庄青叶
- 作品数：44 被引量：149H指数：7
- 供职机构：中国动物卫生与流行病学中心更多>>
- 发文基金：国家科技基础性工作专项公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生化学工程更多>>
- 一种甲型流感病毒快速分型与分析流程
- 本发明属于生物技术领域，它确立了一种甲型流感病毒快速分型与分析流程，可以快速、准确对甲型流感病毒进行分型、分析和遗传进化研究，其包含3个技术要点：（1）筛选了适合进行甲型流感病毒分型的参考序列；（2）构建了甲型流感病毒分...
- 王楷宬王通陈继明庄青叶王素春彭程
- 文献传递
- 麻鸡源性粪肠球菌的分离及初步鉴定被引量：4
- 2011年
- 用常规方法对病死麻鸡进行了病原菌的分离、培养及初步鉴定,利用PCR方法对细菌基因组的16S rDNA基因进行了扩增,确定其病原菌为粪肠球菌。
- 李金平陈杰庄青叶
- 关键词：麻鸡粪肠球菌
- 美国近期暴发新城疫疫情流行特点分析被引量：1
- 2019年
- 2018年5月,美国加利福尼亚州在南部地区发病散养鸡中检测到新城疫病毒强毒株。这是美国自2003年以来,首次出现新城疫病毒强毒株感染的报道。该病传播速度快、致死率高。截至2019年5月24日,美国农业部已在加利福尼亚州、犹他州和亚利桑那州共确诊新城疫疫情425起,其中加利福尼亚州423起,犹他州、亚利桑那州各1起。病原学分析显示,此次流行的新城疫病毒属于基因Vb亚型。初步遗传分析表明,本次疫情暴发为单点传入并造成二次扩散,但病毒暴发的起源仍未确定。病例对照研究表明,禽群数量大小、观赏鸟、禽群中公鸡高占比、与野鸟接触等是病毒感染的风险因素。美国政府已采取包括限制移动易感动物、扑杀暴露动物、提升饲养场生物安全水平、避免家禽与野禽接触以及家禽与其他传染源接触、加强监测筛查和流行病学跟踪支持等等一系列举措来控制新城疫疫情的传播。但该病毒仍具有持续性威胁,或有进一步传播的可能,对于该疫病的防控和监测工作仍在继续。
- 于晓慧王静静李阳蒋文明庄青叶刘华雷
- 关键词：新城疫野鸟
- 高通量测序分析1株H7N9流感病毒的全基因被引量：3
- 2016年
- 为探索利用高通量测序开展H7N9亚型流感的监测、全基因分析和溯源研究的方法,使用Ion Torrent PGM测序仪对1株H7N9流感病毒进行了全基因测序,分析了此毒株的基因组特性和进化特征。结果显示,该毒株与2013年引起我国华东地区疫情的H7N9流感毒株的亲缘关系较近;纵观在不同年代和地点分离的H7N9流感病毒的6个内部基因,2013年疫情之前和之后的H7N9流感病毒存在明显差异。
- 王楷宬邱源庄青叶张笑春王通陈继明
- 关键词：高通量测序基因组
- 冠状病毒通用核酸检测方法
- 本发明属于生物技术领域，它确立了甲冠状病毒属、乙冠状病毒属、丙冠状病毒属、丁冠状病毒属等冠状病毒的通用核酸检测方法，含有三个技术要点：①确立了核酸检测所需要的引物序列；②确立了检测反应种类；③确立了检测反应体系和反应条件...
