霍金龙
- 作品数：234 被引量：505H指数：12
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金云南省应用基础研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 基于转录组测序分析SPACA1在版纳微型猪近交系睾丸中的表达及转录调控特征
- 2023年
- 旨在分析版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)SPACA1基因的序列特征、生物学功能及在睾丸中的表达调控模式。选取4头成年BMI公猪的睾丸进行全转录组测序,获得SPACA1基因在睾丸中的表达丰度。采用RT-PCR技术克隆SPACA1的完整编码序列,分析SPACA1的序列、染色体定位、分子特征及相应蛋白的结构和功能。对SPACA1的相互作用蛋白进行GO、KEGG功能富集,并将获得的蛋白与转录组测序所获得的基因表达量进行关联分析。利用转录组测序数据构建SPACA1 mRNA与miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络。SPACA1基因CDS区全长为888 bp(Genbank登录号:OK042308),具有2个跨膜螺旋结构,与SPACA3、SPACA4、HIPK4和CCDC62显著相关;SPACA1及其互作蛋白主要参与精子细胞发育、分化,精子活力、顶体反应和精子鞭毛形成等通路;SPACA1基因受6个miRNAs靶向调控。本研究报道了SPACA1的表达、分子结构、蛋白质功能、在睾丸中的和转录调控作用,为深入研究SPACA1基因在BMI受精以及顶体反应等重要生物学过程中的功能奠定基础。
- 刘志朋张霞代红梅杨福华廖隽锐许静霍金龙
- 植酸酶替代产蛋鸡饲料中的磷酸氢钙的应用试验被引量：1
- 2009年
- 利用植酸酶可以水解植物性饲料中植酸的原理,探讨在产蛋鸡饲料中添加商品植酸酶替代不同水平磷酸氢钙的效果。选用50～54周海兰褐产蛋鸡为试验对象,在每千克饲料中添加400FYT植酸酶分别替代8g、16g的磷酸氢钙,观测植酸酶对产蛋鸡生产性能的影响。结果显示,用400FYT植酸酶替代16g磷酸氢钙可以保持产蛋鸡生产性能不变,而替代8g磷酸氢钙可以提高产蛋鸡的生产性能,只日产量、产蛋率、料蛋比分别提高3.4%、3.6%、3.7%。因此,在产蛋鸡饲料中用400FYT植酸酶替代8g磷酸氢钙可以提高产蛋鸡生产性能,同时也可以降低饲料配方中的总磷。
- 姚忠会查星琴潘伟荣霍金龙
- 关键词：植酸酶产蛋鸡
- miRNA-373在乳腺癌中的表达及其临床意义被引量：6
- 2016年
- 目的探讨miRNA-373在乳腺癌组织、乳腺纤维腺瘤组织及正常乳腺组织中的表达差异,分析其表达水平与患者临床病理特征的相关性及意义。方法选取2014年4-9月该院手术收集的乳腺癌组织、正常乳腺组织及乳腺纤维腺瘤组织标本各20例。Trizol法分别提取总RNA,特异性茎环法逆转录为cDNA。并运用实时荧光定量PCR法检测miRNA-373在上述3种组织中的表达情况,并进行临床病理特征的相关性分析。结果 miRNA-373在乳腺癌中的表达量(2.68±2.49)明显高于乳腺纤维腺瘤组织(1.11±0.93)和正常乳腺组织(1.07±0.80),差异有统计学意义(P<0.05);乳腺纤维腺瘤与正常乳腺组织比较,差异无统计学意义(P>0.05)。乳腺癌组织中miRNA-373的高表达与患者肿块大小、腋窝淋巴结转移相关(P<0.05),而与患者年龄、TNM分期无关(P>0.05)。结论 miRNA-373在乳腺癌中表达上调,miRNA-373表达与乳腺癌患者肿块大小、腋窝淋巴结转移有关,可能发挥类似促癌基因的作用。miRNA-373可作为乳腺癌诊断、治疗方案及预后判断的生物学标记。
- 陈梦婷赵洪远杨伟明霍金龙苏晓玥刘勤任宇
- 关键词：乳腺癌荧光定量PCR
- 一种死亡猪只检测系统
- 本实用新型公开了一种死亡猪只检测系统，属于养殖领域，所述的死亡猪只检测系统包括体温探测器、震动传感器、传感器数据传输模块、控制模块、报警系统、无线通信模块、用户终端，所述的体温探测器安装于猪圈正上方，震动传感器安装于每个...
