徐放
- 作品数:9 被引量:10H指数:2
- 供职机构:北京林业大学更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学建筑科学更多>>
- 一种优化的胡杨高效多重(12重)SSR体系(英文)被引量:1
- 2014年
- 微卫星多重PCR方法是一种非常经济并且高通量的基因分型技术。本研究在耐干旱、盐碱的胡杨(Populus euphratica)中开发出一套荧光标记的12重微卫星工作体系。该体系包含12条表达序列标签微卫星(EST-SSR)引物,其中3条设计于NCBI,另外9条设计于二代的转录组序列。利用该多重微卫星体系可在单一的PCR反应体系中成功扩增出12条表达序列标签的微卫星短序列片段,并在胡杨的3个自然居群96个个体中对该体系进行了验证,结果显示该体系具有很高的稳定性及多样性。同时,在杨属的5个派7个种中对其通用性进行了检验,显示这些引物具有很高的通用性,成功扩增率为79%。本研究中提供的12重多重PCR结合本实验已经公开发表的2个8重体系对揭示胡杨及其他杨树的进化历史具有重要的作用。最后,本研究认为引物的选择,扩增效率,哑等位基因的检测是多重体系开发过程中最为关键的步骤。
- 徐放赵舒邬荣领杜芳
- 关键词:多重PCR基因分型
- 胡杨SSR标记12重PCR反应体系优化研究
- 胡杨(Populus euphratica Oliv)是第三纪的孓遗植物,常生长在沙漠中,它耐寒、耐旱、耐盐碱、抗风沙,有很强的生命力,是重要的抗盐碱和干旱的树种之一。筛选和开发有效的SSR引物可为更深入的研究群体的遗传...
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- 泰山风景园林理法研究
- 风景园林在中国的历史长河中,与中华民族的精神、文化和社会不断交织融合,为后世积累了丰饶的财富。泰山是世界自然与文化双重遗产,国家AAAAA级旅游景区,中国非物质文化遗产。凭借其丰富的自然、人文条件,逐渐发展出了独特的泰山...
- 徐放
- 关键词:风景园林山水道教
- 胡杨无性系幼苗响应盐胁迫的miRNA表达差异研究被引量:2
- 2015年
- 植物mi RNA在调控基因表达、细胞周期、生物体发育、抗逆等方面起重要作用。为研究胡杨(Populus euphratica Oliv.)的耐盐机制,以1年生胡杨无性系幼苗为材料,构建具有空间代表性的盐胁迫胡杨c DNA文库,利用二代测序技术测定Na Cl胁迫下和正常培养条件下胡杨叶和根mi RNA表达情况。结果表明,不同的mi RNA之间表达量存在明显差异,表达丰度最高的mi RNA有mi R156、mi R157、mi R165、mi R166和mi R167等,合计占总表达量的90%以上。胡杨根部存在特异表达的mi RNA,在整个耐盐调控机制中发挥着生理调节、分子调控和信号传导等极为重要的作用。盐处理样品中发现大量响应盐胁迫的mi RNA,对这些转录因子进行靶基因预测和注释后,发现很多盐胁迫响应的mi RNA与NAC和SPL等重要转录因子家族相关,与前人的结论一致,另外还发现许多mi RNA的调控对象是ATP酶和激素响应因子。
- 司婧娜周韬徐放薄文浩邬荣领
- 关键词:高通量测序MIRNAS盐胁迫
- 一种应用8重PCR进行胡杨群体遗传分析和亲子鉴定的方法
- 本发明公开了一种应用8重PCR进行胡杨群体遗传分析和亲子鉴定的方法。在本发明的方法中,使用一组引物进行多重PCR反应,同时对8个位点进行扩增,所述引物由序列为SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:8的引物组成。本发...
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- 文献传递
- 培养胡杨离体组织的方法
- 本发明提供了培养胡杨离体组织的方法,该方法包括:将胡杨带芽茎段接种于启动培养基,进行启动培养,以便获得胡杨腋芽;将所述胡杨腋芽转接到继代培养基,进行继代培养,以便获得胡杨小苗;将所述胡杨小苗转接到生根培养基,进行生根培养...
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- 文献传递
- 基因流介导的种间渐渗与物种界定(英文)被引量:5
- 2012年
- 物种界定是生物学中最基本的问题之一。近年来随着分子生物学技术的进步如分子条形码的发展,物种界定也越来越引起人们的兴趣。界定一个物种或相似的一组物种时最重要的一个原则就是选择适合的分子标记。然而,植物中广泛存在的不完全谱系筛选与种间渐渗却常常会阻碍准确鉴定物种。最近,有关基因流介导的种间渗入和物种界定在理论和实验研究中都取得了重大进展。本文综述了基因流介导的物种形成;评价了种间渐渗与不完全谱系筛选的区别;最后总结出应该利用基因流速度较快的分子标记去鉴定物种。
- 杜芳徐放
- 关键词:分子标记DNA条形码基因流
- 基于基因调控网络的胡杨无性选育方法
- 本发明公开了一种基于基因调控网络的胡杨无性选育方法,所述方法包括:构建胡杨定位群体;根据胡杨定位群体进行外植体培养,并在培养的过程中获取胡杨生根能力的表型数据、转录组学数据、蛋白质组学数据以及代谢组学数据;分别根据胡杨定...
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- 基于基因与蛋白调控网络的林木育种方法和系统
- 本发明公开了一种基于基因与蛋白调控网络的林木育种方法和系统,其中,所述方法包括:根据表型的形成过程定位表达数量性状位点eQTL、蛋白质数量性状位点pQTL和代谢数量性状位点mQTL,并构建基因与蛋白调控网络系统的系统模型...
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- 文献传递