感染疫情的病原体为人腺病毒3型。
- 陈煚金晶周虎啸赵科伕汤仁树张文艳
- 关键词:腺病毒急性呼吸道感染暴发疫情分子生物学
- 一起急性胃肠炎聚集性疫情的病原学诊断及基因型分析被引量:2
- 2023年
- 目的 了解合肥市某工地一起急性胃肠炎聚集性疫情的病原及其基因型。方法 采用实时荧光PCR方法对16份肛拭子标本和7份水样标本进行诺如病毒、札如病毒和星状病毒核酸筛查,对诺如病毒核酸阳性标本采用RT-PCR扩增Rd Rp-VP1区基因,并进行基因序列测定,在线比对确定病毒基因亚型,运用MEGA软件构建基因进化树,进行基因比对和进化分析。结果 14份肛拭子和2份水样标本诺如病毒核酸阳性,札如病毒和星状病毒核酸均阴性,获得9条诺如病毒Rd Rp-VP1区基因序列,均为GⅡ. P17-GⅡ. 17型。结论 这是一起因饮用水污染GⅡ. P17-GⅡ. 17型诺如病毒引发的急性胃肠炎暴发疫情。
- 宋永庆金晶汤仁树朱引娣张文艳
- 关键词:诺如病毒胃肠炎聚集性疫情病原学检测
- 2018—2022年合肥市学校诺如病毒感染疫情特征分析
- 2024年
- 目的了解合肥市学校诺如病毒感染疫情的流行特征,为校园诺如病毒感染预防与控制提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法,分析2018—2022年合肥市各县(市、区)疾病预防控制中心上报的诺如病毒感染疫情调查报告和合肥市疾病预防控制中心实验室检测结果等资料,比较诺如病毒感染罹患率、报告及时性、疫情持续时间、临床症状及诺如病毒GⅠ、GⅡ分型等相关指标。结果2018—2022年合肥市共发生学校诺如病毒感染疫情217起,发病3002例,波及人口314006人,年均罹患率为0.82%~1.32%。其中幼儿园疫情最多,为116起,占53.46%,罹患率2.87%。时间呈双峰分布,集中在每年3—6月和9—12月。暴发疫情的罹患率、疫情持续时长均高于聚集性疫情(均P<0.001)。疫情接报时长与接报时发病数、疫情持续时长均呈正相关(r值分别为0.182、0.783,均P<0.001)。随着学业阶段提升,腹泻症状呈上升趋势(χ^(2)_(趋势)=743.236,P<0.001),呕吐症状呈下降趋势(χ^(2)_(趋势)=386.888,P<0.001),腹泻和呕吐两者症状皆有呈上升趋势(χ^(2)_(趋势)=327.264,P<0.001),发热呈下降趋势(χ^(2)_(趋势)=15.717,P<0.001)。肛拭子标本阳性检出率(60.10%)高于呕吐物和环境标本(分别为38.71%、14.29%;χ^(2)=135.685,P<0.001)。实验室明确诺如病毒GⅠ、GⅡ分型疫情181起,其中GⅠ型28起,占15.47%,GⅡ型149起,占82.32%。结论学校是诺如病毒感染高发场所,开学季应严格落实各项防控措施,提高呕吐、腹泻等症状监测敏感性,做到早发现、早报告、早处置。
- 张强曾臻桑燕茹汤仁树张磊陈伟刘振武吴金菊刘旭祥
- 关键词:诺如病毒托幼机构呕吐腹泻疫情
- 一起急性胃肠炎暴发疫情的病原分子特征分析被引量:1
- 2021年