- 庄青叶王素春王楷宬刘朔陈继明
- 文献传递
- 甲型流感病毒快速分型与分析软件的开发与试用
- 2016年
- 甲型流感病毒危害动物和人类健康,其亚型多、突变率高、易发生重配,因此对其进行检测及流行毒株基因分析尤为重要。为解决传统方法进行大量甲型流感病毒序列分型和分析时存在的费工耗时、人为错误多等问题,结合实际工作需要,使用Perl语言建立了一套lunix系统下的甲型流感病毒快速分型与分析软件,并试用其对Gen Bank中所有宿主为鸭的甲型流感病毒进行了分析。结果显示,该软件可在较短的时间内完成大量序列的分析、分型和遗传进化研究,可用于甲型流感病毒的大规模流行病学调查分析。
- 王楷宬王通庄青叶邱源彭程王素春陈继明
- 关键词：甲型流感病毒基因分析遗传进化
- 我国9省份H7N9亚型禽流感和传染性支气管炎病原流行病学调查被引量：9
- 2014年
- 为及时了解目前H7N9亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)和传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)流行情况,2013年7月随机在全国9省份选取88个养禽场调查采样,每场采集粪便样品20份,采用RT-PCR方法进行检测,对阳性样品进行测序,并将获得的基因序列进行遗传进化分析。结果显示:88个养禽场H7N9亚型AIV检测均为阴性;IBV场群阳性率为68.18%(60/88),其中养鸡场的IBV阳性率为77.92%(60/77);遗传进化分析表明,检出的IBV毒株98.41%(124/126)属于第1.4分支,仅有福建和河南的2株属于疫苗毒株所在的第1.1分支。结果表明:H7N9亚型AIV在国内养禽场感染率低,而IBV在国内鸡群感染普遍。
- 刘沛增庄青叶刘朔蒋文明侯广宇李金平王素春费荣梅陈继明
- 关键词：传染性支气管炎流行病学调查遗传进化分析
- 高通量测序分析20株禽流感病毒全基因被引量：1
- 2016年
- 为探索使用高通量测序测定和分析禽流感病毒全基因的方法,使用Ion Torrent PGM测序仪对20株自华东地区分离的禽流感病毒进行全基因测序,分析该方法的优缺点,以及此20株病毒的基因组特性和进化特征。结果显示,应用Ion Torrent PGM测序仪能够测出全部20株病毒的全基因,确定其均为H9亚型h9.4.2.5分支的低致病性毒株,NA基因均为N2亚型,并分析了其6个内部基因分子演化关系。说明高通量测序可用于禽流感病毒全基因分析。
- 王楷宬庄青叶张笑春邱源王通侯广宇刘朔王素春
- 关键词：高通量测序禽流感全基因
- 禽源冠状病毒监测简报被引量：17
- 2020年
- 冠状病毒(Coronaviruses)在分类地位上属于套式病毒目(Nidovirales)冠状病毒科(Coronaviridae)正冠状病毒亚科(Orthocoronavirinae),包括α、β、γ和δ等4个属,可感染包括人类在内的多种动物。其中,α冠状病毒属主要感染人和猪、犬、猫、蝙蝠等,β冠状病毒属主要感染人和牛、马、猪、鼠、蝙蝠等哺乳动物,γ冠状病毒属主要感染鸡、火鸡、鸭、鹅等禽类,δ冠状病毒属主要感染野禽和猪。引起此次新型冠状病毒肺炎疫情的病毒(2019-nCoV)属于冠状病毒科β冠状病毒属。可感染禽类的冠状病毒主要来自γ冠状病毒属和δ冠状病毒属。鸡传染性支气管炎病毒(IBV)等家禽中分离到的冠状病毒均为γ冠状病毒属。家禽冠状病毒感染危害较大的是IBV。此外,鸭冠状病毒、鹅冠状病毒和鸽冠状病毒等在家禽中也有检出。一些野禽可感染δ属冠状病毒(如鹅口疮冠状病毒HKU12等)。2013年以来,中国动物卫生与流行病学中心对全国17省份共计5 249份家禽样品进行了禽源冠状病毒检测,共检测到IBV 446株,新型鸭冠状病毒和新型鸽冠状病毒等新型禽冠状病毒共277株,IBV、新型鸭冠状病毒、新型鸽冠状病毒的检出率分别为8.50%、2.04%、3.24%。对2019-nCoV与禽源冠状病毒的亲缘关系进行分析发现,2019-nCoV与已知的禽源冠状病毒核苷酸同源性较低;基于冠状病毒1ab基因保守区域的进化分析表明,2019-nCoV与禽源冠状病毒亲缘关系较远。基于上述分析,初步排除2019-nCoV来源于已知家禽冠状病毒的可能性。
- 王楷宬李阳庄青叶姜利建张富友姜楠刘华雷
- 关键词：新型冠状病毒
- 禽源冠状病毒感染情况概述被引量：8
- 2015年
- 以国内外对冠状病毒在禽类中的流行病学调查、监测和基因分析等研究报道为基础,从病毒分类学角度,对各"种"冠状病毒在禽类中的感染情况和引起的相关疾病进行简要概述。全球在禽类中发现的冠状病毒种类较多,至少涉及丙型和丁型冠状病毒属。其中,鸡传染性支气管炎病毒几乎在全球所有养鸡国家中存在,并呈地方性流行;火鸡冠状病毒、鸭冠状病毒、鹅冠状病毒、鸽冠状病毒也在禽类中被发现,部分病毒已在禽群中流行;其他丁型冠状病毒属病毒仅在少数野鸟中被发现。
- 庄青叶陈继明王楷宬
- 关键词：冠状病毒禽类多样性