- 王配霍金龙潘伟荣王淑燕张霞王丽娜刘志朋
- 文献传递
- 槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析被引量：14
- 2007年
- 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值,以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况,研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析,从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增,结果15条引物共产生105种扩增片段,多态片段95条,平均每条引物的扩增带数为7,各引物多态性片段范围在2-12之间,多态频率在40%-100%之间,多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。
- 李大林霍金龙霍海龙苗永旺屈在久尹玉安
- 关键词：槟榔江水牛随机扩增多态DNA
- 牛科物种FSHβ基因外显子3编码区遗传多态性及其生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 促卵泡素是动物垂体前叶分泌的重要繁殖调控激素。采用PCR产物直接测序法对河流型和沼泽型水牛、牦牛和大额牛的FSHβ基因外显子3编码区进行群体变异检测,并进行了生物信息学分析。牛科物种FSHβ基因外显子3编码区均为231 bp。在水牛中共发现16个SNP位点,其中异义替换13个,推测4个异义替换对FSH功能有显著影响(subPSEC<-3)。沼泽型水牛中发现的SNP位点均与河流型水牛共享,但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同。在普通牛、牦牛和大额牛中分别确定8,3,1个SNP位点,但只有SNP307是异义替换,普通牛与牦牛共享该位点,推测其对FSH功能无显著影响(subPSEC>-3)。在山羊中有11个SNP位点,8个为异义替换,推测只有SNP253对FSH功能有显著影响(subPSEC<-3)。在绵羊中有3个SNP位点,皆为同义替换。确定水牛特有的核苷酸位点4个,山羊特有的位点1个,普通牛、牦牛和大额牛共有的核苷酸位点4个,山羊和绵羊中共有的位点2个,这些位点编码氨基酸的差异可能引起了不同类型牛科物种间FSHβ亚基功能上的差异性。
- 杨秋丽哈福李大林袁跃云袁峰霍金龙苗永旺
- 关键词：生物信息学分析
- 猪GSKIP基因ceRNA调控网络及其蛋白互作分析
- 2022年
- 利用RT-PCR技术从版纳微型猪近交系睾丸组织中扩增出GSKIP全长编码序列并分析其分子特征,对GSKIP基因进行功能注释,分析其与非编码RNA(miRNA和lnRNA)间的调控关系,并构建ceRNA转录调控网络,进一步分析GSKIP蛋白的基本功能,构建多物种进化树和相互作用蛋白网络.通过RT-PCR获得了BMI GSKIP CDS区全长420 bp,该基因含4个外显子;基因功能分析表明,GSKIP主要参与Wnt信号通路;基因靶向作用分析表明,猪GSKIP受ssc-miR-181c、ssc-miR-181b、ssc-miR-181a、ssc-miR-335和miR-644-5p等5个miRNA的靶向调控;蛋白质结构分析表明,GSKIP包含1个DUF727结构域,α螺旋在二级结构中占比最高;多物种进化分析表明,BMI GSKIP氨基酸序列在哺乳动物中较为保守,与绵羊和牛的亲缘关系最为接近;蛋白互作网络分析表明,BMI GSKIP与10个蛋白存在相互作用.
- 代红梅刘志朋张霞杨忠曾日彬王配常勇诚霍金龙
- 关键词：功能注释调控网络
- PACS法在鸡基因差异表达中的应用被引量：1
- 2005年
- 利用PACS(preferential amplification of cod ing sequence)法鉴别鸡中的差异表达基因。结果表明,该方法具有操作简单、假阳性率低、能选择性扩增mRNA编码区等优点,可作为禽类基因差异表达研究中的首选方法。
- 伍革民柳小春娄义洲霍金龙
- 关键词：PACS基因差异表达
- 云南鹅群体遗传结构的随机扩增多态DNA分析被引量：2
- 2007年
- 采用随机扩增多态性DNA标记技术对云南鹅主产区6个不同地点的45个个体进行了群体遗传学分析,从85个随机引物中筛选出的23个引物对所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增,共检测出178条DNA片段,其中150条属多态性片段(多态率84.27%),计算了各座位在群体中的基因频率、杂合度和群体Shannon多样性指数等参数。结果表明:云南鹅的群体遗传变异较丰富。
- 王磊霍金龙苗永旺
- 关键词：RAPD杂合度SHANNON多样性指数
- 猪新基因PFN3电子克隆、RT-PCR验证和组织表达分析被引量：1
- 2014年
- 通过NCBI下载猪近缘物种的PFN3基因序列,在线BLAST比对获得猪EST序列,利用Lasergene软件电子克隆猪PFN3基因编码区序列及部分侧翼序列。针对编码区设计特异引物并以滇南小耳猪为研究材料进行实验验证,同时应用半定量RT-PCR技术对30个组织进行了表达分析。研究获得了猪PFN3 414 bp的编码区序列(GenBank登录号:JX457348,对应的氨基酸登录号:AFU74013)。生物信息学分析表明,该基因编码137个氨基酸,预测的蛋白质分子量(Mw)为14.73 ku,等电点(pI)为9.30。蛋白质结构分析显示,PFN3存在1个保守域,无信号肽;疏水性分析表明其N端和C端均具有亲水性;亚细胞定位显示,该蛋白位于细胞质的概率是94.1%。系统进化分析表明,猪与牛亲缘关系最近。组织表达分析表明,PFN3基因在30个被检组织中均有表达,在睾丸、肝、肾、结肠、盲肠、直肠及食管中高表达,在胸腺、甲状腺、附睾、淋巴结、十二指肠、空肠、回肠、胃、皮肤、大脑、小脑、垂体及下丘脑中中度表达,在颌下腺、肺、心、脾、肾上腺、肌肉、胰脏、脑干、舌下腺及脊髓中低表达。研究结果将为该基因在猪中的进一步功能研究奠定基础。
- 张永云赵跃王锐秦彩艳王配王淑燕李福泉刘丽仙霍海龙李卫真卢健霍金龙
- 关键词：电子克隆
