张有广
- 作品数：5 被引量：5H指数：1
- 供职机构：内蒙古大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学更多>>
- 改进的两种随机算法及在HIV-1蛋白酶与配体的刚性对接问题中的应用
- 随机算法以其不依赖于目标函数的性质、目标函数的导数、适用范围广等特点,近来受到普遍关注.但由于基计算速度慢、计算效率低的缺点,需对算法时一步改进.该文对两种随机算法进行了改进,并将改进的算法应用于分子刚性对接问题.归初通...
- 张有广
- 关键词：分子对接模拟退火算法
- 文献传递
- 改进的随机聚点搜索算法及其在分子对接问题中的应用被引量：4
- 2000年
- 提出改进的随机聚点搜索算法 ,设计了新的接受几率并采取了算法加速措施 ,对分子对接问题进行了计算检验 .结果表明 ,改进后的算法计算速度和搜索效率都明显优于 Stanton等人提出的方法 .
- 李炜疆张有广
- 关键词：分子对接
- 推广的模拟退火算法在分子对接中的应用被引量：1
- 2001年
- 把推广的模拟退火算法应用于两个分子的刚性对接的能量全局极小化 ,由于转动自由度和平动自由度的不同物理本质 ,我们对平动变量和转动变量采用了不同的访问分布 .改进的算法对多个对接模型的计算取得了较满意的结果 .
- 张有广李炜疆
- 关键词：模拟退火算法分子对接量子系统
- 分子对接的随机聚点搜索算法
- 2001年
- 随机聚点搜索算法是一种普遍的全局极小化方法 ,在目标函数自变量数目不很大时 ,计算效率较高。将该算法应用于分子对接 ,首先要通过模型分子对接 ,反复调整算法各控制参数使效率最高。对于HIV -1蛋白酶与苯甲醚配体的刚性对接 ,算法成功的找到了相互作用能量全局极小 ,与晶体结构的均方根偏差(RMSD)仅0.2 。这表明 ,该算法可高效率找到分子对接的能量最适构型。
- 张有广李炜疆
- 关键词：生物大分子
- 用推广的模拟退火算法研究HIV-1蛋白酶与苯甲醚配体的刚性对接
- 2001年
- 推广的模拟退火算法是一种普遍的全局极小化方法 ,在目标函数自变量数目不很大时 ,计算效率较高 .首先将该算法应用于假想分子模型间的刚性对接 ,然后将算法应用于 HIV-1蛋白酶与苯甲醚配体的刚性对接 .结果表明 ,该算法可以较高的效率查找到分子对接的最佳能量构型 ,对实际分子的计算结果与晶体结构非常接近 ,偏差为 0 .0 3nm
- 张有广李前忠
- 关键词：模拟退火算法分子间相互作用
