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肖文佳: 作品数：45 被引量：444H指数：13; 供职机构：上海市疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：中美新发和再发传染病合作项目上海市公共卫生重点学科建设项目国家科技重大专项更多>>; 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>

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生化和酶反应试验筛检4种肠道病原菌的试剂盒和筛选方法: 本发明涉及病原菌的筛选方法，特别涉及利用生化和酶反应试验筛检4种肠道病原菌的试剂盒和筛选方法。主要解决现有筛选方法存在的覆盖面不广、步骤较为复杂，筛选结果不够直观的技术问题。本发明提供了筛检4种肠道病原菌的试剂盒：1)、...; 许学斌金汇明肖文佳顾宝柯

上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型研究被引量：16: 2010年; [目的]研究上海市2006—2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002—2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006—2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P<0.05)。PFGE将7株食品株和44株腹泻株分为23种带型,优势型为1型(8株)、2型(6株)、29型(4株)、49型(8株)和6型(4株),与食源菌株完全匹配的仅有49型、6型共7个病例(15.9%,7/44)。PFGE-1型腹泻株在2006和2007年分别为2例和6例,2型分别为4例和2例。[结论]上海市鼠伤寒沙门菌腹泻病例存在高度散发和分散爆发的流行特征,没有与本地食品菌株相匹配的优势克隆型分别是PFGE 2型和1型,与市售生鲜类肉食品污染株之间的遗传同源性低。推测传染源可能由输入性传染源对食品等媒介形成二次污染所致。建议加强流行病学调查,以揭示潜在的传染源和传播途径。; 许学斌金汇明肖文佳陈敏冉陆刁保卫崔志刚阚飚; 关键词：鼠伤寒沙门菌多重耐药脉冲凝胶电泳分子分型传染源

上海市沙门菌病流行特征分析被引量：56: 2008年; [目的]了解上海市沙门菌病发病特征、菌型分布、抗生素耐药情况及初步估计相关的疾病负担。[方法]在上海市4个区的监测点医院采集监测病例的粪便标本进行沙门菌培养，菌株的血清分型及耐药监测，并对病人开展流行病学调查及沙门菌疾病负担估算。[结果]腹泻病人沙门菌阳性率3．13％，监测病例沙门菌阳性率高于非监测病例（X^2=68．212，P〈0．001）；流行季节在7．10月份；73．47％的病例发病前一周有可疑不洁饮食史；本市主要的沙门菌血清型为肠炎、山夫登堡、鼠伤寒和阿伯丁及德比。分离到的沙门菌存在不同程度的耐一种或多种抗生素现象；估计本市每年发生沙门菌病约13561例。[结论]监测结果提示上海市沙门菌病发病水平较高，应加强监测；防制措施上应重视食品安全、健康教育。; 顾宝柯袁政安金汇明许学斌林亚萍陈敏肖文佳; 关键词：沙门菌流行病学监测疾病负担

疾病预防控制数据标准体系研究与成果应用: 吴凡袁政安夏天夏寒付晨张诚施燕朱韫捷蔡任之刘捷宸张敬谊沈鑫肖文佳; 该项目属于预防医学与卫生学/卫生工程学领域。随着医改深入开展，互联互通、信息共享成为医改各项工作能否有效推进的关键。疾病预防控制数据标准的缺失和不统一，造成不同机构不同条线各自为政，数据采集极不规范，极大制约疾控信息互...; 关键词：; 关键词：疾病预防控制卫生工程学

