方永军 作品数:67 被引量:81 H指数:5 供职机构: 中国热带农业科学院橡胶研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 海南省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 经济管理 更多>>
橡胶树花青素合成调控因子HbAn1的克隆及其功能分析 被引量:2 2017年 橡胶树转基因过程筛选效率低阻碍了转基因研究快速发展。花青素累积产生的紫红色肉眼直接可辨,是一种简单、安全的可视化筛选标记。为利用橡胶树花青素作为转基因筛选标记,本文首先以R2R3-MYB保守结构域(R2、R3)为探针调取橡胶树R2R3-MYB,并与拟南芥等其他物种花青素合成相关的R2R3-MYB进行进化分析,结果显示橡胶树scaffold0374_923317和Scaffold0598_393375与其他物种已功能验证的花青素合成调控R2R3-MYB聚到同一亚类。随后从古铜期叶片中克隆到scaffold0374_923317基因,并将其命名为HbAn1。序列分析表明,HbAn1蛋白具有R2R3-MYB蛋白的典型结构:R2R3结构域及b HLH互作结构域。定量表达分析表明HbAn1在古铜期叶片及暗培养茎秆中高水平表达,在其他时期叶片及光照培养茎秆中表达水平很低,与不同组织花青素含量正相关。最后,在烟草中组成型过表达HbAn1,使烟草叶片、花瓣、花托、花丝等组织大量累积花青素,定量分析表明其激活了这些组织后期花青素合成酶基因Nt DFR,Nt LDOX,Nt UFGT。本文首次获得橡胶树花青素累积相关的正调控因子R2R3-MYB(HbAn1),这为花青素作为橡胶树转基因可视化筛选标记提供了基因资源。 黄天带 方永军 畅姣 陈涛 辛士超 Naychi Koko 黄华孙 华玉伟关键词:橡胶树 花青素 结构域 六点始叶螨内参基因筛选及其在超氧化物歧化酶基因EsSOD表达分析中的应用 2021年 为了筛选稳定内参基因分析六点始叶螨超氧化物歧化酶基因EsSOD的表达量,本研究采用geNorm、Bestkeeper、Normfinder和RefFinder软件分析6个候选内参基因actin、gapdh、rpl13、α-tub、β-tub和18sRNA在六点始叶螨幼螨、前若螨、后若螨和雌成螨中的表达稳定性。结果表明,根据geNorm软件分析得出6个候选内参引物的稳定性从大到小的排序为:actin>β-tub>rpl13>α-tub>gapdh>18sRNA;根据NormFinder软件分析得出的稳定性从大到小的排序为:rpl13>β-tub>actin>α-tub>18sRNA>gapdh;根据BestKeeper软件分析得出的稳定性从大到小的排序为:β-tub>rpl13>actin>gapdh>α-tub>18sRNA;最终根据RefFinder软件的综合分析结果,actin和β-tub是稳定性最佳的2个内参引物。分别以actin和β-tub为内参进行EsSOD基因表达量的RT-qPCR分析,结果表明,与取食感螨橡胶树种质‘IAN2904’后EsSOD表达量相比,不同龄期六点始叶螨取食抗螨橡胶树种质‘IRCI12’后EsSOD表达量均降低。本研究获得了可用于六点始叶螨EsSOD表达量分析的稳定内参引物,为橡胶树种质抗螨性分子机理研究奠定了理论基础。 梁晓 梁晓 陈青 方永军关键词:六点始叶螨 内参基因 基因表达 一种依赖焦磷酸的磷酸果糖激酶及其编码基因的应用 本发明公开了一种依赖焦磷酸的磷酸果糖激酶及其编码基因与应用。该蛋白是具有下述氨基酸残基序列之一的蛋白质:1)序列表中的SEQ ID№.1的氨基酸残基序列;2)将序列表中的SEQ ID№.1氨基酸残基序列经过一个或几个氨基... 龙翔宇 唐朝荣 戚继艳 阳江华 方永军 秦云霞文献传递 巴西橡胶树SnRK1家族基因的克隆与表达分析 2017年 蔗糖非酵解型蛋白激酶I(Sn RK1)是植物糖信号途径的关键因子,广泛参与植物生长发育。以蓖麻Sn RK1基因序列为探针,采用同源克隆的方法获得了橡胶树Sn RK1家族2个基因的全长c DNA,分别命名为Hb Sn RK1-1(KX237690.1)和Hb Sn RK1-2(KX237691.1)。2个Hb Sn RK1基因均编码含515个氨基酸且序列高度一致(96.5%)的蛋白质;2个基因均含10个外显子、9个内含子,且外显子大小相近,但基因长度差异明显。在6种橡胶树组织中,2个Hb Sn RK1基因均有表达,但Hb Sn RK1-1在胶乳(产胶细胞乳管的细胞质)中的表达量明显高于Hb Sn RK1-2;在叶片发育不同时期,Hb Sn RK1-1的表达变化不显著,而Hb Sn RK1-2的表达随叶片发育明显下降;在胶乳中,Hb Sn RK1-1的表达显著受乙烯和茉莉酸诱导、受2,4-D抑制,但Hb Sn RK1-2表达受激素处理的影响较小,推测Hb Sn RK1可能参与胶乳再生的激素调控。 王闯 周斌辉 方永军 唐朝荣关键词:橡胶树 克隆 生物信息学 橡胶树胶乳4个HbRab基因的克隆和表达分析 被引量:1 2013年 克隆了橡胶树胶乳中表达的4个Rab基因的全长cDNA,命名为HbRab5-HbRab8。