何守朴
- 作品数：116 被引量：381H指数：10
- 供职机构：中国农业科学院棉花研究所更多>>
- 发文基金：“十一五”国家科技支撑计划国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学轻工技术与工程生物学医药卫生更多>>
- 一种亚洲棉原生质体的分离与外源基因转化的方法
- 本发明公开了一种亚洲棉原生质体分离与外源基因转化的方法。该方法包括亚洲棉种子萌发、酶解分离原生质体、离心收集原生质体、培养、外源基因转化及显微观察鉴定等步骤。本发明黑暗环境中生长的叶片所分离的原生质体浓度符合实验需求且完...
- 杜雄明王丽媛王晓阳傅国勇何守朴潘兆娥陈保军贾银华耿晓丽王立如庞保印李洪戈
- 文献传递
- 与亚洲棉DPL972光籽性状紧密连锁的分子标记及应用
- 本发明公开了一种与亚洲棉DPL972光籽性状紧密连锁的分子标记及应用，该分子标记位于6号染色体A08上，该分子标记正向引物序列如SEQ ID No.1所示，反向引物序列如SEQ ID No.2所示。本发明找到了鉴定亚洲棉...
- 杜雄明王晓阳潘兆娥何守朴龚文芳贾银华王立如耿晓丽庞保印
- 文献传递
- 与棕色棉纤维色泽主效QTL连锁的分子标记及其应用
- 本发明涉及一种与棕色棉长绒和短绒纤维色泽主效QTL连锁的分子标记，其为用SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的引物扩增出的238bp和500bp的扩增片段。该分子标记可应用于棕色棉花品种纤维色泽早期选择或品...
- 杜雄明冯鸿杰孙杰孙君灵何守朴潘兆娥贾银华周忠丽
- 陆地棉繁殖群体大小对遗传完整性的影响被引量：5
- 2014年
- 利用形态标记和SSR分子标记技术分析了澳L23/757(鸡脚叶)、中棉所19(正常叶)、红桃(红叶)的25、50、100、150株不同自然授粉繁殖群体的遗传完整性。结果表明,3个种质间的形态标记的天然异交率和SSR标记遗传纯度有显著差异,但4个群体大小间的天然异交率和SSR标记遗传纯度的差异均不显著。说明棉花繁殖群体为25株时,可作为棉花种质繁殖更新过程中的最低繁殖群体量,能较好地保持繁殖种质的遗传完整性。
- 计怀春孙君灵周忠丽潘兆娥贾银华何守朴庞保印王立如杜雄明
- 关键词：棉花SSR标记
- 中棉所48的SSR数字指纹图谱的构建被引量：29
- 2010年
- 利用25对核心引物对中棉所48及其亲本进行多态性检测,共有16对引物在2个亲本间具有多态性,其中,有14对引物在两亲本间扩增出大小不同的带,且这些标记位点在F1中均表现为杂合带,为共显性标记;另外2个引物的F1带型与母本或父本一致,为显性标记。以这25对引物在不同材料间扩增得到的01(二进制)数据转换成十进制数据,构建了中棉所48的数字指纹图谱,为杂交种的真伪鉴定和纯度检测提供了方法。为了构建准确、稳定和实用的棉花DNA指纹图谱,指出了需要规范分子标记类型和数量,DNA、Taq酶等试剂数量和质量,统一PCR反应,电泳和染色条件,统一提供标准品种和标准DNA,标准化电泳条带的识别、数据处理方式和编码方式。
- 潘兆娥王希文孙君灵周忠丽贾银华何守朴王杰王立如庞保印杜雄明
- 关键词：中棉所48SSR
- 亚洲棉短纤维发育相关长链非编码RNA的鉴定及表达
- 2023年
- 【目的】长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类无蛋白质编码能力,但参与许多重要生命活动调控过程的长度大于200 nt的RNA。通过对亚洲棉无短纤维突变体(GA0149)和野生型(GA0146)纤维发育早期的转录组数据进行分析,挖掘调控短纤维发育的lncRNA,并明确其调控网络,为进一步解析棉花纤维发育机制奠定基础。【方法】选择GA0146和GA01492个材料在开花后当天(0 DPA)及花后3 d(3 DPA)、5 d(5 DPA)和8 d(8 DPA)的胚珠和纤维为材料进行转录组测序。鉴定lncRNA并预测其调控的靶基因;通过mRNA和lncRNA的差异表达分析,比较2个材料在不同纤维发育时期的差异。进一步利用KOBAS软件预测对差异lncRNA的靶基因进行富集分析并预测其参与的生物过程;最后通过实时荧光定量(RT-qPCR)技术对25个差异表达的lncRNA转录组数据进行验证。【结果】共鉴定获得15339个lncRNA,其中11595个lncRNA位于基因间区,包括2428个反义lncRNA、350个内含子lncRNA及966个正义lncRNA。共有1932个差异表达lncRNA(DE-lncRNA),它们所对应的8134个靶基因中,有788个为差异表达基因(DE-mRNA)。KEGG代谢通路富集分析表明,DE-mRNA主要参与植物激素信号转导(plant hormone signal transduction)和内质网中蛋白质加工过程(protein processing in endoplasmic reticulum)。共表达调控网络分析显示,表达量差异比较显著的lncRNA(MSTRG.454250.3)和其所调控的靶基因表达趋势一致,仅在野生型(GA0146)短纤维发育早期胚珠中特异表达;而lncRNA(MSTRG.454261.4)与其调控的靶基因表达趋势相反,在突变体(GA0149)中的表达量显著高于野生型。RT-qPCR结果证实了转录组数据的真实性。【结论】鉴定了26个与亚洲棉短纤维发育相关的lncRNA,其通过调控植物激素信号转导途径相关的吲哚乙酸合成酶基因(Ga03G2421)和生长素响应蛋白基因(Ga05G1344)的表达而影响短纤维的发育。
- 王晓阳彭振邢爱双赵盈睿马欣丽刘方刘方刘方
- 关键词：亚洲棉长链非编码RNA调控网络荧光定量PCR
- 与亚洲棉短绒性状关联SVs（larINDEL<Sub>FZ</Sub>）位点与GWAS分析方法及应用
- 本发明属于分子生物学技术领域，尤其涉及一种与亚洲棉短绒性状关联SVs（larINDEL<Sub>FZ</Sub>）位点与GWAS分析方法及应用，所述larINDEL<Sub>FZ</Sub>位点的位置为‑logP=33....