上海2013—2015年感染性腹泻病原流行病学特征分析被引量：31: 2017年; 目的了解2013—2015年上海市感染性腹泻病例的病原流行病学特征。方法于2013年7月至2015年6月，采用多阶段随机抽样方法，以上海22所医院为成年人腹泻监测点，3所区中心医院以及1所市儿童医院作为儿童腹泻监测点医院，共抽取6 267例研究对象。收集人口学特征、主要症状与体征等信息，并采集粪便标本进行细菌培养和病毒核酸检测。比较不同季节细菌与病毒阳性率的差异，以及不同性别和不同年龄组相关细菌和病毒的构成差异。结果 6 267例病例中，男性3 262例（52.05%）；50~69岁（1 999例，31.90%）、30~49岁组（1 691例，26.98%）为主；检出病原体阳性者2 783例，阳性率为44.41%，检出细菌7种、病毒5种。细菌阳性率为12.61%（790例），主要为副溶血性弧菌（256例）、致泻性大肠埃希菌（239例）、沙门菌（209例）；病毒阳性率为31.80%（1 993例），主要为诺如病毒（1 172例）、轮状病毒（546例）。2013、2014年冬季病毒阳性率分别为57.89%（429例）和62.14%（522例），分别高于同期细菌2.43%（18例）和2.86%（24例）的阳性率；2013—2015年夏季细菌阳性率依次为14.56%（97例）、25. 29%（258例）和21.21%（49例），分别高于同期病毒7.51%（50例）、8.43%（86例）和11.69%（27例）的阳性率，以上P值均〈0.05。50~69岁组病原体阳性率最高，为47.57%（951/1 999）；其次为30~49岁组，阳性率47.13%（797/1 691）；0~2岁组阳性率为35.74%（213/596）。结论上海地区感染性腹泻病原谱以副溶血性弧菌、致泻性大肠埃希菌、沙门菌、诺如病毒与轮状病毒为主，夏季与冬季季节性高峰较明显，应针对婴幼儿及老年人等重点人群在不同季节对病原体加强相应的监测与防控。; 黎健潘浩肖文佳宫霄欢庄源匡小舟吴寰宇袁政安; 关键词：腹泻流行病学研究病原谱

2018-2020年上海市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析被引量：10: 2021年; 目的对2018—2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑。方法采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便标本,并收集相关流行病学资料。采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒(包括诺如病毒和札如病毒)、星状病毒和肠道腺病毒进行检测和分子分型。结果共采集粪便标本805份(男性543份,女性262份),病毒检出率为47.33%,检出率最高的病毒为杯状病毒(31.18%),其次为A组轮状病毒(17.64%);杯状病毒中诺如病毒GⅡ型的占比最高(95.62%)。轮状病毒以G9P[8]为主要流行型别(占比90.85%)。诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.3[P12]为主要流行株(占比分别为32.08%和19.58%);但2020年以来,新兴亚型GⅡ.4[P16]和GⅡ.2[P16]检出率明显高于2018和2019年(χ^(2)=17.337,P<0.001;χ^(2)=11.044,P=0.001)。此外本地首次从1名4月龄患儿粪便中发现1株乐儿德轮状病毒疫苗株。结论杯状病毒检出率高于轮状病毒的趋势加剧,使杯状病毒(主要是诺如病毒)疫苗的研发和上市需求愈发迫切。研究首次揭示了住院儿童中诺如病毒GⅡ型的主要流行和新兴亚型,为多效价的诺如疫苗研发提供了参考依据。轮状病毒G9型别近年检出率升高,需要对轮状病毒型别变化保持警戒、追踪和深究。; 匡小舟肖文佳刘捷宸张曦滕峥潘浩; 关键词：住院病毒性腹泻 A组轮状病毒

上海市一起潜伏期病例传播的新型冠状病毒肺炎聚集性疫情调查被引量：9: 2020年; 目的对上海市一起由新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例在潜伏期传染的聚集性疫情开展流行病学调查,查明感染来源和病例传播链。方法按照新型冠状病毒感染的肺炎防控方案(第三版)要求,2020年1月采用现场流行病学调查方法,对5例病例开展个案调查,采集鼻咽拭子和痰液等标本,采用real time RT-PCR检测新型冠状病毒核酸,追踪排查密切接触者并采取隔离医学观察,调查病例间的流行病学联系,分析传播链等,并及时落实相关防控措施。结果病例一于2020年1月20日发病,有与COVID-19确诊病例共同环境的暴露史,2月1日确诊;病例二于1月22日发病,1月27日确诊;病例三于1月25日发病,1月30日确诊;病例四于1月20日发病,2月1日确诊;病例五于1月23日发病,1月31日确诊。5例病例中,除病例二死亡外,其余4例病例病情均得到有效控制。本起疫情中,排除其他的共同暴露因素后,1月19日病例一和病例二及病例三参加了6 h的聚会,病例一在潜伏期内可能造成病例二和病例三的感染,这是流行病学调查的关键节点。结论COVID-19病例在潜伏内可能具有传染性,这对后面的疫情防控工作带来一定的警示和借鉴作用。; 肖文佳高强金凯宫霄欢韩若冰姜晨彦蒋先进金必红方绮雯潘浩吴寰宇孙晓冬; 关键词：聚集性疫情潜伏期

