刘亚静
- 作品数:13 被引量:94H指数:4
- 供职机构:北京林业大学更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项引进国际先进农业科技计划转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 植物HAP3转录因子研究进展被引量:3
- 2011年
- HAP(NF-Y或CBF)是一类重要的转录因子,可以与CCAAT框结合并控制基因的表达,广泛分布于酵母、哺乳动物及植物细胞中。在哺乳动物和植物细胞中,HAP复合体包括3个不同的亚基:HAP2/NF-YA/CBF-B、HAP3/NF-YB/CBF-A及HAP5/NF-YC/CBF-C。HAP3转录因子在植物胚胎发育、叶绿素生物合成、花期调控等方面有重要作用。介绍植物HAP3转录因子结构特点、生物学功能等方面的最新研究进展。
- 刘亚静张盾张凌云
- 关键词:转录因子叶绿素生物合成花期调控
- 青杄PsbO基因cDNA序列克隆及生物信息学分析被引量:1
- 2012年
- 利用RACE技术从已有的青杄均一化cDNA文库中克隆得到青杄(Picea wilsonii)PsbO基因cDNA的全长,并用生物信息学的方法对该cDNA的核苷酸序列、氨基酸序列的相似性,及编码蛋白PwPsbO的理化性质、亲水性/疏水性、二级和三级结构,PwPsbO基因进化树等进行了预测和分析.采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,测定了青杄不同组织中的PsbO基因的相对表达水平.结果发现:青杄PsbO基因编码346个氨基酸,预测相对分子质量为36.6 kD,理论pI值为5.29,属于可溶性蛋白.二级和三级结构预测表明其含有较多的α螺旋、β折叠和随机卷曲结构.RT-qPCR发现该基因在青杄针叶和茎中表达量最高.这些结果为青杄中PsbO基因的初步功能研究奠定了基础.
- 刘亚静李长江孙帆张凌云
- 关键词:RACE生物信息学
- 拟南芥转录因子NF-YC的原核表达及多克隆抗体制备被引量:7
- 2012年
- 采用PCR方法扩增NF-YC基因得到其全长cDNA序列,并将其克隆至原核表达载体pET-48b中,在大肠杆菌BL21中用IPTG诱导出分子量约为45 kD的融合蛋白,SDS-PAGE和Western blotting检测鉴定表达产物。利用亲和层析技术对融合蛋白进行纯化,纯化后的目的蛋白免疫新西兰兔制备多克隆抗体。间接ELISA检测抗体效价大于1 62 500,Western blotting结果显示,该抗体可特异性识别NF-YC蛋白。
- 卫静李长江刘亚静黄桂雪张凌云
- 关键词:拟南芥转录因子原核表达多克隆抗体
- 将乐国有林场杉木径向生长及其对气候的响应被引量:1
- 2024年
- 【目的】杉木是我国南方特有的用材树种,其具有良好的绿化效果,同时也具有较高的经济价值。本文主要对不同时间尺度上杉木径向生长动态及其与气候因子的关系展开研究,为科学经营研究区杉木提供参考依据。【方法】本研究利用径向生长测量仪对福建省将乐国有林场杉木进行了为期4年(2017年7月—2021年6月)的连续监测,对其径向生长量进行分析,确定生长季,同时进行偏相关分析及滑动相关分析探究温度、湿度、降水量等气候因子对杉木径向生长的影响。【结果】(1)杉木具有周期性的日径向改变,主要体现在3个阶段(第1个阶段是收缩、第2个阶段是恢复、第3个阶段是增长);杉木径向变化的季节动态经历了低谷期、上升期和稳定期;杉木的径向变化年际间存在差异,但径增长的时间序列和累积变化趋势基本是一致的。(2)拟合并分析杉木累积径向生长曲线可以确定福建将乐杉木的生长季为每年2—9月。(3)平均相对湿度、降水量、最低温度和平均温度是主要的影响因子,且杉木净增量与降水量具有显著正相关的关系,温度在适宜杉木径向生长的范围内越高越利于生长,但高于或低于这个范围均会起抑制作用;滑动相关分析结果表明随着生长季时间的变化,相关系数呈现先增加后减少的趋势。【结论】杉木径向生长与相对湿度、降水量、温度等气候因子有密切联系,因此研究杉木的径向变化特征和对气候因子的响应,为更好地规划目标树种的生存策略提供了重要的技术路径和参考模型。
- 孙雅楠刘亚静孙钊罗蜜张运根孙玉军
- 关键词:杉木径向生长生长季气候因子
- 青杄转录因子PwNF-YB3及其编码基因与应用
- 本发明公开了青杄转录因子PwNF-YB3及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白,是如下1)或2)的蛋白质:1)由序列表中序列2所示的氨基酸残基组成的蛋白质;2)将序列表中序列2的氨基酸序列残基序列经过一个或几个氨基酸残基的...
