叶萍
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：教育部更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于生物信息学探究红细胞储存时间对子宫内膜癌的影响
- 2023年
- 目的miRNA主要通过基因沉默参与基因表达的转录后调控。本研究基于生物信息学分析推测,临床输血治疗中不同储存时间红细胞中含有的miRNA通过靶基因及其介导的分子信号通路在肿瘤进展和预后中发挥着潜在的影响。方法通过基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)以及癌症基因组图谱数据库(the cancer genome atlas,TCGA)筛选差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)和mRNAs(DEmRNAs)。通过对miRNA靶基因进行通路富集分析,并与DEmRNAs进行整合后,筛选出候选基因,建立风险因子预测模型,通过生存分析及ROC曲线评估模型可靠性。结果相较于GSE114990数据集中储存第1天,第7天和第28天数据分别鉴定出27和22个DEmiRNAs。经过筛选、预测以及整合分析,选择miR-381及其候选18个靶基因构建风险因子预测模型,揭示了不同风险组之间生存率的显著差异,并鉴定出miR-381-靶基因(NR 3C 1、TSHZ 3、LIPG和DLC 1)-肿瘤的潜在分子信号通路。结论本研究结果表明,在接受不同储存时间红细胞的子宫内膜癌患者中,基于“miR-381-靶基因-肿瘤”信号轴的的潜在分子机制可能会影响疾病的进展和预后。
- 郭彬瀚叶萍叶萍凤婧陈剑
- 关键词：MIRNAMRNA输血生物信息学
- 组蛋白的制备及其对巨噬细胞的影响
- 2013年
- 目的:用不同方法制备组蛋白并观察组蛋白在体外对巨噬细胞活力及细胞因子释放的影响。方法:用基因克隆的方法构建组蛋白H3和H4的原核表达质粒,分别表达和纯化带谷胱甘肽S-转移酶(GST)和组氨酸(His)标签的组蛋白(GST-H3、GST-H4、His-H3和His-H4);用高盐法提取真核细胞(RAW264.7和293F细胞)组蛋白;用上述不同来源组蛋白(7.5～50 mg/L)刺激巨噬细胞4 h,利用MTT和流式细胞术检测巨噬细胞活力;用液相芯片方法检测不同来源组蛋白对巨噬细胞释放在培养上清中的细胞因子白细胞介素6(IL-6)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)的浓度。结果:His-H3/H4和真核细胞来源的组蛋白明显降低细胞活性,诱导RAW264.7细胞发生晚期凋亡和坏死;不同来源组蛋白对RAW264.7细胞释放IL-6和TNF-α均有不同程度的促进作用。结论:原核表达His-H3、His-H4及真核细胞提取的组蛋白均可抑制巨噬细胞活力,诱导巨噬细胞发生晚期凋亡和坏死。组蛋白可能通过促进炎症细胞因子的释放参与了炎症反应过程。
- 付晓霞叶萍李雪钟玙沄崔航陈小欢蔡军伟姜勇刘靖华
- 关键词：组蛋白类巨噬细胞
