章丽娟
- 作品数：8 被引量：84H指数：5
- 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项中美新发和再发传染病合作项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于微流控的核酸片段分离技术用于伤寒沙门菌MLVA分型的研究被引量：1
- 2009年
- 目的探讨和优化基于微流控技术的DNA片段分离技术用于伤寒沙门菌多位数目可变串联重复序列分析(MLVA)的方法。方法制备与分析片段长度相似的内标来提高实验结果分析的重复性;用Agilent 2100分析仪和序列测定技术分析伤寒沙门菌10个数目可变串联重复序列(VNTR)位点的PCR产物,比较2种方法的一致性,优化基于微流控的DNA片段分析技术。结果新内标能够提高方法的重复性;使用Agilent 2100分析仪电泳以及新内标校正片段后,具备相同重复单元拷贝数的VNTR扩增产物具有相同的电泳位置,通过序列测定证实了这些分析结果。结论优化的基于微流控技术的DNA片段分离方法能够提高短重复序列MLVA分析的准确性,可应用于伤寒沙门菌的MLVA分析。
- 王洪霞崔志刚熊礼凤章丽娟阚飙
- 关键词：伤寒沙门菌微流控
- 脉冲场凝胶电泳分型技术在追溯O139霍乱传染来源中的应用被引量：36
- 2006年
- 目的分析四川省2004年7起因聚餐暴发霍乱疫情的分离菌株之间,及其与常规监测中从外环境、水产品中分离的霍乱弧菌之间的分子分型特征和遗传相关性,查找霍乱传染来源。方法利用聚合酶链反应检测霍乱毒力基因(ctxAB),用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型,所得结果以BioNumerics V4.0软件UPGMA方法进行聚类分析。结果所试72株O139群霍乱弧菌中所有4株从河水分离的菌株ctxAB阴性,其余均具有ctxAB,为产毒株。对其中的67株菌以NotⅠ酶切后PFGE可分为16个型别。从甲鱼分离的O139群霍乱弧菌与同期流行的O139群霍乱弧菌优势PFGE型别一致,并且也为产毒株。7起暴发中分离的菌株型别各不相同。结论2004年四川省O139霍乱暴发感染来源复杂,提示并非因为菌株在该地持续存在而引起,但甲鱼可能是2004年度霍乱聚餐暴发的主要传染来源之一。
- 刘红露张京云冯泽惠李伟崔志刚章丽娟祝小平阚飙
- 关键词：霍乱脉冲场凝胶电泳分子分型
- 肠炎沙门菌可变数目串联重复序列位点用于多位点可变数目串联重复序列分型分析的评价被引量：6
- 2011年
- 目的 评价不同肠炎沙门菌可变数目串联重复序列（VNTR）位点用于多位点可变数目串联重复序列（MLVA）分型的可行性.方法 选取已报道使用的肠炎沙门菌11个VNTR位点,对中国不同时间和地区分离的16株菌进行初步评价,选取具有单一扩增条带的位点进行104株肠炎沙门茵的MLVA分型分析.对这些菌株同时进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析,比较MLVA分型方法与PFGE分型方法对菌株分型能力的强弱.结果 初筛得到7个VNTR位点用于扩大菌株的分析,这些位点将104株菌分为16个MLVA型别,D值为0.7222,这些菌株同时被分为22个PFGE型别,D值为0.7974.对两种方法各自所分的最大组包含的菌株进行比较,发现PFGE具有更强的分辨能力;从频数分布看,PFGE方法分型结果比较分散,MLVA分型较为集中.结论 用于国际肠炎沙门菌分型具有扩增多态性的VNTR位点在国内分离株中并不都具有多态性结果,在MLVA方法学建立中应选择更多的VNTR位点进行广泛的筛选才有利于国际实验室间的方法的统一.
