张俊威
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学理学政治法律更多>>
- DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率的影响(英文)被引量：1
- 2014年
- PCR是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。传统的PCR引物设计软件基本上忽略了DNA聚合酶与引物/模板的亲和性对PCR效率的影响。为揭示DNA聚合酶与引物/模板的相互作用是否对PCR的效率有影响,通过构建Taq DNA聚合酶与不同序列引物/模板DNA相互作用的三维结构模型,采用MM/GBSA方法计算复合物的结合自由能,以结合自由能为参数,为人血清白蛋白基因(Human Serum Albumin gene,HSA gene)和结核杆菌pyrF基因(Mycobacterium tuberculosis pyrF gene)设计了PCR引物。PCR实验结果表明,引物的PCR效率与结合自由能相关:引物与聚合酶的结合自由能越低,PCR实验的效率相对越高。这说明DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率有重要影响。因此,引物/模板DNA与聚合酶的结合自由能可以作为PCR引物设计的新参数。
- 杨奇奇张俊威朱坚刘建平黄强
- 关键词：PCRDNA聚合酶引物设计
- 论上市公司反收购行为的法律规制
- 本文试图通过对国外上市公司反收购法律制度进行介绍和比较，对我国确立更完善的反收购制度提供一条线索。论文除引言之外，共分四个部分。
第一部分主要分析了反收购的基本法理，首先介绍了收购与反收购的概念及分类，接着讨论反收...
- 张俊威
- 关键词：上市公司反收购制度公司法证券法
- 文献传递
- 保留型与反转型β-木糖苷酶活性位点的分子动力学模拟被引量：1
- 2015年
- 木聚糖是潜在的重要可再生能源,如何提高其降解效率已成为近年来的研究热点.β-木糖苷酶是木聚糖降解过程中的关键酶之一,按其水解机制可分为保留型与反转型酶.目前虽然对于这两种催化机制的研究不断深入,但很少有工作从溶液环境的角度出发探究它们的差异.本文采用分子动力学模拟方法,对4个典型的β-木糖苷酶进行了显式溶剂模拟研究,详细分析了酶的催化氨基酸间的距离和质子供体氨基酸p Ka值的动态变化.结果显示,反转型酶催化氨基酸间的距离约为0.8-1.0 nm,大于保留型的0.5-0.6 nm,与先前对糖苷酶晶体结构的统计分析结果一致.令人意外的是,保留型酶的质子供体通过与其附近组氨酸的相互作用,其p Ka在两个不同的高、低值之间交替变换,使保留型酶的双取代反应得以发生;而反转型酶的质子供体则由附近的天冬氨酸调节,其p Ka稳定在某个较高值,这可能有利于其在反应p H值下获得水溶液中的氢离子,进行反转型酶特有的单取代反应.因此,本工作加深了人们对β-木糖苷酶保留型与反转型水解机制的认识,并为后续酶的理性改造与高效利用提供具有指导价值的结构与机理信息.
- 张俊威周峻岗吕红黄强
- 关键词：Β-木糖苷酶P