它们编码22~24kDa的蛋白,均具有小G蛋白家族共有的GTP/GDP结合保守结构域,分别属于植物Rab家族的F、D、A和B亚家族成员。组织表达分析显示,除HbRab69外,其他3个HbRab6基因均在胶乳中表达丰度最高。在胶乳中,伤害处理显著下调HbRab6表达而上调HbRab7表达:乙烯和水杨酸处理下调HbRab6和HbRab8的表达,甲基茉莉酸处理上调HbRab5、HbRab7、HbRab8的表达,细胞分裂素上调HbRab5的表达。本文结果为橡胶树胶乳再生相关Rab基因的筛选与功能阐述奠定了基础。 唐朝荣 秦云霞 黄亚成 方永军关键词:橡胶树 RAB 基因克隆 HbCS4基因在提高原核表达菌生长速率、研究橡胶树产胶能力中的应用 本发明提供了HbCS4基因在提高原核表达菌生长速率、研究橡胶树产胶能力中的应用、以及携带HbCS4基因的重组体和重组大肠杆菌。HbCS4基因转入原核表达菌株后,能够显著提高菌株在正常及重金属胁迫下培养条件下的生长速率,在... 龙翔宇 方永军 唐朝荣 戚继艳 黄亚成 何斌文献传递 橡胶树果糖-1,6-双磷酸酯酶基因的克隆及表达特性分析 被引量:2 2013年 果糖-1,6-双磷酸酯酶(FBPase)是糖异生途径中的关键酶,在糖代谢中起重要作用。本研究首次从橡胶树中克隆并获得胞质型HbFBPase基因,其全长cDNA序列1541 bp,包含一个1017 bp的开放阅读框,编码一个由338个氨基酸残基组成的蛋白质。氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的FBPase活性位点、腺嘌呤核糖核苷酸(AMP)结合位点及金属离子结合位点。生物信息学分析显示,HbFBPase蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域,且为亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用。实时荧光定量PCR分析表明,HbFBPase基因在叶中高表达,胶乳及种子次之。进一步分析HbFBPase基因在非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与了橡胶烃的生物合成调控。此外,HbFBPase基因表达受多种植物激素如乙烯(ET)、脱落酸(ABA)、茉莉酸(JA)、植物生长素(2,4-D)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控。本研究初步揭示HbFBPase是橡胶树胶乳糖异生作用的关键酶,是胶乳糖酵解及橡胶合成的负调控因子,为探讨胶乳糖异生与橡胶烃合成之间的关系提供理论基础,有助于进一步了解胶乳糖代谢的调控机理。 龙翔宇 曹冰 梁启福 方永军 戚继艳 唐朝荣关键词:橡胶树 基因克隆 生物信息学分析 一株哈茨木霉菌株及其应用 本发明公开了一株哈茨木霉及其应用。该木霉菌株为哈茨木霉(Trichoderma harzianum)Hb13‑3‑2 CGMCC No.13163。该菌株及其代谢产物具有广谱抑制病原真菌活性,对峙生长实验表明,该木霉菌株... 秦云霞 阳江华 唐朝荣 肖小虎 龙翔宇 方永军 戚继艳文献传递 橡胶树‘热研7-33-97’和‘PR107’胶乳和树皮中蔗糖代谢相关的酶活与基因表达研究 2021年 对2个产胶水平差异明显的橡胶树品种(‘热研7-33-97’和‘PR107’)产胶旺季时2个与产胶直接相关的碳库(胶乳和茎干树皮)中蔗糖代谢相关的酶活、基因表达以及胶乳生理参数、树皮非结构性碳水化合物(NSC)含量进行了比较研究。结果表明:‘PR107’干胶产量的季节性变动明显大于‘热研7-33-97’,但均在9月底出现一个产胶高峰;2个品种胶乳的总固形物、无机磷和蔗糖含量差异不明显,但‘热研7-33-97’的干胶含量显著高于‘PR107’;树皮NSC的主要成分为可溶性糖(占80%以上),但品种间的NSC及其相关组分(淀粉、可溶性糖和还原性糖)的差异均不显著;胶乳中,蔗糖合成酶(Sus)主要催化蔗糖合成,品种间的中碱性转化酶(NIN)和Sus酶活差异均不显著;树皮中,‘热研7-33-97’的NIN酶活显著大于‘PR107’,而其他蔗糖代谢相关酶活品种间的差异不显著;在胶乳中,HbSWEET10a基因的表达量高,并且‘热研7-33-97’>‘PR107’,还是唯一在品种间表达显著差异的蔗糖代谢相关基因;在树皮中,‘PR107’的HbSus3和细胞壁转化酶基因HbCIN2的表达显著高于‘热研7-33-97’,HbSUT5显著低于‘热研7-33-97’,而其他4个蔗糖代谢相关基因的表达在品种间差异不显著。本研究结果为深入探究蔗糖代谢调控与胶乳再生的互作奠定了基础。 刘晓东 王艺玮 肖小虎 朱芳玉 刘星 莫春演 方永军 唐朝荣关键词:橡胶树 蔗糖代谢 酶活 HbCS3基因在提高原核表达菌生长速率、研究橡胶树抗逆境胁迫和产胶能力中的应用 本发明提供了HbCS3基因在提高原核表达菌生长速率、研究橡胶树抗逆境胁迫和产胶能力中的应用、以及携带HbCS3基因的重组体和重组大肠杆菌。HbCS3基因转入原核表达菌株后,能够显著提高菌株在正常及重金属胁迫下培养条件下的... 龙翔宇 方永军 唐朝荣 戚继艳 黄亚成 何斌文献传递