- 张力韩辉周海健崔志刚闫梅英章丽娟阚飙
- 关键词：细菌分型技术串联重复序列
- 中国四省甲型副伤寒分离株脉冲场凝胶电泳分析及分型数据库建立被引量：16
- 2006年
- 目的对中国4个甲型副伤寒流行省份的分离株进行标准化脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型分析。方法对来自4个省的甲型副伤寒沙门菌利用XbaⅠ酶切染色体DNA进行PFGE分析,利用BioNumerics建立数据库和进行相似性聚类。结果分离自1998-2002年的89株甲型副伤寒分离株共有11种PFGE带型,这些菌株中具有优势带型。有3种带型相似性在96．3％,这3种带型的菌株占到分析菌株的86．5％,并在不同省份和年度中出现。结论建立了中国甲型副伤寒沙门菌的用于网络监测分析的PFGE技术和数据库,近年中国部分省份的甲型副伤寒沙门菌分离株PFGE型别集中,存在同型菌株的广泛流行。
- 李伟崔志刚张政田克诚钟豪杰朱凤才梁未丽章丽娟阚飙
- 关键词：甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳
- 脉冲场凝胶电泳和自动化核糖体分型方法用于霍乱弧菌分子分型能力的比较被引量：3
- 2011年
- 目的比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和自动化核糖体分型两种方法对霍乱弧菌的分型能力。方法应用PFGE和自动化核糖体分型分析254株O1群和37株O139群霍乱弧菌,比较两种方法的分型力、分辨力和对暴发菌株的分析能力。结果 PFGE将254株O1群和37株O139菌株分别分为211和21个型别,分型D值分别为0.9952和0.9339;自动化核糖体分型将同样的菌株分为101和10个型别,分型D值分别为0.9075和0.8033。PFGE和自动化核糖体分型均可以区分O1群霍乱的暴发相关和不相关菌株。PFGE能够将不同起O139暴发来源的菌株分开,同时将相同暴发来源的菌株分为相同的型别;自动化核糖体分型不能完全区分不同起O139暴发来源的菌株,也不能将同起O139霍乱暴发来源的菌株分为相同的型别。结论在霍乱弧菌分型方面,PFGE和自动化核糖体分型方法均具有相同的分型力,但PFGE具有更高的分辨力和更好的暴发菌株分析能力。自动化核糖体分型方法在霍乱暴发调查中具有局限性,更适合用于菌株鉴定。
- 周海健张力韩辉刁保卫逄波章丽娟阚飙
- 关键词：脉冲场凝胶电泳分子分型霍乱弧菌
- 沙门菌监测点汤卜逊沙门菌分离株的分子分型和耐药性分析被引量：4
- 2009年
- 目的应用分子分型技术对2007年上海和重庆市沙门菌监测点的50株汤卜逊沙门菌进行分子流行病学分析和抗生素敏感性测定,了解上海和重庆两地菌株的分子分型特征和药物敏感性特征。方法抗生素敏感性测定采用微量肉汤稀释法,分子分型方法包括脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点串联重复序列分析(MLVA)。结果药敏试验显示78%的菌株存在多重耐药,其中磺胺甲恶唑和四环素的耐药率最高,其次是甲氧苄胺嘧啶;对头孢类抗生素(头孢噻肟、头孢三嗪、头孢他啶、头孢噻呋)均未产生耐药性。PFGE将50株菌分为15个带型,30株重庆分离株间有较高的相似性;MLVA分析显示除Sal16位点外,其余检测位点在所有待检菌株中没有差别。结论分子分型支持汤卜逊沙门菌引起的暴发以及散发。目前MLVA分型应用于汤卜逊沙门菌分子分型时,分型能力低于PFGE,需要进一步优化。
- 梁未丽王洪霞周海健李志锋许学斌李勤张代涛陈春霞于礼闫梅英章丽娟冉陆阚飙
- 关键词：脉冲场凝胶电泳分子分型
- 汤卜逊沙门菌暴发分离株的鉴定及与丙型副伤寒沙门菌的鉴别被引量：8
- 2009年
- 目的探讨丙型副伤寒、猪霍乱以及汤卜逊沙门菌的血清型鉴定要点,评价不同诊断血清的鉴定能力。方法用三家不同生产厂家的沙门菌诊断血清对丙型副伤寒、猪霍乱、猪霍乱库氏变种沙门菌三株标准株以及GSS中国区监测的疑似丙型副伤寒暴发分离株、猪霍乱和汤卜逊沙门菌进行血清鉴定,同时利用PCR、生化、以及MLST分型分析对这些菌株进行辅助分析。结果血清分型显示暴发菌株为汤卜逊沙门菌,那些原来鉴定为猪霍乱沙门菌的菌株也是汤卜逊沙门菌;PCR结果显示这些暴发菌株和散发菌株的Vi基因为阴性;还发现某些诊断血清的H:c因子血清能够与H:k抗原发生交叉凝集,从而导致血清型的误判;另外,MLST分型分析显示这些汤卜逊沙门菌菌株与丙型副伤寒、猪霍乱等沙门菌之间有差异;卫矛醇、粘液酸和H2S三种生化反应显示丙型副伤寒、猪霍乱、猪霍乱库氏变种沙门菌之间具有明显的生化差别。结论近期我国报告为丙型副伤寒的暴发中,需要鉴定是否为汤卜逊沙门菌所致,注意诊断血清的交叉反应所致的误判,可用生化鉴定、MLST分型分析以及PCR等方法进一步鉴定。
- 王洪霞张代涛李志峰许学斌李勤王晓梅崔志刚章丽娟冉陆阚飙
- 关键词：丙型副伤寒沙门菌血清分型MLST
- 沙门菌脉冲场凝胶电泳分型与血清型的对应关系被引量：12
- 2013年
- 目的 分析沙门菌脉冲场凝胶电泳分型（PFGE）与血清分型之间的对应关系.方法 选择中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络PulseNet China沙门菌监测数据中鼠伤寒（Typhimurium）、肠炎（Enteritidis）、德尔卑（Derby）、阿贡纳（Agona）及山夫登堡（Senftenberg）前五位常见血清型菌株共1230株,进行PFGE聚类分析,以血清分型作为参照进行比对.确定这5种血清型PFGE优势带型的共有条带.结果 1230株菌株中,1149株经PFGE预测的血清型与实际血清型一致,PFGE预测血清型的准确率为93.4％.5种血清型经PFGE预测的血清型阳性预测值多在90.0％以上、阴性预测值均在95.0％以上.结论 PFGE聚类对5种常见血清型沙门菌血清分型具有较好的提示及验证作用.
- 娄静刁保卫李杰闫梅英章丽娟阚飙
- 关键词：沙门菌脉冲场凝胶电泳血清型
