刘建
- 作品数：12 被引量：28H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所更多>>
- 发文基金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目公益性行业科研专项甘肃省科技重大专项计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 高分辨率熔解曲线分析法检测牦牛脂蛋白脂酶外显子7的多态性及与生长性状相关性分析被引量：2
- 2013年
- 脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)是一个分子质量为54kb的糖蛋白,其活性受营养因素、激素水平等调节,因牦牛生存环境的特殊性,试验拟从分子水平研究天峻县牦牛脂蛋白脂酶外显子7(LPL-Exon7)基因的多态性,并与生长发育性状进行关联分析,从而为牦牛营养调控、品种资源保护和遗传育种提供科学理论依据。试验采集青海省海西州天峻县牦牛抗凝血106份,提取血样DNA,并利用PCR技术和高分辨率熔解曲线分析法对候选基因LPL-Exon7进行多态性分析,并于采血的同时对牦牛体重、体斜长、体高、胸围和管围等生长性状指标进行了相关性和遗传效应分析。结果表明,高原牦牛LPL-Exon7基因在高原牦牛和野血牦牛中都表现为多态,存在3种基因型,即AA、AB和BB,由1对等位基因A和B控制,A等位基因均为优势等位基因。经χ2检验,符合哈迪—温伯格(Hardy-Weinberg)定律,处于平衡状态(P>0.05)。该位点在高原牦牛和野血牦牛群体中公、母牦牛的多态信息含量为0.3588和0.2103、0.3219和0.3343,高原牦牛母牛的多态信息含量PIC<0.25,处于低度多态,高原牦牛公牛和野血牦牛公、母牛的多态信息含量均在0.250.05)。因此,初步推断牦牛LPL-Exon7可以作为牦牛标记辅助选择的遗传标记之一。
- 扎西卓玛郭宪阎萍吴晓云王宏博刘建杨安圈张德虎王照忠王成林完马单智诺科加杨应川
- 关键词：高原牦牛高分辨率熔解曲线分析多态性
- 牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析
- 2012年
- 利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,无明显的信号肽,含有很多个磷酸化位点。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。HORMAD1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛HORMAD1与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1氨基酸遗传距离较近,具有高度相似性。
- 金帅齐社宁阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰褚敏丁学智刘文博吴晓云刘建
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- 天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 采用DNA混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10(Growth differentiation factor 10,GDF-10)基因编码区的多态性,应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质特性。结果表明,天祝白牦牛生长分化因子-10基因编码区序列存在8个突变位点,其中90C→G、124C→G、1005G→A和1232G→C为错义突变,导致了编码氨基酸的改变,132T→C、822A→G、873G→T和888T→C为同义突变;天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏水性区域和跨膜螺旋区;其存在信号肽,说明可能在细胞质中发挥生物学作用;天祝白牦牛生长分化因子-10编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主;氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4%,与人、小鼠、大鼠4个物种间同源性较高。
- 李天科梁春年郎侠裴杰吴晓云刘建秦文阎萍
- 关键词：天祝白牦牛多态性生物信息学分析
- 牛FTO基因功能结构生物信息学分析
- 引言FTO(fat mass and obesity associated)基因也称肥胖基因,是一种与肥胖相关的等位基因,Peters等在首次在小鼠中克隆出这个基因。近年来,随着对FTO基因的研究,多个单核苷酸多态性位点...
- 刘建阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏吴晓云焦斐
- 文献传递
- 牦牛VEGF-A基因的克隆及生物信息学分析被引量：5
- 2012年
- 利用分子克隆技术获得了牦牛VEGF-A基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛VEGF-A基因包含一个573 bp的开放阅读框,编码190个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,具有明显的信号肽。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。VEGF-A基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛VEGF-A与黄牛、绵羊和成都麻羊等物种的VEGF-A氨基酸遗传距离较近,具有高度同源性。
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰褚敏丁学智刘文博焦斐刘建
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- 牛FAS基因的生物信息学分析
- 对牛FAS基因进行生物信息学分析,以预测FAS基因编码产物的理化性质、结构与功能。结果表明,FAS基因编码产物为较稳定疏水性蛋白,不具有信号肽,为非分泌蛋白。二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主,主要在质膜中发挥生物学作...