上海世博会园区内肠道疾病的流行病学特征分析被引量：3: 2011年; [目的]了解中国2010年上海世博会（简称“上海世博会”）园区内肠道疾病发病的流行病学特征。[方法]利用“中国2010年上海世界博览会园区内就诊异常情况监测和报告系统”（简称“就诊监测报告系统”），对上海世博会召开期间世博园区内肠道疾病逐例登记并开展流行病学调查，结合同期的气象资料，分析世博园区内肠道疾病的发生率与最高气温变化的相关性。[结果]世博园区内肠道疾病发病高峰在7~8月份，就诊病例以青年为主，15～39岁年龄组占50．53％；散客发生肠道疾病达11630例，占就诊肠道病例总数的71．87％；游客肠道疾病的日平均发生率为20．14／10万；世博园区内每日肠道疾病发生率与最高气温具有相关性；入园前可能的不洁饮食史是肠道疾病发生的主要原因。[结论]上海世博会园区内肠道疾病发病特征与上海市历年肠道疾病发病特征相符；在大型活动保障中，组织者应加强对活动场所周边地区餐饮行业饮食卫生的管理与督导，预防肠道疾病的发生。; 肖文佳林庆能何懿冯玮董晨郭翔毛智盛顾宝柯袁政安; 关键词：上海世博会肠道疾病流行病学特征

上海市山夫登堡沙门菌流行特征和分子分型研究被引量：8: 2009年; 目的分析上海市2006—2007年山夫登堡沙门菌分离株的分子流行病学特征。方法追溯2002--2007年山夫登堡沙门菌食品分离株的来源；对2005--2007年从腹泻病例分离的山夫登堡沙门菌进行生化和hilA、invA基因表型鉴定、药敏试验、Riboprinter （RP）核糖体分型和脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析。结果2006年山夫登堡沙门菌列上海市非伤寒沙门菌监测确认病例第3位，2002--2005年的食品分离株主要源自猪和牛肉制品。所有腹泻病例分离株除四环素（75．6％）外对其他抗生素均有较高敏感性。经RP和PFGE分子分型将硫化氢和hilA、invA基因全部有和无的两组菌株分别归属两类在遗传学上相对独立的克隆族。34株腹泻病例分离株分为16种PFGE带型，以同源程度较高的4型（4株）、5型（1株）、6型（6株）、7型（1株）共12株菌和11型（3株）、17型（5株）、23型（5株）共13株菌等优势带型聚类成2个克隆族。结论2006年上海市山夫登堡沙门菌感染病例是经过一定时间积累演变，由2个不同表型PFGE克隆族菌株构成较为少见的多点暴发。2007年病例大幅减少和未监测到同一时期食品污染源的结果表明，菌株存在遗传克隆的不稳定性和传播途径的复杂性。; 许学斌袁政安金汇明肖文佳顾宝柯陈敏冉陆刁保卫崔志刚扈庆华阚飙; 关键词：山夫登堡沙门菌脉冲场凝胶电泳分子分型

控制传染病确保“世博”卫生安全: 2010年; 中国2010年上海世博会时跨春、夏、秋三季，时间长．气候变化大，正是各种病原微生物和病媒生物繁殖旺盛、活动频繁的季节，肠道、虫媒和呼吸道传染病高发。同时．展会期间人员、物资大流动，也极大地增加了市民感染登革热、疟疾等输入性传染病的风险。; 顾宝柯肖文佳; 关键词：呼吸道传染病卫生安全输入性传染病生物繁殖世博会登革热

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