陈月娥
- 作品数：8 被引量：38H指数：3
- 供职机构：石河子大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 绵羊和人主要组织相容性复合体DRB1基因外显子2多态性及生物信息学分析被引量：3
- 2014年
- 本试验旨在研究绵羊和人的主要组织相容性复合体(MHC)DRB1基因外显子2(exon2)单核苷酸多态性(SNPs)和单氨基酸多态性(SAPs),并进行生物信息学分析。运用生物基因组学数据库,利用生物信息学及比较基因组学方法对人与绵羊MHC-DRB1基因exon2序列多态性进行分析,采用生物信息学软件对绵羊MHC-DRB1的蛋白质结构及生物学功能进行预测和分析。结果显示,人主要组织相容性复合体(HLA)和绵羊主要组织相容性复合体(OLA)的DRB1exon2均存在丰富的SNPs位点和SAPs位点,单一多态位点和简约多态位点数不尽相同,二者相比仅有14个SNPs位点相同,其余位点均不同。序列分析结果表明,二者MHC-DRB1exon2序列具有高度相似性。进一步生物信息学分析结果显示序列变异引起的单氨基酸变化引发了蛋白质二级结构和三级结构的改变,可能因此会引起基因功能的异常,从而引发抗病性和疾病易感性的变异。
- 陈月娥李建华苟亚峰王文文朱军保高剑峰
- 关键词：单核苷酸多态性
- 新疆7个绵羊品种MHC区段微卫星遗传多样性的分析被引量：12
- 2014年
- 为分析新疆北疆地区主要绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系,利用SSR Hunter软件寻找5个微卫星标记,采用PCR扩增,1%琼脂糖凝胶电泳,对新疆7个品种绵羊群体遗传多样性进行了检测分析,统计了各群体的等位基因组成、平均有效等位基因数和平均基因纯合率,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度、多态信息含量和群体间的遗传距离。结果显示新疆7个绵羊群体共发现28个等位基因,实验证明在5个微卫星位点的平均多态信息含量为0.5569~0.7335,平均杂合度为0.6208~0.7437,有效等位基因数为2.7118~4.4203,均属于高度多态性位点。聚类分析和主成分分析结果与其起源、育成历史及地理分布基本一致。这5个位点作为与生产性能相关的遗传标记较为理想。
- 岳远瑞袁晓航周路陈月娥马润林高剑峰
- 关键词：绵羊微卫星多态信息含量
- 中国美利奴羊MHC-DRB1 exon2单倍型构建及与布鲁氏菌病易感性关联分析被引量：4
- 2014年
- 为研究中国美利奴羊MHC-DRB1基因exon2单倍型与布鲁氏菌易感性的关联性,本实验采用PCR直接测序法对40例布鲁氏菌血清检测阳性和阴性个体MHC-DRB1 exon2的单核苷酸多态性(SNPs)进行检测,而后运用SHEsis在线软件对筛选的SNPs构建单倍型并进行单倍型关联分析.结果显示,在270 bp的序列内共检测到41个SNPs,经Hardy-Weinberg平衡检测筛选出符合条件的SNPs有29个,连锁不平衡发现9个连锁不平衡域,而且每个block中的SNPs两两之间存在强连锁不平衡.单倍型分析显示,由于连锁不平衡存在,仅构建9种单倍型,其中只有Hap8和Hap9两种单倍型在病例-对照组中比较差异有统计学意义(P<0.05).