- 焦斐阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏吴晓云刘建
- 关键词：FAS基因蛋白质结构生物信息学
- 文献传递
- 牦牛ATP6和Cytb基因的分子进化研究
- 线粒体基因组(Mitochondrial Genome)具有区别于核基因组的诸多特性,文章通过对牦牛线粒体基因组的ATP6和Cytb基因进行分子进化分析发现,ATP6和Cytb基因均受到纯化选择,且ATP6基因受到纯化选...
- 吴晓云阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏焦斐刘建
- 关键词：ATP6CYTB分子进化
- 文献传递
- 牦牛无角性状相关基因SNP标记筛选
- 本研究将以青海大通牦牛为研究对象，随机采集33份无角个体和32份有角个体血样。通过候选基因法，利用DNA测序和高分辨率溶解曲线SNP检测技术筛选与牦牛无角性状呈显著性关联的SNP标记。
- 刘建刘文博阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰王宏博褚敏
- 关键词：牦牛DNA测序
- 牦牛CART基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析
- 2013年
- 旨在克隆牦牛可卡因-苯丙胺调节转录肽基因(Cocaine-and amphetamine-regulated transcript,CART),获得基因全长序列并分析基因结构和相关遗传变异,检测单核苷酸多态性(SNP)位点在不同品种牦牛群体中的分布,通过生物信息学相关方法分析预测SNP位点对CART基因表达的影响,为牦牛CART基因功能研究奠定基础。以243头大通牦牛、208头天祝牦牛、208头甘南牦牛和53头帕里牦牛血样为材料,提取基因组DNA,克隆出牦牛CART基因全长序列;运用高分辨率熔解曲线分析技术(High-resolution melting,HRM)检测CART基因4个SNPs在4个牦牛品种中的分布,进行遗传统计分析,并应用生物信息学分析SNPs可能对基因功能产生的影响。本研究发现,牦牛CART基因4个SNPs,1个位于基因上游序列、1个位于内含子、2个位于3′-UTR。2检验表明,除大通牦牛V-221位点和甘南牦牛V1816位点外,其他所有群体各个位点都处于哈代-温伯格平衡(P>0.05)。群体遗传学分析显示,V168和V1816位点属于中度多态,V-221和V1791属于低度多态,单倍型C属于优势单倍型。生物信息分析发现,V1791和V1816位点碱基变化导致RNA二级结构发生变化,可能会对CART基因的表达产生影响。
- 刘建刘文博吴晓云阎萍梁春年
- 关键词：牦牛克隆多态性RNA二级结构
- 牦牛PRKAG3基因部分序列多态性分析被引量：2
- 2012年
- 采用PCR-SSCP技术,对甘南牦牛、大通牦牛和天祝白牦牛的PRKAG3基因第3、第9内含子的多态性进行检测。结果表明,牦牛PRKAG3基因在第3、第9内含子中均存在多态位点,2个位点分别存在AA、AB和EE、EF基因型。其中,A和E为优势等位基因,2个位点在3个牦牛群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态。独立性检验结果表明,在1 806 bp处天祝白牦牛与甘南牦牛之间差异显著(P<0.05),大通牦牛与甘南牦牛、天祝白牦牛之间差异不显著(P>0.05);在4 487 bp处大通牦牛和天祝白牦牛、甘南牦牛之间差异极显著(P<0.01),天祝白牦牛与甘南牦牛之间差异不显著(P>0.05)。
- 焦斐杨富民阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰丁学智褚敏刘文博吴晓云刘建
- 关键词：牦牛PRKAG3基因PCR-SSCP多态性
