赵勇 作品数:11 被引量:25 H指数:3 供职机构: 北京市计算中心 更多>> 发文基金: 国家重点实验室开放基金 国家自然科学基金 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 化学工程 更多>>
宏基因组的生物信息分析 被引量:5 2013年 基于高通量测序的宏基因组学研究是近年来的研究热点之一。宏基因组的生物信息分析正在逐渐完善成熟,各种分析软件和流程的开发与应用,极大地促进了宏基因组研究的发展,特别是在遗传与进化、基因发现、宏基因组和人类疾病的相关研究等方面取得了显著成果。本文旨在结合宏基因组学的研究内容和研究方向,对宏基因组的生物信息分析方法进行综述,探讨宏基因组的生物信息分析面临的机遇和挑战。 赵勇 黄劲松 宋新蕊 陈禹保 童贻刚关键词:宏基因组 生物信息学 高通量测序 一种β-内酰胺的抗菌用途 本发明公开了一种小分子化合物的抗菌用途,具体为一种β-内酰胺的抗菌用途。该小分子化合物是2-(1,3-dioxo-1H-benzo[de]isoquinolin-2(3H)-yl)-5H,13H-benzo[4,5]is... 赵勇 谢威 刘昕 童贻刚 刘清珺 宋新蕊 康怀兴 常莉 黄劲松文献传递 反向虚拟筛选平台的构建 反向虚拟筛选[1]是一种对给定药物或活性小分子通过计算方法找到其潜在作用靶标的技术。可用于化合物靶标识别与确证、药物毒副作用研究和药物新作用研究[2-4]。以生物医药云超算平台为基础,内部靶标数据库为关键,采用分子对接方... 张媛 李达 周雪松 郭榕 肖旭东 赵勇关键词:分子对接 宽叶阿魏酮作为β2-肾上腺素受体拮抗剂的应用 本发明涉及化合物的新用途,具体涉及宽叶阿魏酮作为β2-肾上腺素受体拮抗剂的应用。 赵勇 谢威 刘昕 陈洁 宋新蕊 常莉化合物VS1在制备抗非小细胞肺癌药物中的应用 本发明涉及已知化合物的新应用,具体涉及化合物VS1在制备抗非小细胞肺癌药物中的应用。经验证上述化合物对非小细胞肺癌细胞系具有明显抑制作用,可用于制备抗非小细胞肺癌药物。本发明以ERBB3为作用靶标,经过筛选得到对非小细胞... 郭榕 张媛 肖旭东 赵勇文献传递 化合物naphthoylenequinazolone的抗菌用途 本发明公开了一种小分子化合物的抗菌用途,具体为一种β-内酰胺的抗菌用途。该小分子化合物是naphthoylenequinazolone,化合物名:benzo[lmn]diquinazolino[2,1-b:1ˊ,2ˊ-j... 赵勇 谢威 刘昕 童贻刚 刘清珺 宋新蕊 康怀兴 常莉 吴一雷文献传递 Autodock Vina与Discovery Studio在虚拟筛选耐药蛋白抑制剂中的比较 被引量:17 2012年 随着大量与细菌耐药相关的基因的发现和其表达蛋白结构的成功测定,从已有的化合物中通过计算机模拟方法筛选对耐药蛋白靶点有作用的候选化合物,成为了药物发现的一个标准途径。虚拟筛选在耐药基因抑制剂的发现中可以提高效率、降低实验成本。本文介绍了Autodock Vina和Discovery Studio在基于分子对接法的虚拟筛选中的使用,并对比分析其对β-内酰胺酶活性位点的筛选结果。希望通过这种比较促进虚拟筛选在药物设计领域中的应用,提高耐药基因抑制剂的发现速度。 黄勇 陈晨 张志毅 童贻刚 赵勇关键词:分子对接 AUTODOCK VINA DISCOVERY STUDIO 抑制剂 反向虚拟筛选平台及应用 2015年 靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法 Auto Dock Vina和内部构建的疾病靶标数据库,采用分布式架构,构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证,最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶,验证了平台的实用性和准确性。 张媛 刘雨桐 李达 宋新蕊 周雪松 赵勇关键词:老药新用 毒副作用 AUTO DOCK VINA 计算机辅助药物筛选平台及应用 被引量:3 2014年 先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物,本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物,有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想,集成了Auto Dock Vina和多个小分子库,具有数据安全、计算与存储的负载均衡以及实时监控的特点。应用平台进行先导化合物筛选,在较短时间发现了有针对性的活性小分子化合物,命中率高,大大缩短先导化合物发现周期。该平台具有很好的实用性和良好的扩展性。 宋新蕊 李达 陈洁 赵勇关键词:AUTO DOCK VINA 化合物VS1在制备抗非小细胞肺癌药物中的应用 本发明涉及已知化合物的新应用,具体涉及化合物VS1在制备抗非小细胞肺癌药物中的应用。经验证上述化合物对非小细胞肺癌细胞系具有明显抑制作用,可用于制备抗非小细胞肺癌药物。本发明以ERBB3为作用靶标,经过筛选得到对非小细胞... 郭榕 张媛 肖旭东 赵勇文献传递