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陈晓林
作品数:
3
被引量:7
H指数:1
供职机构:
中国科学院数学与系统科学研究院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
理学
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合作作者
汪四水
苏州大学数学科学学院
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EM算法
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作者
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陈晓林
2篇
汪四水
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2010
2篇
2007
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基于Gibbs抽样和EM算法的生物保守序列motif识别
随着许多物种的基因测序工程的完成和生物技术的发展,人类拥有了大量的生物数据。本世纪一个具有挑战性的问题就是挖掘这些数据中的生物信息,其中发现生物序列中的保守片断是一个重要的问题。这些保守片断被称为motif。 ...
陈晓林
关键词:
MOTIF
GIBBS抽样
EM算法
文献传递
一类混合正态分布参数估计的EM算法和数据扩张
被引量:6
2007年
从解析的角度得到混合正态分布参数的ML估计是很困难的.通过引入"缺失数据",利用Little和Schluchter(1985)提出的处理分类和连续数据的方法,给出具有相同协方差阵的混合正态分布参数估计的EM算法和数据扩张算法.
陈晓林
汪四水
关键词:
混合正态分布
EM算法
变长度Motif识别中的Gibbs抽样算法(英文)
2010年
Motif识别是计算生物学中的重要问题.处理缺失数据的方法被大家广泛应用于生物序列中的Motif识别,例如EM算法,Gibbs抽样等等.现在识别Motif的方法都是首先假定Motif的长度是给的,但是,事实上Motif的长度是未知的,在这篇文章中,我们用Gibbs抽样算法在寻找Motif的位置的同时确定Motif的长度.
陈晓林
汪四水
关键词:
GIBBS抽样
MOTIF
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