张利绒
- 作品数：53 被引量：76H指数：6
- 供职机构：内蒙古大学物理科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学农业科学更多>>
- 利用生物系统超弱光子辐射研究电场对作物种子的影响被引量：6
- 1998年
- 利用生物系统超弱光子辐射研究电场对作物种子的影响郭维生，张利绒，陈颖丽，赵国军，申燕伟，李凤敏，杨体强，冯璐（内蒙古大学物理学系，０１００２１，呼和浩特）ＴｈｅＳｔｕｄｙｏｆｔｈｅＥｆｅｃｔｓｏｆＥｌｅｃｔｒｉｃＦｉｅｌｄｏｎｔｈｅＣｒｏｐＳｅｅｄｓ...
- 郭维生张利绒陈颖丽赵国军申燕伟李凤敏杨体强冯璐
- 关键词：生物系统超弱光子辐射电场种子处理
- Establishment and Analysis of Avian Genome Evolutionary Tree
- Birds are the most species-rich class of tetrapod vertebrates[1].In all kinds of ecological environment,about ...
- 周勋罗辽复张利绒张永芬
- 果蝇基因组功能区域组蛋白修饰的协同模式
- 2015年
- 基于"组蛋白密码"假设,以黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)为研究对象,应用CoSBI(coherent and shifted bicluster identification)算法对黑腹果蝇Oregon-R细胞株培养14-16h的胚胎细胞,在全基因组范围、RNA聚合酶Ⅱ结合区域、绝缘子结合蛋白的结合区域的22种组蛋白修饰的分布情况进行CoSBI聚类分析,发现了果蝇基因组的功能区域所具有的一些"核心组蛋白修饰",说明果蝇基因组的组蛋白修饰具有成簇出现、相互协同的调控模式.另外,将黑腹果蝇处于14-16h胚胎细胞的基因分为表达与不表达两类,分析了两类基因所在区域组蛋白修饰的组合模式.
- 张砚张利绒曹艳妮
- 关键词：组蛋白修饰
- 基因功能区域的DNA甲基化分析
- 2016年
- 基于人类9种细胞系和15种组织的单碱基精度的甲基化数据,计算了基因范围六个功能区域(转录起始区域、第一外显子、中间外显子、最后外显子、内含子和转录终止区域)的甲基化水平,分析了各功能区域甲基化的分布.采用离散增量和欧式距离两类参数分别计算了细胞系和组织间的基因的甲基化差异,并对具有较高差异水平的前20个基因在六类细胞系的表达进行了分析.
- 艾雪张永芬刘俊杰张利绒
- 关键词：DNA甲基化基因
- 黄粉虫抗冻蛋白分子与冰水界面相互作用的分子动力学模拟被引量：1
- 2020年
- 抗冻蛋白(Antifreeze proteins,AFPs)可以非依数性的抑制冰晶生长和重结晶,能保护生活在寒冷环境中的生物避免冻伤。本文利用分子动力学模拟的研究方法,计算了黄粉虫抗冻蛋白(Tenebrio molitor antifreeze protein,TmAFP)分子与冰晶的基面、棱面和二级棱面冰-水体系的相互作用能,分析了黄粉虫抗冻蛋白分子在三种不同冰晶晶面的冰水体系中,蛋白质分子质心与冰晶晶面间距离和蛋白质分子整体与晶面间偏转角度随时间的变化。另外也分析了棱面冰-水体系中黄粉虫抗冻蛋白分子结构的均方根偏差和回旋半径的变化。研究表明,在同一温度条件下冰晶基面冰-水体系中水分子结冰速度最慢,冰晶二级棱面冰-水体系中水分子结冰速度最快;黄粉虫抗冻蛋白分子与冰晶棱面结合时抑制冰晶继续生长效果最明显,且吸附在冰晶表面蛋白质分子本身结构稳定,可以稳定的和冰晶表面结合进而抑制冰晶生长。
- 刘晓霞邢光耀张利绒刘俊杰
- 关键词：分子动力学模拟
- 基因组中基因间的关联被引量：5
- 2000年
- 根据基因中核苷关联短程为主性（Ｄ２ 为主）的概念，通过比较基因间的Ｄ２，定义基因组中的基因关联Ｆ，Ｆ取值的主要范围为０ 和１ 间，Ｆ～１ 表示基因的强关联，Ｆ～０ 表示关联是无规的．以酵母基因组为例，研究了酵母各条染色体上的基因关联，发现Ｆ的最可几值一般在０．８～０．９；证明了基因间存在较强的关联．比较编码区和非编码区，发现非编码区间的关联、非编码区和编码区的关联较编码区间的关联为弱，Ｆ值低１０％ 左右．
- 罗辽复张利绒陈颖丽贾孟文
- 关键词：基因关联基因组非编码区编码区
- 生物大分子与配体平衡反应调节生物活性的研究
- 该文提出单一配体以及多配体调节生物活性的新的别构酶模型,讨论了活性剂分子、抑制剂分子对别构酶和底物结合过程的影响,从理论上证明了MWC模型是本模型的一种特殊 情况,而且能够对别构调节中的协同效应和抗协同效应作出合理的解释...