- 张凌云张通刘亚静张盾
- 文献传递
- 青杄中sPPa1的cDNA序列克隆及其生物信息学分析
- 2012年
- 以青杄(Picea wilsonii)均一化cDNA文库为模板,通过RACE方法克隆得到青杄PPa1基因cDNA全长,对该cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、二级结构、三级结构及是否跨膜进行了分析预测;进行了多序列比对并构建了系统树,同时对PPa1在青杄各组织中的表达量进行了检测。结果表明:青杄PPa1基因共由216个氨基酸组成,分子量为24.55 kD,理论PI为5.83,属可溶性蛋白;二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲和β-折叠构成;PPa1在青杄花粉中表达量最高。研究为进一步研究青杄PPa1的功能奠定了基础。
- 曹一博刘亚静张凌云
- 关键词:克隆RACE生物信息学
- 青杄NF-YB基因的克隆及逆境表达分析
- NF-YB(又称HAP3,CBF-A),是一类重要的转录因子,可以与CCAAT框结合并控制基因的表达。目前已发现其在胚胎发育、叶绿素生物合成、花期调控等方面发挥重要作用。本研究利用RACE技术从已有的青杄(Picea w...
- 刘亚静崔晓燕张凌云
- 关键词:RT-QPCR逆境胁迫
- 青杄转录因子PwNF-YB3及其编码基因与应用
- 本发明公开了青杄转录因子PwNF‑YB3及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白,是如下1)或2)的蛋白质:1)由序列表中序列2所示的氨基酸残基组成的蛋白质;2)将序列表中序列2的氨基酸序列残基序列经过一个或几个氨基酸残基的...
- 张凌云张通刘亚静张盾
- 文献传递
- 杉木径向生长及其对气候因子的响应
- 杉木是我国常见的造林树种,作为速生树种之一,具有较高的经济价值。目前对杉木的研究主要集中在树轮气候学,缺乏生理机制以及短时间尺度上的径向生长动态及其与气候因子关系的研究。本文利用带状树干径向测量仪于2017年7月-201...
- 刘亚静
- 关键词:杉木径向生长气候响应
- 青杄均一化cDNA文库构建及EST序列分析被引量:17
- 2012年
- 以青杄花粉和针叶为材料,将青杄全长cDNA与Gateway供体载体pDONR222重组,构建了其非剪切型全长cDNA原始文库,利用基因组DNA饱和杂交技术对原始cDNA文库进行均一化处理,构建青杄的均一化全长cDNA文库。文库的总库容量为1.1×106CFU/mL,平均插入片段长度大于1.0 kb,重组率大于95%。定量RT-PCR检测表明,青杄高丰度表达基因EF1-α在均一化cDNA文库中的表达量下降了约41倍。接着对文库中随机的5 144个克隆进行了测序,获得高质量的有效EST(expressedsequence tag)序列为5 144条,经拼接共获得单一基因(unigene)为2 717个,其中包括片段重叠群(contig)628个和单一EST序列(singlet)2 089个。NCBI同源比对分析表明,其中1 887个序列unigenes获得分子功能注释,这些EST涉及细胞生长、信号转导、转录、抗逆、能量代谢等功能。这些数据有助于对青杄的相关功能蛋白及分子机制开展进一步的研究。
- 张盾刘亚静李长江曹一博张凌云
- 关键词:CDNA文库EST序列分析