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韩晨
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中国科学院化学研究所
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合作作者
王建平
中国科学院化学研究所
石纪培
中国科学院化学研究所
赵娟
中国科学院化学研究所
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韩晨
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基于分子力学的β-肽酰胺-Ⅰ带振动
利用超快红外光谱实验、量化计算以及分子动力学模拟研究了氮乙基丙酰胺(NEP)的动态结构.建立了基于分子力学的静电频率转换模型(MM-MAP),研究了NEP溶液相中酰胺-Ⅰ带的光谱.利用此MM-MAP预测了一个β-七肽分子...
赵娟
石纪培
韩晨
王建平
关键词:
FTIR
文献传递
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含有非天然氨基酸的三肽分子构象的酰胺-I带研究
研究了非天然氨基酸Pra分子中C=O基团在不同溶剂环境中的红外吸收峰变化。利用红外光谱实验、量子化学计算及分子动力学模拟等手段研究了一种含Pra的三肽分子(Ac-Pra-Pra-NH
韩晨
王建平
关键词:
非天然氨基酸
红外光谱
分子动力学模拟
文献传递
非天然氨基酸H-Pra-OH的非谐性振动和溶剂化影响
韩晨
王建平
基于分子力学的β-肽酰胺-Ⅰ带振动
利用超快红外光谱实验、量化计算以及分子动力学模拟研究了氮乙基丙酰胺(NEP)的动态结构。建立了基于分子力学的静电频率转换模型(MM-map),研究了NEP溶液相中酰胺-Ⅰ带的光谱。利用此MM-map预测了一个β-七肽分子...
赵娟
石纪培
韩晨
王建平
关键词:
分子动力学模拟
FTIR
文献传递
多然和蛋白质酰胺-Ⅰ带振动频率图的温度依赖性
2011年
利用高温分子动力学模拟和红外光谱实验手段,研究了一个基于分子力学力场的酰胺-Ⅰ带振动频率图的温度依赖性.结果表明,基于298K所建立的频率图可以应用,上至500K的分子动力学轨迹,所模拟的红外光谱能够很好地重复88℃时的实验光谱.另外还模拟了两个含有天然和非天然氨基酸残基的三肽分子的红外光谱,与实验结果相比得到了较好的符合.结果表明,所建立的频率图能够用于获得多肽体系在不同温度下的酰胺-Ⅰ带局域模振动频率及其分布,有助于深入认识多肽的热去折叠物种的红外光谱特征.
韩晨
王建平
关键词:
红外光谱
分子动力学模拟
非天然氨基酸与生物水相互作用的从头算分子动力学模拟
<正>生物分子周围的第一层溶剂水,通常被称为"生物水"分子。生物分子与生物水之间的动态相互作用,对生物分子的结构与功能至关重要。从头算分子动力学(ab initio molecular dynamics)是将第一性原理与...
韩晨
王建平
关键词:
非天然氨基酸
文献传递
含有非天然氨基酸的三肽分子构象的酰胺-Ⅰ带研究
研究了非天然氨基酸Pra分子中C-O基团在不同溶剂环境中的红外吸收峰变化。利用红外光谱实验、量子化学计算及分子动力学模拟等手段研究了一种含Pra的三肽分子(Ac-Pra-Pra-NH2)的动态结构信息,利用MM-Map方...
韩晨
王建平
关键词:
非天然氨基酸
红外光谱
分子动力学模拟
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