- 张利绒
- 关键词：生物大分子Λ噬菌体
- 文献传递
- 第一类鱼抗冻蛋白与天然气水合物吸附结合过程中局部结构变化研究被引量：1
- 2023年
- 采用分子动力学模拟方法,计算分析第一类鱼抗冻蛋白(AFP-Ⅰ)在与天然气水合物吸附结合过程中局部结构的变化,并通过AFP-Ⅰ氨基酸突变体模拟结果来进一步说明AFP-Ⅰ抑制水合物生长的作用机理。结果表明,在AFP-Ⅰ与水合物结合过程中分子局部结构发生改变,水合物结合位点(Hydrate-binding site,HBS)处部分氨基酸残基的甲基发生迁移以适应水合物的笼状结构并取代甲烷分子与水合物表面结合。此外,氨基酸突变体模拟表明AFP-Ⅰ侧链上的甲基的缺失会减弱抗冻蛋白与水合物的结合能力。研究结果对研发可降解的天然产物类水合物抑制剂具有参考意义。
- 杜跃庭张楠张利绒刘俊杰
- 关键词：抗冻蛋白甲烷水合物分子动力学模拟
- 人类基因组中L1元件及其5′UTR的研究
- 2007年
- 讨论了L1在人类染色体中的分布密度与染色体长度以及L1的密度与基因密度之间的关系.发现在大多数染色体上L1的密度和染色体的长度表现为正相关,而L1的密度和染色体中基因的密度表现为负相关;对人类L1的5′UTR进行了详细的研究后,发现在L1元件的5′UTR部分含有许多转录因子结合位点.对基因的转录起始位点上游进行统计分析,发现其中含有大量的L1序列.通过对人类的EST数据库进行BLAST分析,新发现了51条和人类L1 5′UTR相似性较高的EST片断,根据它们分布的组织特异性,说明L1元件可能调控与发育过程有关的基因的表达;最后应用多样性增量的方法对人类和大鼠的L1 5′UTR进行了区分,得到了较好的预测结果,说明大部分L1的5′UTR的调控作用是人类特有的.
- 陈伟罗辽复张利绒
- 关键词：L1
- 组蛋白修饰在四个基因集合中的分布特征
- 2018年
- 基于人类全基因组Feb.2009(GRCh37/hg19版本)的基因注释数据,筛选得到12207个在TSS前后20kb内无重叠的基因.以人类GM12878和K562两种细胞系为研究对象,通过计算基因与转录因子CTCF的关联强度得分Aij以及TSS附近的DNA甲基化水平Mij,将12207个基因分为四个集合,分别统计了每个基因集合中TSS侧翼3800bp区域内的11种组蛋白修饰信号的分布情况.结果显示H2AFZ、H3K4me2、H3K4me3、H3K9ac、H3K27ac和H3K79me2这六种呈现明显的双峰分布,且在GM_III和K_III集合中信号最强,在GM_II和K_II集合中信号最弱,表明CTCF的结合与DNA甲基化可以影响组蛋白修饰的分布.
- 闫甜甜张利绒
- 关键词：DNA甲基化组蛋白修饰