- 目的了解合肥市一起急性胃肠炎疫情的病原分子特征。方法采用实时荧光PCR(Real-time PCR)对13份肛拭标本同时进行札如病毒、诺如病毒、星状病毒核酸检测,检出的札如病毒核酸阳性标本采用传统RT-PCR扩增VP1基因片段,并测定基因序列,构建系统进化树。结果 Real-time PCR检出8份札如病毒核酸PCR阳性标本,诺如病毒、星状病毒核酸结果均为阴性。1份RT-PCR扩增产物测序成功,基因序列比对和进化分析显示为札如病毒GⅡ.3基因亚型。结论引起该起急性胃肠炎疫情的病原体为GⅡ.3型札如病毒。
- 金晶史永林张文艳汤仁树周伟刘玮朱引娣
- 关键词:札如病毒急性胃肠炎进化分析
- 合肥市2017年严重急性呼吸道感染住院病例流感病毒检测结果分析被引量:1
- 2020年
- 目的了解合肥市严重急性呼吸道感染(SARI)住院病例流感病毒感染情况。方法收集2017年1~12月合肥市哨点医院SARI病例咽拭子标本,采用实时荧光RT-PCR方法开展流感病毒核酸检测。结果监测住院SARI病例333例,其中儿内科254例(占76.28%);2~14岁SARI病例最多,占全年监测病例总数的62.46%;流感病毒核酸阳性病例45例,阳性率为13.51%,其中H3阳性病例30例、甲型H1N1阳性病例2例、H7N9阳性1例、乙型流感阳性病例12例。结论合肥市严重急性呼吸道感染住院病例以儿童为主,流感病毒感染以甲型H3为主。
- 汤仁树赵科伕金晶周伟刘玮张文艳
- 关键词:流感病毒
- 合肥地区慢性无症状乙肝病毒携带者HBV s基因变异研究被引量:2
- 2015年
- 目的了解合肥地区慢性无症状乙肝病毒携带者(As C)体内HBV s基因的变异情况。方法自慢性肝炎患者血清中提取HBV基因组DNA,扩增其s基因片段并进行序列分析,用MEGA 3.1和Clustalx 1.8软件为所测基因进行分型,并通过比对s基因序列,分析s基因变异情况。结果 27例样品中,B型13例(48.1%),C型14例(51.9%),未发现混合型和其他基因型。有12例(44.4%)标本s基因发生突变,其中B型6例,C型6例;单位点突变有8例,多位点突变有4例,其中B型有2例在氨基酸133位点发生突变(Met→Leu)。结论 27例慢性无症状乙肝病毒携带者HBV的基因型为B型和C型,As C患者体内HBV病毒s基因存在突变现象,并且突变位点随机,突变形式有单点突变和多位点突变。
- 张文艳李明汤仁树桂云金晶马尔健
- 关键词:乙型肝炎病毒S基因慢性乙型肝炎患者
- 一起食用苦瓠子引起幼儿食物中毒调查被引量:3
- 2012年
- 2012年5月,合肥市某幼儿园发生一起幼儿群体性食物中毒事件。经流行病学调查,并根据临床表现及实验室检测,证实是因食用苦瓠子引起的食物中毒。
- 吴金菊马尔健贾皓旻张洁莹侯勇张鹏川韩红梅李昌安汤仁树
- 关键词:食物中毒流行病学研究儿童
- 一起疱疹性咽峡炎疫情病原学分析被引量:1
- 2024年
- 目的 了解2020年合肥地区一起幼儿园疱疹性咽峡炎(HA)聚集性疫情病原体型别及基因进化情况。方法采用实时荧光定量RT-PCR方法对11份咽拭子标本进行肠道病毒(EV)病原检测,柯萨奇病毒A6型(CVA6)核酸阳性的标本经传统RT-PCR扩增VP1基因,进行序列测定,用MEGA 6.0软件构建基因进化树。结果 11份咽拭子标本中6份CVA6核酸阳性,6条基因序列均为CVA6 D3亚型。结论 CVA6 D3型是引起本次幼儿园HA疫情的病原体,应加强对肠道病毒的监测,重视在幼托机构暴发的此类疫情。
- 朱引娣金晶汤仁树尤恩情刘玮周伟张文艳
- 关键词:疱疹性咽峡炎聚集性疫情基因型