- 陈月娥李建华苟亚峰刘朋涛高剑峰
- 关键词：布鲁氏菌病单倍型易感性
- 响应曲面法优化产外切菊粉酶菌株G-60的发酵条件研究被引量：2
- 2013年
- 从新疆石河子盐碱地菊芋生长根际土壤中,分离筛选得到10株具有菊粉外切酶活力的菌株,复筛得到1株高产菊粉外切酶活力菌株,将其命名为G-60。在单因素实验的基础上,采用Plackett-Burman试验法对8个因素进行了显著因素的筛选,结果表明菊粉添加量、酵母膏含量和初始pH值对菊粉外切酶酶活影响极显著;通过最陡爬坡试验及Box-Behnken设计进一步优化,得到最佳发酵产酶条件为:菊粉添加量7.91%、培养基初始pH为6.61、酵母膏含量0.64%,在此条件下,外切酶活达到58.51U/mL,与优化前相比提高2.02倍。
- 苟亚峰马慧王丹周路陈月娥高剑峰
- 关键词：响应面法
- 中国美利奴羊MHC-DRB1基因exon2 SNPs及其与布鲁氏菌病易感性相关性被引量：15
- 2014年
- 通过PCR扩增126只布鲁氏菌阴性和67只布鲁氏菌阳性中国美利奴羊MHC-DRB1基因exon2,产物经SSCP电泳检测单核苷酸多态性(SNPs),而后对不同等位基因进行克隆测序,旨在确定该基因exon2多态位点,并对每个SNP位点的等位基因频率、基因型频率进行差异统计分析,从而分析其与布鲁氏菌病易感性的相关性。结果表明:在270 bp的序列内共检测到41个SNPs,其中109 C>T位点的等位基因在病例-对照样本中的分布存在显著差异(P<0.05)。由此表明,MHC-DRB1 exon2多态性与绵羊种布鲁氏菌病易感性显著相关。
- 陈月娥苟亚峰周路马慧王丹高剑峰
- 关键词：SNPS布鲁氏菌病易感性中国美利奴羊
- 菊粉乙醇发酵条件的响应面优化
- 2015年
- 采用响应面分析法对菊粉乙醇发酵条件进行优化,首先采用Plackett-Burman设计对影响菊粉乙醇发酵的7个因素进行筛选,获得影响最大的3个因素菊粉浓度、装液量和发酵时间.再利用响应面分析法对这3个因素进行优化,确定最佳发酵条件为菊粉浓度160.0g/L、装液量130mL、发酵时间84h,采用优化后的发酵条件进行发酵,乙醇浓度达到7.5%,取得了较好的优化效果.
- 苟亚峰陈月娥李建华王丹朱军宝高剑峰
- 关键词：乙醇发酵条件响应面分析法
- 绵羊基因组DNA甲基化与传染性胸膜肺炎的关联性分析
- 2013年
- 为了从自身的角度提高绵羊对传染性胸膜肺炎的抗感染能力,采用MSAP(甲基敏感扩增多态性)的方法对20只患病绵羊和20只正常绵羊基因组DNA甲基化与传染性胸膜肺炎关联性进行了分析。以绵羊在患传染性胸膜肺炎前后的全基因组DNA为研究对象,经过同裂酶HpaⅡ和MspⅠ对其进行双酶切,最后通过测序胶的聚丙烯凝胶电泳处理从16对MSAP选择性引物组合中挑选出4对引物的扩增结果,进行绵羊患病前后甲基化变化的评估。分析结果,传染性胸膜肺炎的患病与否,与绵羊的甲基化程度有一定的关联,通过统计学分析得出患病绵羊甲基化水平普遍高于非患病绵羊,同时甲基化多态性也随之升高。结果对研究动物疾病与动物自身表观遗传之间关联起到一定的参考意义,也为今后的研究提供了理论依据。
- 袁晓航高剑峰岳远瑞周路陈月娥苟亚峰
- 关键词：湖羊小尾寒羊DNA甲基化
- 中国美利奴羊MHC-DRB1 exon2单倍型构建及与布鲁氏菌病易感性关联性
- 目的：
本研究通过对中国美利奴羊MHC-DRB1exon2基因多态性进行研究，并构建其单倍型，探讨该基因SNPs与布鲁氏菌病易感性相关性，初步筛选与布鲁氏菌病易感性相关的单倍型。此研究的目的在于借鉴人类在疾病与HL...
- 陈月娥
- 关键词：布鲁氏菌病单核苷酸多态性单倍型易感性
- 文献传递