- 杜雄明王晓阳何守朴潘兆娥龚文芳贾银华耿晓丽王立如庞保印王丽媛付国勇裴欣欣陈保军李红戈
- 文献传递
- 陆地棉盐胁迫应答基因GhPEAMT1的克隆及功能分析被引量：3
- 2021年
- 【目的】磷酸乙醇胺N-甲基转移酶(phosphoethanolamine N-methyltransferse,PEAMT)是植物磷酸胆碱合成的关键酶,而磷酸胆碱是可以增强植物抗性的甘氨酸甜菜碱合成底物胆碱的前体。通过对陆地棉磷酸乙醇胺N-甲基转移酶基因(GhPEAMT1)的克隆、表达模式分析,以及功能验证,探究GhPEAMT1在陆地棉响应盐胁迫中的生物学功能,为棉花耐盐品种的选育提供基因资源。【方法】根据转录组测序数据分析,最终确定GhPEAMT1为耐盐候选基因;通过聚合酶链式反应(PCR)扩增目的基因;通过生物信息学分析基因结构特征、预测蛋白质相对分子质量以及进化关系;利用荧光定量PCR(qRT-PCR)分析耐盐棉花品种早熟长绒7号和感盐棉花品种南丹巴地大花在NaCl胁迫后不同时间点不同组织的表达特征;构建亚细胞定位载体,进行烟草的瞬时转化,确定蛋白质在细胞中的位置;构建基因超表达载体,通过花序浸染法转化拟南芥,分析转基因拟南芥种子在盐胁迫下的萌发率和转基因拟南芥主根长度;利用病毒诱导基因沉默技术(virus induced gene silencing,VIGS)对早熟长绒7号棉花品种进行目的基因沉默,提取棉花叶片的RNA进行实时荧光定量用以检测基因沉默效率,随后用40 g·L^-1的NaCl溶液的处理对照棉花植株(CK)、注射TRV2:00的棉花植株、GhPEAMT1A和Gh PEAMT1D沉默成功的棉花植株,测定棉花叶片过氧化氢酶(catalase,CAT)、谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)的活性。【结果】克隆获得GhPEAMT1的2个同源基因GhPEAMT1A和GhPEAMT1D,2个基因的CDS全长分别为1488和1485 bp;构建进化树发现,GhPEAMT1与海岛棉同源基因的亲缘关系最近,而与其他物种相比,与可可同源性最高;盐胁迫条件下,GhPEAMT1A和GhPEAMT1D在耐盐品种早熟长绒7号叶片和根中的表达量显著高于感盐品种南丹巴地大花。亚细胞定位显示该基因位于细胞质中;超表达转基因拟南芥后,�
- 王娜赵资博高琼何守朴马晨辉彭振杜雄明
- 关键词：陆地棉盐胁迫基因克隆基因沉默
- 一种棉花种质耐盐性的高效鉴定方法
- 本发明提供了一种棉花种质耐盐性的高效鉴定方法，利用花钵土培育苗法将棉花幼苗培养至三叶一心期，选长势正常一致的材料分别进行盐胁迫处理和同体积的清水处理，选择第二片真叶分别测定不同处理的PSII最大光化学效率，计算相对值，带...
- 何守朴彭振杜雄明孙君灵贾银华潘兆娥王立如庞保印
- 文献传递
- SSR标记与棉花产量性状杂种优势的相关性分析被引量：1
- 2016年
- 在陆地棉杂交组合中,铃数和铃质量优势对产量杂种优势起着重要的贡献作用。利用2个衣分差异较大的材料M23(衣分高)和838(衣分低)与其他8个材料杂交,获得两类共16个F1群体,对材料(亲本及F1)的产量相关性状、杂种优势和SSR分子标记聚类及相关性进行了研究。结果表明,以M23作父本的F1群体籽棉产量均值明显高于以838作父本的F1群体,进一步对2个群体的中亲优势和超亲优势分析发现,籽棉产量的增长贡献可能来源于铃质量表现出的杂种优势;利用SSR分子标记技术可以很好地将F1群体和亲本材料区分开来,同时通过分析材料之间相似系数和杂种优势之间的相关性发现,材料之间相似系数越大,衣分和铃数的杂种优势越小,但铃质量的杂种优势越大。研究可为棉花杂种优势利用选择亲本提供理论基础。
- 孙亚莉何守朴陈琼玲郑晓楠杜雄明
- 关键词：棉花杂种优势SSR标记
